FuNGI

A0A1X0SCT8

Protein Details

Accession

A0A1X0SCT8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
566-590	KENSNSRGSSRRRRYNRMRDRLQGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 5, pero 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028802 SMG8 IPR019354 SMG8/SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MYTHLAQFQSCCWKYWDISVPYALFEKKEFDRISPSFLGWWGPAKGVPMLVFVASDVLLPEATPATIKKMQEALQQRIKNIFRATHLIPSRQEPGNSSHAPVDVKSLFLLPSTSQPIIHIIPSIPKPSVETEYTLDEPLPISSYLEQLSVSEPGNLNDEYGDKLLRNFVTIWTKTAVNRHPLHRKMNDVKYVPLPTPIQFASSVVPLLHFLFNQPMRENNENFRDIIIAHYSSTKGMIQQIEVILRKKIKDNIEIERVFSKNYCYNVMQHCQEAYLQDSPPFYPEKYHAWKRDHALRLYASLARGPCKEEYASRLERECDLVWKENRQSCEHLSLTGRSCRLKTGHESIPSQSQKRDDRAIMTDSGKHSSGVTFFHACNCGRTQKLRDDPFDIMDANVKFYQRFTCCLGKDRAALDIKASVFGDNQHLELRYDDVPADDSALLLLGPASVYKNNVGLDNVEGFLNNTNYLIPWSITTVNDLKLYQQEQVEKKAKEAITTVLQPVPNQEEWPVLGKAPAAASKTTKVIPAPTAASLEAFPALGTNPPPVSTPAITPEIPVKQLFEAKENSNSRGSSRRRRYNRMRDRLQGLIRGYIGAEYECAQGHRFLSCGEGRVCKIGHAGHPKEHGNYFVHQDLNVFILCPCCYTPSGNGSNAAISSSSEVTAQLMRLYVVTPDEDITISIEPKIKINIPGSDKSIHVDLGIRDPLYLGPGGAYVLRLPFIYRDENGLPIPIETDIERRMASAVLQKDYIKFHYKKASKWALSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.42
3	0.47
4	0.41
5	0.43
6	0.46
7	0.42
8	0.39
9	0.42
10	0.35
11	0.27
12	0.23
13	0.26
14	0.24
15	0.32
16	0.32
17	0.3
18	0.38
19	0.38
20	0.44
21	0.4
22	0.38
23	0.31
24	0.31
25	0.3
26	0.23
27	0.26
28	0.2
29	0.19
30	0.19
31	0.2
32	0.2
33	0.2
34	0.19
35	0.16
36	0.15
37	0.14
38	0.13
39	0.11
40	0.11
41	0.09
42	0.08
43	0.07
44	0.07
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.08
51	0.09
52	0.15
53	0.2
54	0.21
55	0.24
56	0.28
57	0.31
58	0.38
59	0.46
60	0.48
61	0.52
62	0.54
63	0.53
64	0.57
65	0.56
66	0.53
67	0.5
68	0.44
69	0.39
70	0.42
71	0.42
72	0.43
73	0.45
74	0.44
75	0.42
76	0.43
77	0.45
78	0.42
79	0.41
80	0.34
81	0.35
82	0.39
83	0.38
84	0.35
85	0.31
86	0.3
87	0.3
88	0.28
89	0.29
90	0.21
91	0.2
92	0.19
93	0.18
94	0.16
95	0.15
96	0.16
97	0.11
98	0.15
99	0.2
100	0.2
101	0.19
102	0.2
103	0.23
104	0.23
105	0.22
106	0.19
107	0.14
108	0.2
109	0.23
110	0.25
111	0.22
112	0.21
113	0.23
114	0.25
115	0.29
116	0.25
117	0.25
118	0.24
119	0.28
120	0.29
121	0.27
122	0.23
123	0.19
124	0.17
125	0.15
126	0.14
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.12
131	0.13
132	0.12
133	0.12
134	0.11
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.13
139	0.13
140	0.14
141	0.17
142	0.16
143	0.15
144	0.13
145	0.14
146	0.12
147	0.13
148	0.13
149	0.1
150	0.11
151	0.15
152	0.15
153	0.16
154	0.14
155	0.19
156	0.26
157	0.27
158	0.28
159	0.26
160	0.28
161	0.28
162	0.35
163	0.35
164	0.35
165	0.39
166	0.45
167	0.53
168	0.58
169	0.65
170	0.61
171	0.65
172	0.66
173	0.69
174	0.69
175	0.61
176	0.57
177	0.54
178	0.53
179	0.44
180	0.39
181	0.33
182	0.26
183	0.28
184	0.24
185	0.21
186	0.18
187	0.18
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.11
195	0.11
196	0.1
197	0.1
198	0.16
199	0.19
200	0.21
201	0.21
202	0.23
203	0.29
204	0.34
205	0.36
206	0.35
207	0.38
208	0.37
209	0.37
210	0.32
211	0.26
212	0.21
213	0.21
214	0.17
215	0.12
216	0.11
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.13
221	0.12
222	0.1
223	0.14
224	0.14
225	0.13
226	0.15
227	0.16
228	0.18
229	0.2
230	0.2
231	0.2
232	0.21
233	0.22
234	0.25
235	0.3
236	0.31
237	0.36
238	0.4
239	0.43
240	0.49
241	0.48
242	0.45
243	0.43
244	0.38
245	0.32
246	0.27
247	0.25
248	0.2
249	0.22
250	0.24
251	0.21
252	0.26
253	0.3
254	0.35
255	0.32
256	0.29
257	0.27
258	0.24
259	0.23
260	0.19
261	0.17
262	0.15
263	0.14
264	0.14
265	0.15
266	0.15
267	0.16
268	0.17
269	0.14
270	0.14
271	0.16
272	0.22
273	0.3
274	0.38
275	0.44
276	0.46
277	0.51
278	0.54
279	0.6
280	0.58
281	0.51
282	0.47
283	0.4
284	0.37
285	0.34
286	0.3
287	0.21
288	0.18
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.17
293	0.16
294	0.16
295	0.17
296	0.16
297	0.19
298	0.24
299	0.26
300	0.25
301	0.26
302	0.25
303	0.25
304	0.26
305	0.23
306	0.2
307	0.2
308	0.24
309	0.25
310	0.28
311	0.33
312	0.33
313	0.36
314	0.34
315	0.35
316	0.31
317	0.35
318	0.31
319	0.27
320	0.26
321	0.26
322	0.26
323	0.26
324	0.26
325	0.21
326	0.21
327	0.23
328	0.23
329	0.23
330	0.25
331	0.28
332	0.31
333	0.33
334	0.35
335	0.33
336	0.4
337	0.4
338	0.37
339	0.32
340	0.34
341	0.34
342	0.36
343	0.38
344	0.3
345	0.29
346	0.31
347	0.31
348	0.27
349	0.24
350	0.23
351	0.2
352	0.21
353	0.19
354	0.16
355	0.14
356	0.12
357	0.12
358	0.1
359	0.12
360	0.12
361	0.11
362	0.13
363	0.16
364	0.15
365	0.16
366	0.17
367	0.18
368	0.18
369	0.21
370	0.24
371	0.28
372	0.37
373	0.39
374	0.39
375	0.39
376	0.39
377	0.36
378	0.33
379	0.25
380	0.17
381	0.17
382	0.15
383	0.14
384	0.14
385	0.13
386	0.12
387	0.13
388	0.18
389	0.15
390	0.17
391	0.19
392	0.24
393	0.25
394	0.3
395	0.32
396	0.29
397	0.3
398	0.28
399	0.29
400	0.25
401	0.24
402	0.19
403	0.19
404	0.17
405	0.16
406	0.15
407	0.11
408	0.09
409	0.1
410	0.13
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.12
417	0.14
418	0.11
419	0.11
420	0.1
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.11
425	0.08
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.02
433	0.02
434	0.03
435	0.04
436	0.04
437	0.06
438	0.06
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.09
451	0.09
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.06
459	0.06
460	0.08
461	0.1
462	0.1
463	0.13
464	0.13
465	0.14
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.16
470	0.17
471	0.17
472	0.18
473	0.23
474	0.24
475	0.32
476	0.39
477	0.35
478	0.35
479	0.39
480	0.37
481	0.32
482	0.31
483	0.25
484	0.21
485	0.23
486	0.23
487	0.2
488	0.2
489	0.19
490	0.2
491	0.21
492	0.18
493	0.17
494	0.16
495	0.14
496	0.14
497	0.18
498	0.16
499	0.12
500	0.12
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.13
505	0.11
506	0.12
507	0.14
508	0.15
509	0.17
510	0.17
511	0.18
512	0.17
513	0.18
514	0.17
515	0.18
516	0.18
517	0.17
518	0.17
519	0.15
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.09
524	0.07
525	0.06
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.11
534	0.13
535	0.16
536	0.16
537	0.16
538	0.18
539	0.21
540	0.2
541	0.2
542	0.23
543	0.21
544	0.22
545	0.21
546	0.18
547	0.17
548	0.21
549	0.22
550	0.21
551	0.23
552	0.24
553	0.33
554	0.34
555	0.35
556	0.34
557	0.34
558	0.32
559	0.38
560	0.44
561	0.46
562	0.54
563	0.61
564	0.66
565	0.76
566	0.85
567	0.87
568	0.9
569	0.89
570	0.86
571	0.83
572	0.79
573	0.77
574	0.69
575	0.63
576	0.53
577	0.45
578	0.38
579	0.31
580	0.26
581	0.18
582	0.16
583	0.1
584	0.09
585	0.08
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.11
590	0.12
591	0.13
592	0.12
593	0.11
594	0.1
595	0.15
596	0.15
597	0.18
598	0.19
599	0.22
600	0.23
601	0.26
602	0.26
603	0.22
604	0.24
605	0.23
606	0.28
607	0.34
608	0.37
609	0.38
610	0.43
611	0.45
612	0.45
613	0.43
614	0.39
615	0.32
616	0.31
617	0.31
618	0.29
619	0.28
620	0.24
621	0.24
622	0.2
623	0.19
624	0.17
625	0.13
626	0.09
627	0.11
628	0.11
629	0.12
630	0.12
631	0.13
632	0.14
633	0.17
634	0.2
635	0.26
636	0.3
637	0.3
638	0.31
639	0.29
640	0.29
641	0.26
642	0.22
643	0.15
644	0.11
645	0.12
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.12
652	0.12
653	0.1
654	0.1
655	0.09
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.12
667	0.12
668	0.12
669	0.14
670	0.17
671	0.17
672	0.19
673	0.23
674	0.24
675	0.28
676	0.32
677	0.37
678	0.38
679	0.41
680	0.43
681	0.41
682	0.39
683	0.35
684	0.33
685	0.25
686	0.2
687	0.21
688	0.18
689	0.22
690	0.25
691	0.22
692	0.2
693	0.21
694	0.2
695	0.18
696	0.17
697	0.11
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.09
703	0.08
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.1
708	0.12
709	0.16
710	0.2
711	0.19
712	0.25
713	0.26
714	0.29
715	0.28
716	0.28
717	0.24
718	0.2
719	0.2
720	0.14
721	0.14
722	0.13
723	0.16
724	0.16
725	0.18
726	0.17
727	0.17
728	0.17
729	0.16
730	0.18
731	0.21
732	0.24
733	0.25
734	0.28
735	0.29
736	0.31
737	0.35
738	0.38
739	0.4
740	0.38
741	0.42
742	0.51
743	0.55
744	0.57
745	0.64
746	0.69

A0A1X0SCT8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer