Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2G4SFP5

Protein Details
Accession A0A2G4SFP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-161HERNERWTWRRLKKRRDDRIAYIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-225AKPKLRREKARLAAIEKKRKKEEAERK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026847  VPS13  
IPR031646  VPS13_extend_chorein  
Pfam View protein in Pfam  
PF16908  VPS13  
Amino Acid Sequences MEARLATLESLSIYWDTNIDSIADDTEHESFKALIATKENVPKEHQYVLKLVSGTGRVKFNKQFGSGVPKFEASLLFDELSFTVDNEQYRDTVLMIDLFHSYLKKQKYKDLRPPSDMTPKTHPLEYFRFAGNAVLSEIHERNERWTWRRLKKRRDDRIAYINCYVNRKLDRATPDELEQLENLERELSFEDLRFYRSLAKPKLRREKARLAAIEKKRKKEEAERKASQGWSISSWWSGSSSATGKGQPSGEADDDLVITEEQKQKFYDVIDYDADKATIAASVDLPKGVIWPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.18
23 0.21
24 0.26
25 0.33
26 0.35
27 0.33
28 0.36
29 0.39
30 0.39
31 0.42
32 0.4
33 0.35
34 0.36
35 0.36
36 0.35
37 0.29
38 0.26
39 0.22
40 0.24
41 0.24
42 0.24
43 0.28
44 0.27
45 0.33
46 0.38
47 0.41
48 0.42
49 0.42
50 0.4
51 0.36
52 0.45
53 0.4
54 0.38
55 0.34
56 0.29
57 0.27
58 0.26
59 0.24
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.11
69 0.08
70 0.09
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.13
90 0.2
91 0.25
92 0.27
93 0.35
94 0.45
95 0.54
96 0.64
97 0.69
98 0.69
99 0.69
100 0.7
101 0.67
102 0.67
103 0.59
104 0.53
105 0.48
106 0.47
107 0.44
108 0.42
109 0.38
110 0.33
111 0.35
112 0.34
113 0.29
114 0.24
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.15
119 0.11
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.14
129 0.19
130 0.22
131 0.23
132 0.31
133 0.4
134 0.47
135 0.58
136 0.64
137 0.69
138 0.77
139 0.84
140 0.86
141 0.86
142 0.83
143 0.77
144 0.79
145 0.72
146 0.64
147 0.56
148 0.49
149 0.41
150 0.39
151 0.34
152 0.28
153 0.27
154 0.25
155 0.23
156 0.25
157 0.27
158 0.28
159 0.3
160 0.27
161 0.26
162 0.27
163 0.26
164 0.22
165 0.18
166 0.15
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.19
183 0.23
184 0.31
185 0.37
186 0.46
187 0.51
188 0.61
189 0.72
190 0.73
191 0.78
192 0.77
193 0.79
194 0.78
195 0.79
196 0.73
197 0.68
198 0.68
199 0.69
200 0.72
201 0.68
202 0.68
203 0.65
204 0.65
205 0.66
206 0.67
207 0.68
208 0.68
209 0.72
210 0.68
211 0.67
212 0.67
213 0.61
214 0.52
215 0.44
216 0.34
217 0.27
218 0.25
219 0.22
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.14
224 0.13
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.17
230 0.19
231 0.18
232 0.21
233 0.21
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.08
245 0.08
246 0.14
247 0.2
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.24
252 0.26
253 0.27
254 0.28
255 0.23
256 0.26
257 0.27
258 0.27
259 0.28
260 0.27
261 0.25
262 0.18
263 0.16
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.1
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.12