Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0D0B1

Protein Details
Accession J0D0B1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-59GSQPRARRPAPYGRRPQTKDADAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 7, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR032710  NTF2-like_dom_sf  
IPR018222  Nuclear_transport_factor_2_euk  
IPR030217  NXF_fam  
IPR005637  TAP_C_dom  
IPR009060  UBA-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG adl:AURDEDRAFT_92212  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03943  TAP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50177  NTF2_DOMAIN  
PS51281  TAP_C  
CDD cd14342  UBA_TAP-C  
Amino Acid Sequences MIPAPSSQARPPKHAFSKAVRGIMDQSGDTQMKDSTGSQPRARRPAPYGRRPQTKDADAMQVEKPGRAGQSTPKLSSRLSMTGRRPGSDPRAVAATKSRLPAHEMWREFIKSRYNAQARFLDLSKWSNDPILKKYHLSPPGSPGSTGKEGQVIFKLAKALNPTPLTISFANNGLTSLTPLISLDHFLPDTRNISLEGNELKTFRDVEPFASNRKRLNKLRELILIGNPLREGFLKSGRAEHYQSEIIRRFPTLEILDGSTIAKISFDAPSTSAAEAAAVPIPQATTFPVAMNPGLIAPDVQTLVGEFLTRFFGYFDNSRSSLAAIYDPNATFSYSVNTAIPARAKVQGLHNSKDYPNQRKLEWSQWLTGSRNLSRARIDQAMEALHMGTAQIGEALAKIPATRHDLTKGGTFVADATTIDGAPCPGGVLLKISVHGQFTEVSCEGVRSFDRTFILAPATPGTPAHAAGWPVVILSDQLVIRALSSCEAWAPGPLTVQSVEGEQPPPPVLDAILAGLPEQQRVLVMELMARTRLVTQAAGQCLEGNGWDLGKALANFEAVKNDLPREAFVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.66
3 0.65
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.6
8 0.54
9 0.49
10 0.46
11 0.4
12 0.29
13 0.25
14 0.26
15 0.26
16 0.24
17 0.22
18 0.19
19 0.17
20 0.19
21 0.19
22 0.22
23 0.3
24 0.37
25 0.42
26 0.5
27 0.58
28 0.66
29 0.66
30 0.63
31 0.61
32 0.65
33 0.69
34 0.71
35 0.74
36 0.74
37 0.83
38 0.82
39 0.84
40 0.81
41 0.75
42 0.7
43 0.63
44 0.61
45 0.52
46 0.5
47 0.42
48 0.4
49 0.36
50 0.31
51 0.29
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.22
56 0.25
57 0.35
58 0.39
59 0.41
60 0.42
61 0.43
62 0.42
63 0.43
64 0.39
65 0.36
66 0.37
67 0.42
68 0.43
69 0.5
70 0.52
71 0.5
72 0.47
73 0.47
74 0.49
75 0.47
76 0.43
77 0.36
78 0.39
79 0.38
80 0.37
81 0.36
82 0.34
83 0.31
84 0.35
85 0.35
86 0.31
87 0.36
88 0.41
89 0.42
90 0.45
91 0.43
92 0.41
93 0.44
94 0.46
95 0.41
96 0.39
97 0.39
98 0.34
99 0.37
100 0.45
101 0.47
102 0.46
103 0.5
104 0.49
105 0.44
106 0.44
107 0.4
108 0.33
109 0.29
110 0.3
111 0.27
112 0.24
113 0.22
114 0.23
115 0.25
116 0.27
117 0.28
118 0.32
119 0.33
120 0.33
121 0.37
122 0.41
123 0.45
124 0.45
125 0.43
126 0.42
127 0.47
128 0.45
129 0.41
130 0.34
131 0.33
132 0.33
133 0.31
134 0.26
135 0.23
136 0.22
137 0.23
138 0.24
139 0.2
140 0.17
141 0.17
142 0.2
143 0.16
144 0.18
145 0.22
146 0.21
147 0.26
148 0.27
149 0.26
150 0.25
151 0.25
152 0.27
153 0.22
154 0.22
155 0.16
156 0.16
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.14
191 0.17
192 0.15
193 0.17
194 0.23
195 0.24
196 0.3
197 0.34
198 0.36
199 0.37
200 0.44
201 0.5
202 0.51
203 0.59
204 0.6
205 0.58
206 0.6
207 0.57
208 0.53
209 0.46
210 0.4
211 0.36
212 0.27
213 0.24
214 0.2
215 0.16
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.09
220 0.13
221 0.16
222 0.17
223 0.21
224 0.22
225 0.25
226 0.25
227 0.24
228 0.23
229 0.24
230 0.24
231 0.26
232 0.26
233 0.24
234 0.23
235 0.23
236 0.21
237 0.18
238 0.21
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.09
312 0.09
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.1
322 0.11
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.21
334 0.29
335 0.33
336 0.34
337 0.34
338 0.34
339 0.34
340 0.4
341 0.42
342 0.41
343 0.44
344 0.44
345 0.43
346 0.47
347 0.5
348 0.5
349 0.5
350 0.44
351 0.39
352 0.4
353 0.43
354 0.38
355 0.37
356 0.35
357 0.28
358 0.32
359 0.31
360 0.3
361 0.29
362 0.29
363 0.3
364 0.28
365 0.28
366 0.22
367 0.22
368 0.2
369 0.17
370 0.15
371 0.11
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.09
388 0.15
389 0.16
390 0.18
391 0.21
392 0.23
393 0.25
394 0.28
395 0.25
396 0.19
397 0.18
398 0.16
399 0.13
400 0.12
401 0.1
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.16
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.15
433 0.15
434 0.14
435 0.15
436 0.17
437 0.18
438 0.18
439 0.19
440 0.18
441 0.2
442 0.17
443 0.17
444 0.15
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.15
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.12
457 0.1
458 0.1
459 0.08
460 0.06
461 0.06
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.11
469 0.11
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.11
475 0.1
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.14
482 0.13
483 0.14
484 0.12
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.16
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.14
495 0.12
496 0.11
497 0.11
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.12
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.12
509 0.14
510 0.12
511 0.12
512 0.13
513 0.15
514 0.17
515 0.17
516 0.15
517 0.13
518 0.13
519 0.15
520 0.14
521 0.13
522 0.18
523 0.23
524 0.26
525 0.26
526 0.25
527 0.24
528 0.23
529 0.22
530 0.17
531 0.13
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.13
541 0.14
542 0.15
543 0.16
544 0.19
545 0.17
546 0.21
547 0.22
548 0.23
549 0.25
550 0.25