Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVH5

Protein Details
Accession C4QVH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-398EASSSEKERKKWKHYECDTCKDAHydrophilic
413-440HLASRRHRSAMNKLKKRQEREHYITGKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-428LKK
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 10.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ppa:PAS_chr1-3_0185  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MLRLWKKMTKKSIINIIGTTGVGKSQLSIELAKRFNGEVINTDSMQMYKGLDIITNKHPIKEREGIPHHVMNHVDWKDEYFLHTFEKEALKAIEDIHGRGKIPILVGGTHYYLQSILFHNKVIKTGGSAKDEETSSTLTPHERQMIEGPPEELIGHLKELDPIVAEKFHPNDHRRIRRALEIYLLTKKPASAYYDRQREEERQQSSLRFNTLNVWLYADQTVLDARLDSRVDTMLTEGGLDEIQQLYGYYKSLDSQPNLQHGVWQVIGFKEFITWLNEPSEESLQAAVEQMKARTRQYARRQVKWIKKVLANELLKEKAHGYPNGGQIYILEATNLNQWKENVTSRALEITDAFLEFRHIEQPFASGHLIDLLPQEASSSEKERKKWKHYECDTCKDADGNKAIFVGDQYEIHLASRRHRSAMNKLKKRQEREHYITGKDAMKKAKCDKQESSQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.6
3 0.52
4 0.44
5 0.36
6 0.3
7 0.19
8 0.14
9 0.11
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.12
14 0.13
15 0.17
16 0.2
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.3
21 0.28
22 0.29
23 0.28
24 0.25
25 0.21
26 0.26
27 0.28
28 0.26
29 0.27
30 0.25
31 0.22
32 0.22
33 0.18
34 0.13
35 0.09
36 0.11
37 0.1
38 0.12
39 0.14
40 0.18
41 0.23
42 0.32
43 0.32
44 0.35
45 0.41
46 0.42
47 0.47
48 0.5
49 0.49
50 0.5
51 0.55
52 0.57
53 0.56
54 0.57
55 0.51
56 0.46
57 0.42
58 0.34
59 0.37
60 0.32
61 0.28
62 0.24
63 0.25
64 0.24
65 0.24
66 0.25
67 0.18
68 0.18
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.2
73 0.23
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.2
81 0.18
82 0.19
83 0.21
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.21
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.14
92 0.13
93 0.14
94 0.15
95 0.16
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.22
110 0.18
111 0.18
112 0.24
113 0.28
114 0.28
115 0.28
116 0.27
117 0.29
118 0.29
119 0.26
120 0.21
121 0.18
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.16
127 0.18
128 0.22
129 0.19
130 0.21
131 0.23
132 0.28
133 0.28
134 0.27
135 0.25
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.14
140 0.11
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.16
156 0.24
157 0.26
158 0.35
159 0.44
160 0.53
161 0.54
162 0.58
163 0.56
164 0.56
165 0.56
166 0.47
167 0.42
168 0.35
169 0.34
170 0.34
171 0.32
172 0.25
173 0.22
174 0.21
175 0.18
176 0.18
177 0.2
178 0.19
179 0.27
180 0.36
181 0.44
182 0.45
183 0.45
184 0.46
185 0.46
186 0.47
187 0.46
188 0.4
189 0.35
190 0.36
191 0.37
192 0.37
193 0.34
194 0.3
195 0.23
196 0.21
197 0.2
198 0.22
199 0.2
200 0.16
201 0.17
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.12
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.11
240 0.15
241 0.15
242 0.21
243 0.23
244 0.26
245 0.29
246 0.28
247 0.25
248 0.23
249 0.23
250 0.18
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.07
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.14
279 0.16
280 0.17
281 0.24
282 0.28
283 0.36
284 0.45
285 0.55
286 0.58
287 0.63
288 0.72
289 0.73
290 0.78
291 0.77
292 0.74
293 0.69
294 0.66
295 0.63
296 0.6
297 0.6
298 0.51
299 0.46
300 0.43
301 0.39
302 0.34
303 0.32
304 0.27
305 0.23
306 0.26
307 0.24
308 0.25
309 0.28
310 0.34
311 0.34
312 0.33
313 0.27
314 0.23
315 0.25
316 0.21
317 0.15
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.15
322 0.17
323 0.15
324 0.16
325 0.16
326 0.18
327 0.22
328 0.25
329 0.22
330 0.22
331 0.23
332 0.22
333 0.24
334 0.22
335 0.19
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.08
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.15
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.17
350 0.15
351 0.17
352 0.17
353 0.11
354 0.11
355 0.13
356 0.12
357 0.11
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.1
365 0.12
366 0.17
367 0.25
368 0.3
369 0.36
370 0.46
371 0.56
372 0.63
373 0.71
374 0.75
375 0.78
376 0.82
377 0.88
378 0.86
379 0.85
380 0.78
381 0.69
382 0.6
383 0.53
384 0.46
385 0.42
386 0.39
387 0.32
388 0.3
389 0.28
390 0.27
391 0.23
392 0.21
393 0.17
394 0.12
395 0.12
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.2
401 0.18
402 0.25
403 0.35
404 0.35
405 0.37
406 0.42
407 0.48
408 0.53
409 0.63
410 0.66
411 0.66
412 0.73
413 0.81
414 0.85
415 0.87
416 0.87
417 0.86
418 0.86
419 0.84
420 0.86
421 0.81
422 0.75
423 0.69
424 0.64
425 0.6
426 0.55
427 0.52
428 0.51
429 0.51
430 0.56
431 0.62
432 0.65
433 0.67
434 0.69
435 0.7