Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1PDZ1

Protein Details
Accession A0A0A1PDZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-171SLHGRNNEEQKKKKKTRCAFESCSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 16.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035896  AN1-like_Znf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019954  Ubiquitin_CS  
IPR019956  Ubiquitin_dom  
IPR000058  Znf_AN1  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00240  ubiquitin  
PF01428  zf-AN1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00299  UBIQUITIN_1  
PS50053  UBIQUITIN_2  
PS51039  ZF_AN1  
CDD cd01803  Ubl_ubiquitin  
Amino Acid Sequences MQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKQKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGMQIFVKTLAGTTISLEVNSSDTVDIMKSKIQEREDIPSNQQRLIFAGKQLENGHTLNEYNIQSESIIDLLLSLHGRNNEEQKKKKKTRCAFESCSDKPVKIIGDCRYCQSKFCARHRLPEDHRCENLTSCRQAAHERNSIKLLSERCVASKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.17
7 0.13
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.17
12 0.17
13 0.2
14 0.23
15 0.29
16 0.35
17 0.39
18 0.43
19 0.41
20 0.48
21 0.53
22 0.51
23 0.48
24 0.47
25 0.46
26 0.44
27 0.42
28 0.34
29 0.3
30 0.3
31 0.29
32 0.26
33 0.27
34 0.22
35 0.26
36 0.26
37 0.24
38 0.21
39 0.2
40 0.2
41 0.16
42 0.17
43 0.13
44 0.19
45 0.21
46 0.23
47 0.25
48 0.23
49 0.22
50 0.22
51 0.24
52 0.2
53 0.19
54 0.16
55 0.18
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.18
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.09
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.09
91 0.12
92 0.16
93 0.17
94 0.2
95 0.21
96 0.25
97 0.29
98 0.28
99 0.29
100 0.3
101 0.31
102 0.29
103 0.27
104 0.22
105 0.19
106 0.22
107 0.18
108 0.15
109 0.18
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.12
140 0.21
141 0.29
142 0.38
143 0.47
144 0.55
145 0.65
146 0.74
147 0.8
148 0.82
149 0.82
150 0.84
151 0.85
152 0.85
153 0.8
154 0.78
155 0.79
156 0.7
157 0.67
158 0.58
159 0.48
160 0.39
161 0.36
162 0.31
163 0.25
164 0.29
165 0.29
166 0.36
167 0.37
168 0.4
169 0.44
170 0.42
171 0.41
172 0.41
173 0.43
174 0.45
175 0.52
176 0.59
177 0.54
178 0.64
179 0.69
180 0.72
181 0.72
182 0.72
183 0.72
184 0.68
185 0.68
186 0.61
187 0.57
188 0.51
189 0.51
190 0.49
191 0.44
192 0.38
193 0.37
194 0.37
195 0.44
196 0.47
197 0.46
198 0.47
199 0.46
200 0.48
201 0.5
202 0.47
203 0.41
204 0.39
205 0.34
206 0.3
207 0.33
208 0.31