Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0RND5

Protein Details
Accession A0A1X0RND5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-210QEQRKQTKEMKEQEHKRKKGLHRTHQKQKQKEKQASFKKVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-204KEQEHKRKKGLHRTHQKQKQKEKQA
257-271SSRGRAPRPARRGKS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR008669  LSM_interact  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05391  Lsm_interact  
Amino Acid Sequences MFDKALSFQPLLASVEDLVAVLLAKCDYYRRRIDWDDLDDNAVMDLRVAFEESLAYVDEEKFYAHISARLGDVDKARELWESVVVKRGRDTEAWIQYINFERNLGNYHKCESLFKKAIVKRIDNPTRLIDVWNDMEHEFGTLTTHEDALVRIHQKTKALANEWQAQYAGQEQRKQTKEMKEQEHKRKKGLHRTHQKQKQKEKQASFKKVEGQKELLGIEEDNDQVQTEASSSLKRKASTEDIDQETVKRTKIQPQGSSRGRAPRPARRGKSIALGQSRMSRDHKPAQETETPATVAAEPKSNDDFRAMLLGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.08
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.14
14 0.18
15 0.25
16 0.33
17 0.36
18 0.44
19 0.48
20 0.55
21 0.56
22 0.59
23 0.55
24 0.49
25 0.47
26 0.39
27 0.34
28 0.27
29 0.2
30 0.11
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.14
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.28
75 0.24
76 0.22
77 0.27
78 0.28
79 0.32
80 0.33
81 0.32
82 0.29
83 0.29
84 0.33
85 0.29
86 0.2
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.19
91 0.21
92 0.2
93 0.2
94 0.22
95 0.24
96 0.24
97 0.28
98 0.28
99 0.34
100 0.34
101 0.34
102 0.4
103 0.41
104 0.48
105 0.48
106 0.47
107 0.44
108 0.51
109 0.56
110 0.49
111 0.49
112 0.44
113 0.41
114 0.38
115 0.33
116 0.23
117 0.19
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.2
144 0.2
145 0.21
146 0.24
147 0.26
148 0.32
149 0.31
150 0.29
151 0.25
152 0.22
153 0.2
154 0.21
155 0.22
156 0.18
157 0.22
158 0.23
159 0.32
160 0.34
161 0.37
162 0.38
163 0.42
164 0.48
165 0.53
166 0.6
167 0.62
168 0.7
169 0.78
170 0.82
171 0.75
172 0.72
173 0.72
174 0.72
175 0.73
176 0.74
177 0.73
178 0.74
179 0.81
180 0.86
181 0.87
182 0.88
183 0.86
184 0.87
185 0.87
186 0.86
187 0.86
188 0.83
189 0.84
190 0.85
191 0.84
192 0.78
193 0.7
194 0.68
195 0.65
196 0.61
197 0.55
198 0.48
199 0.4
200 0.38
201 0.34
202 0.27
203 0.21
204 0.16
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.12
218 0.14
219 0.2
220 0.24
221 0.25
222 0.25
223 0.3
224 0.36
225 0.36
226 0.41
227 0.42
228 0.42
229 0.43
230 0.42
231 0.38
232 0.36
233 0.34
234 0.28
235 0.26
236 0.25
237 0.32
238 0.41
239 0.48
240 0.5
241 0.56
242 0.65
243 0.65
244 0.68
245 0.63
246 0.64
247 0.59
248 0.59
249 0.6
250 0.6
251 0.65
252 0.71
253 0.72
254 0.7
255 0.73
256 0.66
257 0.67
258 0.63
259 0.61
260 0.56
261 0.52
262 0.47
263 0.49
264 0.48
265 0.45
266 0.43
267 0.4
268 0.41
269 0.49
270 0.53
271 0.52
272 0.54
273 0.55
274 0.58
275 0.57
276 0.53
277 0.46
278 0.39
279 0.33
280 0.31
281 0.26
282 0.23
283 0.2
284 0.22
285 0.21
286 0.25
287 0.31
288 0.3
289 0.3
290 0.29
291 0.28
292 0.22
293 0.3