FuNGI

A0A2G4SKQ1

Protein Details

Accession

A0A2G4SKQ1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
535-570	YVKKDPNGTFVKKPKQKKKRKPLLPKKMDSKSQPDP	Basic
574-599	LPKQERSNFRAKSKSKKTAKSSTRKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
542-599	GTFVKKPKQKKKRKPLLPKKMDSKSQPDPERWLPKQERSNFRAKSKSKKTAKSSTRKA

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011717 TPR-4 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0042802 F:identical protein binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like PF13432 TPR_16 PF07721 TPR_4 PF13174 TPR_6 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

MSSKEQETTSLFTKLKKAIDSEDDQQALELCDQLLKLTPDDKIVLQSKVISLIRLEKYRDALTLIARQFRNTKELAYEKIYCYYRTNQFAPAMELLEELSSSNQSPSLLYLEAQLLYSQGQFKKAVEVYESLLKTLDKKDVLYDEIQVNLLAAKAGLLFSTYQSKEIDPVKERSEDLYEVAYNAASVYLAQGNIAKAQEQLELAQKQCMDKSSTMSEEEQEQELAVITTQLGYTYQLQGRTSEAIKIYQSVLNSKDTSIAAVASNNIVVIDQAKDVEDAAKKLKFATSKEADAKLKNYQKRVILMNESLLHLYAKKYAACRDQAQKLIDKYPDNDSLYLVLASATYHQHKASKAIEELKKYAEKKPTSLAIHFAAIQLQMLESQHKAALETLQHYLNGVADNKQEQYRPAIVALLVWLYQQTGQPEKAMETLDKAASIWKSDDSFASTHTPTSIVKQTAAFKLKAGRLQEAVEDYEQLVKEDPTDAQAVAGLIAAYAQVDPTKAEQYGSALPEIALNHIDVDTLEKIVPGVKRGYVKKDPNGTFVKKPKQKKKRKPLLPKKMDSKSQPDPERWLPKQERSNFRAKSKSKKTAKSSTRKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.43
3	0.41
4	0.41
5	0.4
6	0.46
7	0.48
8	0.46
9	0.48
10	0.44
11	0.4
12	0.37
13	0.32
14	0.27
15	0.21
16	0.17
17	0.1
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.15
22	0.15
23	0.16
24	0.18
25	0.19
26	0.2
27	0.23
28	0.23
29	0.25
30	0.28
31	0.27
32	0.26
33	0.26
34	0.24
35	0.29
36	0.29
37	0.23
38	0.2
39	0.27
40	0.32
41	0.35
42	0.38
43	0.34
44	0.38
45	0.39
46	0.37
47	0.31
48	0.28
49	0.27
50	0.32
51	0.32
52	0.35
53	0.34
54	0.36
55	0.39
56	0.39
57	0.4
58	0.33
59	0.32
60	0.32
61	0.35
62	0.37
63	0.37
64	0.39
65	0.36
66	0.42
67	0.42
68	0.37
69	0.37
70	0.4
71	0.42
72	0.45
73	0.45
74	0.43
75	0.44
76	0.44
77	0.43
78	0.37
79	0.3
80	0.23
81	0.21
82	0.17
83	0.13
84	0.11
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.11
97	0.12
98	0.13
99	0.13
100	0.13
101	0.11
102	0.09
103	0.09
104	0.11
105	0.15
106	0.15
107	0.18
108	0.18
109	0.19
110	0.25
111	0.26
112	0.26
113	0.22
114	0.23
115	0.23
116	0.29
117	0.28
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.21
122	0.22
123	0.25
124	0.19
125	0.19
126	0.22
127	0.24
128	0.26
129	0.24
130	0.25
131	0.2
132	0.2
133	0.2
134	0.16
135	0.13
136	0.11
137	0.09
138	0.06
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.06
147	0.14
148	0.14
149	0.16
150	0.17
151	0.17
152	0.21
153	0.25
154	0.3
155	0.27
156	0.31
157	0.32
158	0.34
159	0.34
160	0.32
161	0.31
162	0.25
163	0.22
164	0.2
165	0.17
166	0.15
167	0.15
168	0.12
169	0.08
170	0.07
171	0.06
172	0.04
173	0.04
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.07
179	0.08
180	0.1
181	0.1
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.11
186	0.1
187	0.11
188	0.16
189	0.18
190	0.18
191	0.19
192	0.19
193	0.19
194	0.19
195	0.2
196	0.17
197	0.16
198	0.19
199	0.2
200	0.21
201	0.23
202	0.22
203	0.21
204	0.2
205	0.2
206	0.17
207	0.14
208	0.12
209	0.1
210	0.09
211	0.08
212	0.06
213	0.04
214	0.03
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.07
221	0.11
222	0.13
223	0.14
224	0.15
225	0.16
226	0.17
227	0.18
228	0.17
229	0.15
230	0.14
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.14
238	0.15
239	0.17
240	0.17
241	0.16
242	0.16
243	0.15
244	0.15
245	0.12
246	0.11
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.12
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.16
271	0.16
272	0.17
273	0.24
274	0.24
275	0.27
276	0.31
277	0.35
278	0.34
279	0.32
280	0.33
281	0.32
282	0.37
283	0.36
284	0.36
285	0.36
286	0.36
287	0.38
288	0.38
289	0.33
290	0.3
291	0.27
292	0.26
293	0.22
294	0.2
295	0.17
296	0.14
297	0.12
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.11
303	0.12
304	0.16
305	0.2
306	0.23
307	0.27
308	0.3
309	0.33
310	0.36
311	0.36
312	0.37
313	0.35
314	0.35
315	0.34
316	0.3
317	0.28
318	0.27
319	0.31
320	0.27
321	0.26
322	0.22
323	0.2
324	0.19
325	0.17
326	0.12
327	0.07
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.08
332	0.09
333	0.1
334	0.11
335	0.14
336	0.15
337	0.2
338	0.21
339	0.22
340	0.23
341	0.3
342	0.33
343	0.33
344	0.34
345	0.33
346	0.36
347	0.35
348	0.38
349	0.38
350	0.36
351	0.35
352	0.38
353	0.41
354	0.39
355	0.37
356	0.35
357	0.28
358	0.27
359	0.25
360	0.21
361	0.15
362	0.12
363	0.11
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.11
376	0.11
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.14
381	0.13
382	0.13
383	0.11
384	0.12
385	0.11
386	0.1
387	0.11
388	0.13
389	0.15
390	0.16
391	0.16
392	0.15
393	0.19
394	0.2
395	0.19
396	0.18
397	0.17
398	0.15
399	0.14
400	0.14
401	0.09
402	0.07
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.06
407	0.08
408	0.11
409	0.13
410	0.14
411	0.15
412	0.16
413	0.17
414	0.17
415	0.17
416	0.14
417	0.14
418	0.16
419	0.15
420	0.14
421	0.13
422	0.15
423	0.14
424	0.16
425	0.14
426	0.14
427	0.15
428	0.15
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.16
433	0.19
434	0.18
435	0.17
436	0.16
437	0.17
438	0.15
439	0.19
440	0.23
441	0.2
442	0.21
443	0.24
444	0.28
445	0.34
446	0.38
447	0.33
448	0.29
449	0.35
450	0.37
451	0.38
452	0.36
453	0.32
454	0.29
455	0.3
456	0.3
457	0.25
458	0.24
459	0.2
460	0.18
461	0.15
462	0.18
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.13
470	0.11
471	0.13
472	0.12
473	0.1
474	0.11
475	0.1
476	0.09
477	0.09
478	0.06
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.06
488	0.09
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.16
494	0.2
495	0.21
496	0.19
497	0.17
498	0.16
499	0.18
500	0.18
501	0.16
502	0.12
503	0.1
504	0.11
505	0.1
506	0.1
507	0.08
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.11
512	0.1
513	0.1
514	0.15
515	0.16
516	0.15
517	0.17
518	0.2
519	0.28
520	0.33
521	0.42
522	0.48
523	0.55
524	0.6
525	0.68
526	0.66
527	0.66
528	0.69
529	0.66
530	0.66
531	0.67
532	0.7
533	0.68
534	0.77
535	0.81
536	0.83
537	0.89
538	0.91
539	0.93
540	0.93
541	0.95
542	0.96
543	0.96
544	0.97
545	0.96
546	0.94
547	0.93
548	0.91
549	0.88
550	0.83
551	0.81
552	0.79
553	0.79
554	0.75
555	0.69
556	0.68
557	0.7
558	0.73
559	0.68
560	0.68
561	0.66
562	0.69
563	0.74
564	0.76
565	0.77
566	0.72
567	0.79
568	0.76
569	0.76
570	0.78
571	0.75
572	0.76
573	0.77
574	0.82
575	0.82
576	0.84
577	0.85
578	0.86
579	0.89

A0A2G4SKQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer