Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0S1A6

Protein Details
Accession A0A1X0S1A6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-362RSDIKKPVSKVIRKFKRSDKKSIVVRMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-353KPVSKVIRKFKRSD
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007604  CP2  
IPR040167  TF_CP2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04516  CP2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51968  GRH_CP2_DB  
Amino Acid Sequences MKSVAMQQNVTMDQPHMPPLNPASSIRYDICLEGQHYNITLKDVKGYDGDIISTAIITFHDEAHRAGATDYWKFWLSHQNNAEKAKAIDLDISRSNGIHIIEHRQFDRIVFRWNGKAGASIYVKFNCLSTDFSRIKGVKGIPLRLQIESYQQGVPHIEKTYSRIKLFRDKGAERKNKDDARHIERQLEKLRGKNGEPHPLWLAYSPTSPVTVFRELVTPEEDMAEDMHRRGLIASPGSSNILLPLPSPVPAPVNFMPGPMRRSFSTSFQPVPAVDMHYPFSAQVPIGYDPSYVPQRRRRIAKLSVLIKFESDDVYRAIYLEHLTVKELTEKIIERSDIKKPVSKVIRKFKRSDKKSIVVRMEDDVVKDMQEEQDILVQTEDNEDGQSVTLVLVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.23
4 0.23
5 0.26
6 0.28
7 0.31
8 0.3
9 0.3
10 0.3
11 0.31
12 0.35
13 0.32
14 0.31
15 0.28
16 0.27
17 0.27
18 0.25
19 0.24
20 0.23
21 0.23
22 0.21
23 0.21
24 0.22
25 0.2
26 0.21
27 0.22
28 0.19
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.23
34 0.21
35 0.18
36 0.18
37 0.13
38 0.13
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.06
43 0.06
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.16
51 0.16
52 0.14
53 0.13
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.2
60 0.2
61 0.22
62 0.3
63 0.29
64 0.36
65 0.41
66 0.45
67 0.49
68 0.51
69 0.5
70 0.41
71 0.39
72 0.33
73 0.28
74 0.22
75 0.21
76 0.19
77 0.22
78 0.22
79 0.23
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.21
88 0.24
89 0.27
90 0.27
91 0.26
92 0.26
93 0.24
94 0.29
95 0.23
96 0.26
97 0.27
98 0.29
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.25
103 0.26
104 0.2
105 0.24
106 0.23
107 0.21
108 0.23
109 0.22
110 0.23
111 0.2
112 0.19
113 0.14
114 0.14
115 0.17
116 0.15
117 0.23
118 0.23
119 0.24
120 0.31
121 0.3
122 0.3
123 0.3
124 0.29
125 0.26
126 0.3
127 0.32
128 0.29
129 0.34
130 0.35
131 0.3
132 0.31
133 0.25
134 0.26
135 0.24
136 0.23
137 0.18
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.16
147 0.24
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.31
152 0.4
153 0.43
154 0.44
155 0.43
156 0.43
157 0.5
158 0.58
159 0.62
160 0.55
161 0.57
162 0.61
163 0.58
164 0.57
165 0.56
166 0.52
167 0.51
168 0.56
169 0.52
170 0.5
171 0.47
172 0.5
173 0.46
174 0.47
175 0.42
176 0.37
177 0.41
178 0.37
179 0.35
180 0.39
181 0.38
182 0.4
183 0.38
184 0.37
185 0.34
186 0.31
187 0.31
188 0.23
189 0.2
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.17
239 0.15
240 0.2
241 0.2
242 0.2
243 0.24
244 0.24
245 0.28
246 0.23
247 0.25
248 0.21
249 0.26
250 0.28
251 0.28
252 0.32
253 0.33
254 0.33
255 0.31
256 0.32
257 0.27
258 0.26
259 0.23
260 0.19
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.15
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.16
278 0.24
279 0.24
280 0.31
281 0.38
282 0.47
283 0.54
284 0.62
285 0.64
286 0.64
287 0.69
288 0.71
289 0.7
290 0.68
291 0.66
292 0.6
293 0.54
294 0.46
295 0.38
296 0.3
297 0.24
298 0.17
299 0.14
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.12
310 0.14
311 0.14
312 0.15
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.18
317 0.2
318 0.21
319 0.24
320 0.25
321 0.24
322 0.28
323 0.35
324 0.38
325 0.4
326 0.43
327 0.42
328 0.5
329 0.56
330 0.61
331 0.63
332 0.67
333 0.74
334 0.75
335 0.81
336 0.82
337 0.83
338 0.81
339 0.82
340 0.8
341 0.78
342 0.8
343 0.82
344 0.78
345 0.71
346 0.67
347 0.59
348 0.54
349 0.46
350 0.39
351 0.32
352 0.25
353 0.21
354 0.19
355 0.18
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.12
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.16
364 0.15
365 0.14
366 0.16
367 0.16
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.08