FuNGI

A0A1X0SCP4

Protein Details

Accession

A0A1X0SCP4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-68	EARSLRRHSHFQHHPHHHKDVI	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 20, nucl 2, E.R. 2, mito 1, cyto_nucl 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010640 Low_temperature_requirement_A
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane
Pfam	View protein in Pfam PF06772 LtrA

Amino Acid Sequences

MSHDPRGAQGPTLRGPGRSADARRSIVEVEEELATTRSIHSARSANEARSLRRHSHFQHHPHHHKDVIAPLHDPTGKPLRRHGTETIGDVLLHPLKEMKLHHQRMEAYEKEKKEWNEKHPESIASDKDIEGMKEESIIDEVQVRLTVHFRHLVGNQGFEFTDEQLNTLKEPLELTEEEIERLKLVDDIDDFIDFLEKTKRNFSVKVHKTVKLKKKDLSRDNSSGDLGDKISEIGDKLDTILHRDSDDTKPRSITTPPTESTTEGDGIEPSKPTISTEDMKPTIMTTSPVSPSAPTEPAKPKQQMSSNHLSVPNESKENENSDDIFMELNENVYLQIQYIKITEEHTPKKRRAIFIVPDPDLSDEIGEESSATWVELLGDVFYVGWLSNFTHSAEITSSDGIGKYFAWFIVMWWTWCASALYSSRYDSGDVTHHVYKIIELCGLVIMAGASPNYQNNPKWFIIGYIIMKAVNLVQYSIIFIVSLGAHFKSSRRPLGAYVAASAISIVLWGISLLYLPSEGVSDDATAVKRYVLWYISIGLELIVYMVLQTNSRVSLAASHLGERFGLFTLIILGENCMGFISTVAELNMSNNATEPKAMAAIMFSVAIIFCYFFMYFDDFSGEFVAKTKMSSLWMYLHFPLHLFQVAFGIALTSLIKKVISDDGGEAVAEHASNTTAEHATTVASHIARLVASEHGSGHDSEPTESFLITFFWVSAGLILCFNAFIKLVNTPIKSVHYRSYIICGSRILNAVIFFALSVTTFHQLEPLPMISLLMACLFVQSAVDLLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.35
3	0.35
4	0.37
5	0.39
6	0.4
7	0.41
8	0.47
9	0.48
10	0.48
11	0.47
12	0.41
13	0.35
14	0.33
15	0.26
16	0.21
17	0.18
18	0.17
19	0.15
20	0.15
21	0.13
22	0.11
23	0.11
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.2
28	0.25
29	0.26
30	0.35
31	0.38
32	0.35
33	0.43
34	0.46
35	0.46
36	0.49
37	0.53
38	0.52
39	0.53
40	0.6
41	0.57
42	0.64
43	0.68
44	0.7
45	0.74
46	0.78
47	0.82
48	0.81
49	0.81
50	0.73
51	0.66
52	0.6
53	0.58
54	0.53
55	0.46
56	0.39
57	0.34
58	0.37
59	0.37
60	0.33
61	0.3
62	0.34
63	0.37
64	0.38
65	0.46
66	0.49
67	0.52
68	0.57
69	0.55
70	0.53
71	0.51
72	0.51
73	0.46
74	0.37
75	0.33
76	0.28
77	0.28
78	0.22
79	0.19
80	0.17
81	0.15
82	0.15
83	0.19
84	0.22
85	0.27
86	0.35
87	0.42
88	0.46
89	0.49
90	0.52
91	0.53
92	0.59
93	0.53
94	0.49
95	0.5
96	0.48
97	0.46
98	0.5
99	0.49
100	0.52
101	0.55
102	0.58
103	0.62
104	0.62
105	0.66
106	0.62
107	0.6
108	0.53
109	0.51
110	0.44
111	0.36
112	0.35
113	0.28
114	0.28
115	0.27
116	0.23
117	0.2
118	0.19
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.12
123	0.13
124	0.12
125	0.1
126	0.11
127	0.11
128	0.1
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.14
133	0.15
134	0.16
135	0.2
136	0.2
137	0.22
138	0.23
139	0.31
140	0.29
141	0.31
142	0.28
143	0.25
144	0.24
145	0.22
146	0.22
147	0.14
148	0.18
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.17
153	0.16
154	0.16
155	0.15
156	0.11
157	0.12
158	0.12
159	0.14
160	0.13
161	0.16
162	0.19
163	0.19
164	0.2
165	0.2
166	0.19
167	0.15
168	0.15
169	0.13
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.11
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.09
179	0.11
180	0.09
181	0.1
182	0.17
183	0.18
184	0.2
185	0.26
186	0.32
187	0.34
188	0.38
189	0.44
190	0.47
191	0.51
192	0.6
193	0.6
194	0.6
195	0.65
196	0.71
197	0.74
198	0.73
199	0.72
200	0.68
201	0.72
202	0.77
203	0.77
204	0.76
205	0.74
206	0.69
207	0.66
208	0.62
209	0.52
210	0.42
211	0.34
212	0.26
213	0.18
214	0.13
215	0.1
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.09
225	0.09
226	0.13
227	0.14
228	0.14
229	0.14
230	0.15
231	0.19
232	0.24
233	0.33
234	0.32
235	0.32
236	0.33
237	0.33
238	0.35
239	0.34
240	0.34
241	0.31
242	0.34
243	0.33
244	0.36
245	0.36
246	0.34
247	0.33
248	0.28
249	0.22
250	0.17
251	0.16
252	0.13
253	0.12
254	0.12
255	0.11
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.11
261	0.14
262	0.17
263	0.19
264	0.25
265	0.25
266	0.25
267	0.24
268	0.22
269	0.19
270	0.16
271	0.15
272	0.1
273	0.13
274	0.13
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.15
279	0.17
280	0.19
281	0.17
282	0.22
283	0.28
284	0.32
285	0.39
286	0.4
287	0.39
288	0.41
289	0.48
290	0.48
291	0.48
292	0.52
293	0.47
294	0.47
295	0.47
296	0.41
297	0.36
298	0.35
299	0.29
300	0.23
301	0.22
302	0.21
303	0.2
304	0.24
305	0.24
306	0.2
307	0.19
308	0.17
309	0.17
310	0.15
311	0.13
312	0.09
313	0.08
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.1
329	0.15
330	0.21
331	0.28
332	0.36
333	0.42
334	0.44
335	0.52
336	0.55
337	0.52
338	0.5
339	0.51
340	0.47
341	0.49
342	0.53
343	0.45
344	0.41
345	0.39
346	0.34
347	0.26
348	0.21
349	0.13
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.05
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.1
402	0.11
403	0.11
404	0.05
405	0.08
406	0.09
407	0.11
408	0.12
409	0.13
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.12
417	0.15
418	0.16
419	0.15
420	0.15
421	0.15
422	0.14
423	0.14
424	0.13
425	0.09
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.05
439	0.07
440	0.1
441	0.12
442	0.15
443	0.21
444	0.2
445	0.21
446	0.21
447	0.2
448	0.18
449	0.2
450	0.17
451	0.13
452	0.13
453	0.12
454	0.11
455	0.11
456	0.09
457	0.08
458	0.07
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.04
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.07
474	0.08
475	0.15
476	0.2
477	0.24
478	0.25
479	0.26
480	0.27
481	0.33
482	0.35
483	0.27
484	0.23
485	0.19
486	0.17
487	0.16
488	0.14
489	0.08
490	0.04
491	0.04
492	0.03
493	0.02
494	0.02
495	0.02
496	0.02
497	0.02
498	0.02
499	0.02
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.07
511	0.08
512	0.08
513	0.09
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.12
523	0.11
524	0.1
525	0.08
526	0.07
527	0.06
528	0.05
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.09
542	0.11
543	0.15
544	0.14
545	0.16
546	0.16
547	0.16
548	0.16
549	0.13
550	0.12
551	0.09
552	0.08
553	0.06
554	0.06
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.08
574	0.1
575	0.09
576	0.08
577	0.09
578	0.11
579	0.1
580	0.11
581	0.1
582	0.08
583	0.09
584	0.09
585	0.07
586	0.06
587	0.07
588	0.07
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.04
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.09
601	0.12
602	0.13
603	0.13
604	0.16
605	0.14
606	0.15
607	0.16
608	0.14
609	0.11
610	0.12
611	0.14
612	0.11
613	0.11
614	0.12
615	0.12
616	0.14
617	0.15
618	0.16
619	0.19
620	0.22
621	0.24
622	0.25
623	0.25
624	0.22
625	0.22
626	0.2
627	0.17
628	0.17
629	0.14
630	0.12
631	0.12
632	0.12
633	0.11
634	0.1
635	0.08
636	0.05
637	0.06
638	0.07
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.07
644	0.1
645	0.13
646	0.14
647	0.14
648	0.15
649	0.15
650	0.16
651	0.15
652	0.13
653	0.1
654	0.09
655	0.07
656	0.06
657	0.05
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.09
662	0.09
663	0.09
664	0.1
665	0.09
666	0.09
667	0.09
668	0.11
669	0.11
670	0.11
671	0.11
672	0.11
673	0.12
674	0.11
675	0.11
676	0.11
677	0.1
678	0.12
679	0.13
680	0.12
681	0.13
682	0.15
683	0.15
684	0.15
685	0.16
686	0.16
687	0.17
688	0.17
689	0.18
690	0.17
691	0.16
692	0.15
693	0.12
694	0.12
695	0.11
696	0.11
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.09
702	0.09
703	0.09
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.09
708	0.09
709	0.09
710	0.07
711	0.08
712	0.09
713	0.11
714	0.17
715	0.23
716	0.24
717	0.24
718	0.27
719	0.32
720	0.35
721	0.37
722	0.39
723	0.37
724	0.39
725	0.39
726	0.43
727	0.42
728	0.4
729	0.37
730	0.32
731	0.29
732	0.3
733	0.31
734	0.25
735	0.22
736	0.2
737	0.19
738	0.17
739	0.15
740	0.11
741	0.09
742	0.08
743	0.06
744	0.07
745	0.09
746	0.13
747	0.13
748	0.13
749	0.17
750	0.17
751	0.19
752	0.21
753	0.2
754	0.18
755	0.17
756	0.17
757	0.14
758	0.14
759	0.12
760	0.09
761	0.08
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.07
766	0.07
767	0.06

A0A1X0SCP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer