Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0CTH3

Protein Details
Accession J0CTH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-309DLDARSKRRRVDDRPRRAKVKRARQYLREGFABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-301RSKRRRVDDRPRRAKVKRAR
Subcellular Location(s) nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, mito 5, plas 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041078  Plavaka  
KEGG adl:AURDEDRAFT_76878  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18759  Plavaka  
Amino Acid Sequences MDSTDPAGALGRGWNTSSVRFEVPHGRKSDPPPKEQCMFEAPGVLHRSIPDLVQSEFEKPSAAQFHFTPFYESWTPPTTGKSERLYSELFSSQAFVDAHNELQDMPPEPGCTHPRAIAGLCLMSDSAHLTDTGSAHIHPFNVAFANESMYSRGKPSNHSVHPVMHLPAVCRSCHRSSRKLSGKSRAKGNTVFTQCRREYFQGALKLLFDAKFWDMYAHGRVVKCGDGVTRRLYLRLFVYSADYPEKVLIATIRDGGGCPCPRCLIPKAELCNMGTLEDLDARSKRRRVDDRPRRAKVKRARQYLREGFASTYVGIENELKEESYVPVENAFSVTEAGVRLNVFDLLTVDLMHEIELGVWMALLAHLIRILYAIDPGKVNILNTRCALRPYQVCV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.24
4 0.27
5 0.27
6 0.27
7 0.27
8 0.31
9 0.37
10 0.41
11 0.44
12 0.44
13 0.44
14 0.49
15 0.57
16 0.63
17 0.59
18 0.63
19 0.64
20 0.67
21 0.68
22 0.62
23 0.57
24 0.53
25 0.5
26 0.41
27 0.38
28 0.31
29 0.33
30 0.35
31 0.31
32 0.25
33 0.22
34 0.25
35 0.21
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.2
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.21
45 0.19
46 0.16
47 0.21
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.22
52 0.28
53 0.3
54 0.3
55 0.3
56 0.24
57 0.29
58 0.3
59 0.3
60 0.29
61 0.3
62 0.31
63 0.27
64 0.3
65 0.28
66 0.29
67 0.34
68 0.34
69 0.34
70 0.34
71 0.36
72 0.35
73 0.32
74 0.31
75 0.27
76 0.22
77 0.18
78 0.18
79 0.14
80 0.17
81 0.16
82 0.12
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.14
87 0.14
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.18
97 0.21
98 0.22
99 0.22
100 0.22
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.19
105 0.17
106 0.14
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.17
140 0.16
141 0.2
142 0.26
143 0.33
144 0.34
145 0.38
146 0.38
147 0.36
148 0.37
149 0.35
150 0.29
151 0.22
152 0.2
153 0.16
154 0.2
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.22
159 0.25
160 0.33
161 0.38
162 0.41
163 0.45
164 0.56
165 0.63
166 0.67
167 0.67
168 0.69
169 0.73
170 0.69
171 0.71
172 0.64
173 0.58
174 0.52
175 0.5
176 0.48
177 0.44
178 0.45
179 0.39
180 0.43
181 0.4
182 0.39
183 0.39
184 0.33
185 0.3
186 0.28
187 0.31
188 0.28
189 0.28
190 0.27
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.16
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.15
215 0.17
216 0.2
217 0.19
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.18
222 0.18
223 0.16
224 0.12
225 0.16
226 0.15
227 0.17
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.15
244 0.17
245 0.18
246 0.18
247 0.19
248 0.2
249 0.24
250 0.27
251 0.26
252 0.28
253 0.34
254 0.37
255 0.39
256 0.41
257 0.37
258 0.35
259 0.3
260 0.25
261 0.19
262 0.14
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.17
269 0.24
270 0.27
271 0.32
272 0.4
273 0.49
274 0.56
275 0.66
276 0.73
277 0.77
278 0.84
279 0.87
280 0.87
281 0.82
282 0.81
283 0.8
284 0.8
285 0.79
286 0.79
287 0.79
288 0.76
289 0.83
290 0.8
291 0.74
292 0.65
293 0.57
294 0.47
295 0.41
296 0.35
297 0.25
298 0.18
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.06
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.18
364 0.19
365 0.19
366 0.22
367 0.24
368 0.26
369 0.28
370 0.31
371 0.29
372 0.31
373 0.33
374 0.34