Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1N9J1

Protein Details
Accession A0A0A1N9J1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-49QPTMDSPKTKPDDKKKKKERIKKKPKRHSRKPTLKTKVVVRRLPBasic
223-246AAAKAKKAAKKNARRKAEKEKNAEHydrophilic
254-286QQQPSASESKKPKRDRNKRKKEGERKEGDRGEPBasic
292-332NRGSDSPNKKDKPRGPRKDNPNKPKKTKKVEGKQPQVVKILBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-42TKPDDKKKKKERIKKKPKRHSRKPTLKTK
221-243AQAAAKAKKAAKKNARRKAEKEK
262-323SKKPKRDRNKRKKEGERKEGDRGEPSPSASNRGSDSPNKKDKPRGPRKDNPNKPKKTKKVEG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSVQEQPTMDSPKTKPDDKKKKKERIKKKPKRHSRKPTLKTKVVVRRLPPLLQEDALMEAVKPWINEQTTDYSFFVPGKIPKSKGKENIFSRAYFHLKTMEAVIAFHQGFDGRLFTDSRGNESRAVVEFAPYQKIPKEHKTTDSRQGTIDEDPDYVEFLNFLEAEKNKSKEAQDDANDGLNPIEKLENRIAMVTAKTLAAEQANKPKTTPLLEHLRAQKAAQAAAKAKKAAKKNARRKAEKEKNAEQQQQQQQQQQPSASESKKPKRDRNKRKKEGERKEGDRGEPSPSASNRGSDSPNKKDKPRGPRKDNPNKPKKTKKVEGKQPQVVKILGRQQQPSTENNSQQTTNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.55
3 0.61
4 0.71
5 0.76
6 0.86
7 0.86
8 0.92
9 0.94
10 0.95
11 0.95
12 0.95
13 0.96
14 0.95
15 0.96
16 0.96
17 0.97
18 0.97
19 0.97
20 0.97
21 0.97
22 0.97
23 0.95
24 0.95
25 0.94
26 0.9
27 0.85
28 0.83
29 0.82
30 0.8
31 0.78
32 0.7
33 0.69
34 0.66
35 0.62
36 0.56
37 0.5
38 0.44
39 0.37
40 0.34
41 0.25
42 0.23
43 0.21
44 0.17
45 0.12
46 0.09
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.2
55 0.25
56 0.26
57 0.29
58 0.29
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.21
65 0.23
66 0.28
67 0.31
68 0.38
69 0.45
70 0.52
71 0.57
72 0.61
73 0.64
74 0.63
75 0.68
76 0.64
77 0.57
78 0.52
79 0.48
80 0.45
81 0.36
82 0.32
83 0.26
84 0.24
85 0.24
86 0.22
87 0.18
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.06
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.15
104 0.15
105 0.2
106 0.23
107 0.24
108 0.24
109 0.24
110 0.25
111 0.21
112 0.22
113 0.17
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.22
122 0.26
123 0.33
124 0.39
125 0.39
126 0.47
127 0.53
128 0.56
129 0.61
130 0.59
131 0.52
132 0.45
133 0.43
134 0.37
135 0.31
136 0.27
137 0.18
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.08
143 0.07
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.08
150 0.08
151 0.13
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.21
156 0.21
157 0.22
158 0.25
159 0.25
160 0.23
161 0.24
162 0.25
163 0.23
164 0.22
165 0.19
166 0.15
167 0.11
168 0.09
169 0.07
170 0.09
171 0.07
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.11
189 0.2
190 0.22
191 0.23
192 0.23
193 0.24
194 0.24
195 0.25
196 0.24
197 0.21
198 0.28
199 0.3
200 0.35
201 0.39
202 0.4
203 0.38
204 0.36
205 0.32
206 0.24
207 0.25
208 0.21
209 0.18
210 0.21
211 0.25
212 0.27
213 0.27
214 0.3
215 0.33
216 0.38
217 0.45
218 0.51
219 0.57
220 0.66
221 0.73
222 0.79
223 0.81
224 0.82
225 0.84
226 0.84
227 0.82
228 0.79
229 0.78
230 0.78
231 0.79
232 0.79
233 0.71
234 0.7
235 0.7
236 0.71
237 0.67
238 0.64
239 0.61
240 0.59
241 0.58
242 0.5
243 0.42
244 0.38
245 0.41
246 0.35
247 0.37
248 0.43
249 0.49
250 0.57
251 0.65
252 0.71
253 0.74
254 0.84
255 0.88
256 0.9
257 0.91
258 0.92
259 0.94
260 0.96
261 0.95
262 0.95
263 0.94
264 0.92
265 0.87
266 0.86
267 0.8
268 0.72
269 0.66
270 0.56
271 0.51
272 0.43
273 0.39
274 0.36
275 0.32
276 0.35
277 0.31
278 0.31
279 0.28
280 0.31
281 0.33
282 0.35
283 0.43
284 0.46
285 0.56
286 0.6
287 0.63
288 0.7
289 0.73
290 0.76
291 0.79
292 0.8
293 0.8
294 0.84
295 0.89
296 0.9
297 0.93
298 0.93
299 0.92
300 0.92
301 0.93
302 0.94
303 0.93
304 0.93
305 0.92
306 0.92
307 0.92
308 0.93
309 0.93
310 0.92
311 0.91
312 0.87
313 0.81
314 0.74
315 0.65
316 0.57
317 0.53
318 0.52
319 0.49
320 0.48
321 0.47
322 0.46
323 0.52
324 0.52
325 0.5
326 0.5
327 0.52
328 0.52
329 0.53
330 0.54