Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0S793

Protein Details
Accession A0A1X0S793    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-59GHWTYQCKKDRSYRSRPSRTQQLKKPLKLYQHydrophilic
67-96QDKKGLADKILKKKKKERRRRGSYSSSSESBasic
174-206SSSSASRSPSRNRRRRRSSSPYPQRRRRSVSRSHydrophilic
264-301MDRSVSRSPRKRSYERSLSKRGRSKRSRSSSTSPERSYHydrophilic
306-326SRSSYNSRSRSNSRSRRYSRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-88KKGLADKILKKKKKERRRRG
181-302SPSRNRRRRRSSSPYPQRRRRSVSRSPSSASRNSSRSTSSNSRGRSISRGRSVDRRRLRSHSRDRSLSSERSLVRDTGIRRRNMDRSVSRSPRKRSYERSLSKRGRSKRSRSSSTSPERSYK
314-326SRSNSRSRRYSRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
Amino Acid Sequences MWRTGPRYQGLGSQPSSASVQCQKCLERGHWTYQCKKDRSYRSRPSRTQQLKKPLKLYQPELPKELQDKKGLADKILKKKKKERRRRGSYSSSSESSSDSSSESDSGSESDSGSSTVSTSSSYSSSSSSRSRSSSSGSESDSGSSTVSTSSSYSSGSSSRSRSSSSDSRSSLSSSSSASRSPSRNRRRRRSSSPYPQRRRRSVSRSPSSASRNSSRSTSSNSRGRSISRGRSVDRRRLRSHSRDRSLSSERSLVRDTGIRRRNMDRSVSRSPRKRSYERSLSKRGRSKRSRSSSTSPERSYKRDISRSSYNSRSRSNSRSRRYSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.34
4 0.27
5 0.27
6 0.29
7 0.3
8 0.31
9 0.36
10 0.35
11 0.39
12 0.44
13 0.42
14 0.43
15 0.45
16 0.51
17 0.54
18 0.6
19 0.64
20 0.69
21 0.75
22 0.69
23 0.71
24 0.71
25 0.74
26 0.77
27 0.78
28 0.79
29 0.81
30 0.87
31 0.88
32 0.87
33 0.87
34 0.88
35 0.87
36 0.85
37 0.85
38 0.85
39 0.83
40 0.82
41 0.78
42 0.76
43 0.73
44 0.69
45 0.66
46 0.66
47 0.63
48 0.59
49 0.53
50 0.48
51 0.48
52 0.5
53 0.47
54 0.41
55 0.39
56 0.38
57 0.44
58 0.41
59 0.36
60 0.38
61 0.42
62 0.49
63 0.58
64 0.62
65 0.63
66 0.73
67 0.81
68 0.83
69 0.85
70 0.86
71 0.86
72 0.91
73 0.92
74 0.91
75 0.9
76 0.87
77 0.84
78 0.78
79 0.68
80 0.59
81 0.5
82 0.42
83 0.33
84 0.25
85 0.18
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.15
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.22
118 0.24
119 0.24
120 0.27
121 0.26
122 0.26
123 0.26
124 0.25
125 0.24
126 0.22
127 0.21
128 0.18
129 0.15
130 0.11
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.12
144 0.14
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.19
149 0.19
150 0.25
151 0.28
152 0.3
153 0.33
154 0.32
155 0.32
156 0.31
157 0.31
158 0.25
159 0.2
160 0.16
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.18
167 0.22
168 0.3
169 0.39
170 0.48
171 0.57
172 0.67
173 0.75
174 0.81
175 0.85
176 0.87
177 0.86
178 0.86
179 0.88
180 0.89
181 0.89
182 0.89
183 0.9
184 0.89
185 0.87
186 0.84
187 0.82
188 0.79
189 0.79
190 0.79
191 0.76
192 0.71
193 0.66
194 0.65
195 0.6
196 0.56
197 0.51
198 0.45
199 0.41
200 0.38
201 0.38
202 0.35
203 0.32
204 0.35
205 0.37
206 0.39
207 0.43
208 0.43
209 0.44
210 0.43
211 0.43
212 0.43
213 0.44
214 0.44
215 0.45
216 0.47
217 0.48
218 0.56
219 0.61
220 0.64
221 0.66
222 0.66
223 0.63
224 0.68
225 0.74
226 0.74
227 0.78
228 0.79
229 0.77
230 0.74
231 0.72
232 0.71
233 0.68
234 0.61
235 0.53
236 0.48
237 0.42
238 0.41
239 0.39
240 0.32
241 0.27
242 0.29
243 0.3
244 0.33
245 0.39
246 0.39
247 0.41
248 0.47
249 0.52
250 0.53
251 0.58
252 0.55
253 0.56
254 0.63
255 0.68
256 0.71
257 0.73
258 0.76
259 0.77
260 0.79
261 0.8
262 0.78
263 0.79
264 0.81
265 0.82
266 0.83
267 0.84
268 0.83
269 0.84
270 0.84
271 0.83
272 0.83
273 0.83
274 0.85
275 0.85
276 0.86
277 0.85
278 0.84
279 0.83
280 0.82
281 0.83
282 0.82
283 0.76
284 0.75
285 0.72
286 0.69
287 0.69
288 0.68
289 0.67
290 0.67
291 0.67
292 0.65
293 0.7
294 0.71
295 0.71
296 0.72
297 0.7
298 0.67
299 0.69
300 0.7
301 0.67
302 0.7
303 0.73
304 0.74
305 0.75
306 0.8