Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2G4SFT4

Protein Details
Accession A0A2G4SFT4    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
312-339GRGGHGFRGKKRPQGRQQDDSNKRPRGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-328VKHRHGKGGRGGHGFRGKKRPQGRQ
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MSKAEQVNQQLHEIFDPENLKKDNFFRELVERDPEGWVPIKKMSMIKRFKQIIEGDLSLFEEAISISPEDFEINEAKTHLRCIKKAEEPKKEEEKDEKQSKNEEKIKNHIESLNHRSIYAKGFSVDKEPSEKDLKEFYGKFGRVLSLKFRREGDKKYEGKFKGSIFVEFESQEIAERVVAEATEYDGKELLTMIKGDYIDMKKREKYQDQEFEFKEMKKRHRYLVEYKNAKDTQFSDIKQIIKAITPVGRVEKLKEAGSGVLEIFDITPEEFLSKLGEQKAEGIQFMLCSAEARKHFLECQDKVKHRHGKGGRGGHGFRGKKRPQGRQQDDSNKRPRGVVEVKTAEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.26
4 0.23
5 0.29
6 0.3
7 0.3
8 0.33
9 0.38
10 0.4
11 0.39
12 0.39
13 0.36
14 0.41
15 0.43
16 0.42
17 0.42
18 0.36
19 0.33
20 0.34
21 0.3
22 0.26
23 0.27
24 0.25
25 0.23
26 0.25
27 0.25
28 0.26
29 0.32
30 0.38
31 0.43
32 0.5
33 0.53
34 0.6
35 0.63
36 0.61
37 0.61
38 0.54
39 0.48
40 0.45
41 0.41
42 0.31
43 0.27
44 0.27
45 0.2
46 0.17
47 0.13
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.14
64 0.14
65 0.19
66 0.25
67 0.27
68 0.29
69 0.34
70 0.4
71 0.48
72 0.58
73 0.62
74 0.66
75 0.66
76 0.72
77 0.76
78 0.71
79 0.67
80 0.65
81 0.63
82 0.63
83 0.67
84 0.62
85 0.56
86 0.62
87 0.63
88 0.65
89 0.66
90 0.63
91 0.58
92 0.63
93 0.66
94 0.59
95 0.55
96 0.48
97 0.44
98 0.44
99 0.47
100 0.45
101 0.39
102 0.37
103 0.35
104 0.34
105 0.33
106 0.28
107 0.2
108 0.14
109 0.16
110 0.16
111 0.19
112 0.18
113 0.16
114 0.19
115 0.19
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.23
120 0.25
121 0.25
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.3
126 0.3
127 0.28
128 0.26
129 0.26
130 0.21
131 0.22
132 0.27
133 0.28
134 0.3
135 0.32
136 0.33
137 0.38
138 0.41
139 0.45
140 0.44
141 0.45
142 0.48
143 0.5
144 0.56
145 0.5
146 0.49
147 0.47
148 0.4
149 0.37
150 0.33
151 0.3
152 0.23
153 0.23
154 0.2
155 0.17
156 0.17
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.11
185 0.14
186 0.19
187 0.22
188 0.26
189 0.28
190 0.34
191 0.41
192 0.43
193 0.46
194 0.51
195 0.57
196 0.57
197 0.6
198 0.55
199 0.53
200 0.49
201 0.44
202 0.43
203 0.4
204 0.45
205 0.48
206 0.5
207 0.52
208 0.57
209 0.62
210 0.64
211 0.68
212 0.69
213 0.65
214 0.63
215 0.65
216 0.59
217 0.52
218 0.45
219 0.36
220 0.32
221 0.32
222 0.31
223 0.29
224 0.31
225 0.32
226 0.3
227 0.3
228 0.24
229 0.19
230 0.2
231 0.17
232 0.15
233 0.15
234 0.17
235 0.19
236 0.22
237 0.21
238 0.23
239 0.27
240 0.27
241 0.26
242 0.25
243 0.23
244 0.2
245 0.2
246 0.18
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.09
261 0.1
262 0.14
263 0.16
264 0.17
265 0.17
266 0.2
267 0.23
268 0.21
269 0.2
270 0.17
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.11
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.14
279 0.15
280 0.21
281 0.22
282 0.24
283 0.26
284 0.34
285 0.42
286 0.39
287 0.47
288 0.51
289 0.57
290 0.61
291 0.69
292 0.71
293 0.64
294 0.71
295 0.68
296 0.68
297 0.7
298 0.73
299 0.7
300 0.68
301 0.67
302 0.65
303 0.68
304 0.63
305 0.62
306 0.63
307 0.61
308 0.64
309 0.72
310 0.74
311 0.75
312 0.82
313 0.83
314 0.81
315 0.86
316 0.87
317 0.87
318 0.86
319 0.86
320 0.81
321 0.74
322 0.68
323 0.58
324 0.57
325 0.55
326 0.52
327 0.52