FuNGI

A0A1X0SD82

Protein Details

Accession

A0A1X0SD82

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
641-661	NSRLEKYCSPQSKKAQKQAIE	Hydrophilic
723-744	QLDQLKTQTKKEQKFNPTNMSN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MRDNDLFVAVGSHIRVLNLVEFKDAWIAATKKAIESNAELSSNWFSSVPFKLLDTPEINFTIVSLAANTNGRLLSVTGESSLVIVCLPRHSFSAISLTKQKVDCRTLTVGRKYYKKNQAEILKVEWHPLSETHTHIVALSSDNILRIFDASTDIDEPEQTFDLSPVKKSPSRSVTPGRGFTFEDDDVNGYEDAVTFSLGGKSHKQSGWEPFSIFYALRSGHMYALCPVIPFRSIIHKKHLDNLTSLTEAKYQKAKSDDSKDHQLMSLLFKLQKQWLQHLSDSSKVGRKTNLLNSDMISVVSNDMSIKFDVKRQGPFLVNQENTVSTSAQVTDILYIYDEPVSILALALSNSQVKNHVLLSEIDPQWQIPTTNTKEDWHKELGTLLTDRDFLPKAMLYETFDLKTKSLPPTDSLRLLNDPIYPDTYYIYHTGGVTAIGMSKWLEAYKNMLKKIEDEQDYTLTALKRLLSEKTQSDVRYLINTAPFSNAFTPIVGLFVIVDLYLSYTLVAVTDEYKLVYRDLNMRSDPEQDKAYLAATKNQLKHIASTDNSPAYEPLLPLPIFEKPKQLDNLPTQSKIAIPKNLADSKEIVINEETLRFFSKSAEQVRRETRDIRKAAAKIEERIALQQKEFEKQVETVRELNSRLEKYCSPQSKKAQKQAIEEISQRHQRLRLRMDEQLRQIINYCQPGLSIEENKWIEKLQELSDKVSGASGYASRIELLKKQLDQLKTQTKKEQKFNPTNMSNDQLKNLLDVLREQSKSIDEAKNRVENMESKIMTTASS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.13
3	0.13
4	0.18
5	0.2
6	0.2
7	0.2
8	0.2
9	0.21
10	0.23
11	0.21
12	0.16
13	0.2
14	0.21
15	0.21
16	0.26
17	0.26
18	0.26
19	0.29
20	0.29
21	0.25
22	0.28
23	0.3
24	0.29
25	0.29
26	0.26
27	0.26
28	0.29
29	0.26
30	0.23
31	0.18
32	0.15
33	0.19
34	0.23
35	0.22
36	0.19
37	0.2
38	0.24
39	0.26
40	0.32
41	0.29
42	0.28
43	0.29
44	0.3
45	0.29
46	0.22
47	0.2
48	0.16
49	0.13
50	0.12
51	0.09
52	0.08
53	0.11
54	0.13
55	0.13
56	0.13
57	0.13
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.08
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.12
74	0.14
75	0.15
76	0.16
77	0.18
78	0.19
79	0.19
80	0.28
81	0.25
82	0.28
83	0.34
84	0.34
85	0.38
86	0.41
87	0.45
88	0.43
89	0.46
90	0.43
91	0.42
92	0.47
93	0.49
94	0.55
95	0.58
96	0.57
97	0.59
98	0.65
99	0.67
100	0.7
101	0.73
102	0.71
103	0.68
104	0.69
105	0.71
106	0.69
107	0.65
108	0.6
109	0.56
110	0.5
111	0.48
112	0.4
113	0.32
114	0.27
115	0.24
116	0.24
117	0.2
118	0.22
119	0.21
120	0.21
121	0.21
122	0.19
123	0.19
124	0.15
125	0.14
126	0.12
127	0.12
128	0.11
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.11
133	0.09
134	0.09
135	0.07
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.12
142	0.12
143	0.13
144	0.12
145	0.12
146	0.11
147	0.1
148	0.11
149	0.16
150	0.17
151	0.19
152	0.2
153	0.25
154	0.28
155	0.32
156	0.4
157	0.42
158	0.45
159	0.51
160	0.56
161	0.6
162	0.62
163	0.64
164	0.57
165	0.52
166	0.48
167	0.43
168	0.4
169	0.31
170	0.26
171	0.2
172	0.19
173	0.17
174	0.17
175	0.15
176	0.1
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.05
183	0.06
184	0.08
185	0.09
186	0.11
187	0.15
188	0.18
189	0.24
190	0.25
191	0.28
192	0.3
193	0.38
194	0.43
195	0.4
196	0.38
197	0.33
198	0.33
199	0.31
200	0.26
201	0.17
202	0.14
203	0.12
204	0.13
205	0.14
206	0.14
207	0.15
208	0.15
209	0.16
210	0.14
211	0.15
212	0.14
213	0.12
214	0.12
215	0.1
216	0.11
217	0.1
218	0.11
219	0.2
220	0.26
221	0.29
222	0.38
223	0.44
224	0.44
225	0.52
226	0.56
227	0.46
228	0.42
229	0.42
230	0.36
231	0.3
232	0.3
233	0.22
234	0.23
235	0.22
236	0.23
237	0.26
238	0.23
239	0.26
240	0.3
241	0.33
242	0.35
243	0.43
244	0.47
245	0.47
246	0.56
247	0.52
248	0.49
249	0.45
250	0.39
251	0.31
252	0.28
253	0.24
254	0.18
255	0.18
256	0.18
257	0.2
258	0.22
259	0.24
260	0.23
261	0.27
262	0.3
263	0.32
264	0.33
265	0.35
266	0.34
267	0.33
268	0.33
269	0.3
270	0.29
271	0.27
272	0.28
273	0.25
274	0.26
275	0.29
276	0.34
277	0.38
278	0.34
279	0.33
280	0.32
281	0.31
282	0.28
283	0.23
284	0.15
285	0.09
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.05
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.09
294	0.09
295	0.13
296	0.18
297	0.21
298	0.23
299	0.24
300	0.28
301	0.28
302	0.29
303	0.31
304	0.33
305	0.3
306	0.28
307	0.27
308	0.23
309	0.22
310	0.21
311	0.16
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.03
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.09
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.09
345	0.1
346	0.13
347	0.19
348	0.19
349	0.18
350	0.18
351	0.17
352	0.16
353	0.16
354	0.13
355	0.07
356	0.15
357	0.17
358	0.2
359	0.21
360	0.22
361	0.27
362	0.29
363	0.32
364	0.27
365	0.24
366	0.21
367	0.22
368	0.2
369	0.16
370	0.14
371	0.11
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.12
387	0.13
388	0.13
389	0.12
390	0.13
391	0.15
392	0.16
393	0.17
394	0.17
395	0.19
396	0.24
397	0.26
398	0.27
399	0.25
400	0.23
401	0.22
402	0.22
403	0.21
404	0.16
405	0.15
406	0.13
407	0.14
408	0.13
409	0.12
410	0.12
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.08
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.12
432	0.17
433	0.22
434	0.23
435	0.25
436	0.24
437	0.26
438	0.31
439	0.33
440	0.28
441	0.26
442	0.27
443	0.26
444	0.26
445	0.24
446	0.22
447	0.15
448	0.13
449	0.12
450	0.11
451	0.12
452	0.13
453	0.15
454	0.15
455	0.18
456	0.19
457	0.21
458	0.24
459	0.23
460	0.23
461	0.23
462	0.21
463	0.19
464	0.18
465	0.17
466	0.16
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.12
475	0.11
476	0.11
477	0.09
478	0.1
479	0.07
480	0.06
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.03
486	0.02
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.1
505	0.16
506	0.19
507	0.22
508	0.22
509	0.24
510	0.25
511	0.31
512	0.31
513	0.26
514	0.25
515	0.22
516	0.22
517	0.19
518	0.19
519	0.16
520	0.15
521	0.19
522	0.23
523	0.29
524	0.3
525	0.32
526	0.36
527	0.33
528	0.34
529	0.32
530	0.31
531	0.26
532	0.27
533	0.29
534	0.26
535	0.25
536	0.23
537	0.2
538	0.17
539	0.18
540	0.15
541	0.12
542	0.15
543	0.14
544	0.14
545	0.15
546	0.19
547	0.22
548	0.23
549	0.29
550	0.26
551	0.32
552	0.35
553	0.36
554	0.37
555	0.39
556	0.47
557	0.43
558	0.43
559	0.38
560	0.35
561	0.36
562	0.36
563	0.34
564	0.3
565	0.28
566	0.3
567	0.37
568	0.4
569	0.38
570	0.33
571	0.3
572	0.26
573	0.29
574	0.26
575	0.21
576	0.17
577	0.18
578	0.17
579	0.18
580	0.17
581	0.14
582	0.17
583	0.15
584	0.15
585	0.15
586	0.2
587	0.24
588	0.33
589	0.4
590	0.4
591	0.47
592	0.55
593	0.58
594	0.57
595	0.58
596	0.58
597	0.58
598	0.57
599	0.55
600	0.54
601	0.5
602	0.51
603	0.52
604	0.47
605	0.4
606	0.41
607	0.4
608	0.34
609	0.38
610	0.4
611	0.33
612	0.3
613	0.33
614	0.31
615	0.33
616	0.33
617	0.29
618	0.24
619	0.25
620	0.31
621	0.31
622	0.32
623	0.31
624	0.33
625	0.35
626	0.34
627	0.36
628	0.37
629	0.34
630	0.33
631	0.34
632	0.33
633	0.36
634	0.44
635	0.49
636	0.49
637	0.56
638	0.64
639	0.71
640	0.78
641	0.82
642	0.81
643	0.76
644	0.76
645	0.76
646	0.72
647	0.66
648	0.6
649	0.55
650	0.54
651	0.56
652	0.5
653	0.45
654	0.45
655	0.46
656	0.52
657	0.55
658	0.56
659	0.53
660	0.59
661	0.62
662	0.63
663	0.61
664	0.6
665	0.53
666	0.45
667	0.42
668	0.39
669	0.38
670	0.35
671	0.31
672	0.23
673	0.23
674	0.24
675	0.26
676	0.26
677	0.24
678	0.21
679	0.29
680	0.31
681	0.31
682	0.31
683	0.28
684	0.23
685	0.23
686	0.25
687	0.22
688	0.29
689	0.3
690	0.32
691	0.33
692	0.33
693	0.29
694	0.27
695	0.21
696	0.14
697	0.14
698	0.11
699	0.11
700	0.12
701	0.13
702	0.12
703	0.15
704	0.17
705	0.19
706	0.25
707	0.29
708	0.29
709	0.36
710	0.42
711	0.43
712	0.46
713	0.51
714	0.56
715	0.57
716	0.61
717	0.64
718	0.68
719	0.73
720	0.77
721	0.77
722	0.77
723	0.81
724	0.83
725	0.83
726	0.78
727	0.75
728	0.7
729	0.66
730	0.62
731	0.54
732	0.48
733	0.41
734	0.36
735	0.33
736	0.3
737	0.26
738	0.21
739	0.21
740	0.25
741	0.29
742	0.3
743	0.29
744	0.29
745	0.28
746	0.3
747	0.35
748	0.37
749	0.33
750	0.39
751	0.46
752	0.51
753	0.49
754	0.48
755	0.45
756	0.41
757	0.44
758	0.46
759	0.39
760	0.33
761	0.34

A0A1X0SD82

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer