FuNGI

J0D9T5

Protein Details

Accession

J0D9T5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
573-598	LSTKNLKIPKGLKRKLIRKYIGPFEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
582-587	KGLKRK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9, cysk 4, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	adl:AURDEDRAFT_36803 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

GSGYISQGEDLSTARVITFWSGKFNSAQQNYPVHERELLAIVESLKRFRPQLHGVKFRICTDHKSLIHFMSQKNLSQRQMRWLYVMNEFDFTVEYIPGETNVLADGLSRIYSDDQPGTVRATSEIICDDSDSSESDGDTESESVPLSAPVFVGRAVLLTNDDEHNAPRRSARVRGEMAPPVPEIRLRRPNRPQQPSAAPETAIETEETVLGPDETEGESDIDSQRNSTLVSDEEPETEGGTIGKVVSAMSPSLNGDERIYMKSGPTERRLLCIPDISVKGKRLRPELIDQAHSILAHLGAHKTLLYLRQDVWWKRMVDDVRVFVESCHVCRTTKDNTQKPMGLLQTLPVPVRPWQVIGIDFIGPLPVSQARHGRYDRICTIIDHFTSMVHLVPARTTYTAPDMAELLFHSVYKLHGLPEAIVSDHDVLFTSPFWTRLHELTGVELRMSTAYHPQTDGATERANRTVGQMVRQCISDTQKDWAAKLPAIEFALNSSTSATTGFSPFFMNYGHHPNALTWQRVSTYPGVERFAETMREALFTAHDAIISARVAQTTQANKHRQAATFKTGDQVYLSTKNLKIPKGLKRKLIRKYIGPFEISETV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.1
4	0.14
5	0.18
6	0.17
7	0.24
8	0.25
9	0.27
10	0.3
11	0.35
12	0.41
13	0.39
14	0.42
15	0.4
16	0.46
17	0.47
18	0.52
19	0.49
20	0.41
21	0.4
22	0.36
23	0.33
24	0.3
25	0.27
26	0.2
27	0.19
28	0.18
29	0.2
30	0.21
31	0.21
32	0.21
33	0.24
34	0.25
35	0.28
36	0.35
37	0.39
38	0.49
39	0.56
40	0.62
41	0.63
42	0.68
43	0.68
44	0.62
45	0.61
46	0.53
47	0.49
48	0.48
49	0.54
50	0.48
51	0.51
52	0.51
53	0.46
54	0.5
55	0.48
56	0.41
57	0.4
58	0.41
59	0.4
60	0.44
61	0.48
62	0.47
63	0.5
64	0.52
65	0.53
66	0.57
67	0.54
68	0.48
69	0.48
70	0.45
71	0.43
72	0.45
73	0.35
74	0.3
75	0.29
76	0.26
77	0.21
78	0.18
79	0.13
80	0.1
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.08
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.1
98	0.12
99	0.14
100	0.15
101	0.15
102	0.16
103	0.18
104	0.19
105	0.17
106	0.16
107	0.14
108	0.15
109	0.14
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.12
114	0.13
115	0.12
116	0.11
117	0.12
118	0.11
119	0.11
120	0.1
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.09
125	0.1
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.12
151	0.2
152	0.2
153	0.2
154	0.2
155	0.25
156	0.28
157	0.35
158	0.38
159	0.38
160	0.41
161	0.43
162	0.46
163	0.45
164	0.42
165	0.37
166	0.32
167	0.25
168	0.22
169	0.22
170	0.22
171	0.26
172	0.35
173	0.37
174	0.46
175	0.55
176	0.65
177	0.71
178	0.76
179	0.7
180	0.67
181	0.71
182	0.65
183	0.62
184	0.52
185	0.42
186	0.34
187	0.33
188	0.27
189	0.2
190	0.16
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.09
210	0.1
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.09
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.11
245	0.12
246	0.13
247	0.11
248	0.11
249	0.14
250	0.19
251	0.22
252	0.24
253	0.29
254	0.28
255	0.31
256	0.32
257	0.3
258	0.26
259	0.23
260	0.2
261	0.18
262	0.2
263	0.2
264	0.21
265	0.23
266	0.28
267	0.3
268	0.33
269	0.32
270	0.33
271	0.33
272	0.35
273	0.39
274	0.36
275	0.35
276	0.31
277	0.29
278	0.26
279	0.23
280	0.18
281	0.1
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.12
295	0.16
296	0.22
297	0.23
298	0.25
299	0.27
300	0.26
301	0.25
302	0.3
303	0.27
304	0.26
305	0.27
306	0.26
307	0.21
308	0.22
309	0.21
310	0.16
311	0.2
312	0.16
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.15
317	0.16
318	0.21
319	0.22
320	0.3
321	0.38
322	0.41
323	0.45
324	0.48
325	0.49
326	0.45
327	0.43
328	0.35
329	0.26
330	0.2
331	0.17
332	0.16
333	0.15
334	0.14
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.15
339	0.14
340	0.13
341	0.13
342	0.14
343	0.14
344	0.14
345	0.13
346	0.11
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.08
355	0.11
356	0.17
357	0.18
358	0.25
359	0.26
360	0.31
361	0.31
362	0.37
363	0.36
364	0.33
365	0.32
366	0.27
367	0.3
368	0.27
369	0.25
370	0.19
371	0.18
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.1
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.13
386	0.15
387	0.15
388	0.14
389	0.14
390	0.12
391	0.12
392	0.11
393	0.1
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.1
400	0.1
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.1
420	0.11
421	0.14
422	0.16
423	0.17
424	0.2
425	0.2
426	0.19
427	0.21
428	0.24
429	0.21
430	0.18
431	0.17
432	0.14
433	0.12
434	0.13
435	0.1
436	0.14
437	0.16
438	0.17
439	0.18
440	0.18
441	0.18
442	0.2
443	0.2
444	0.16
445	0.18
446	0.19
447	0.2
448	0.22
449	0.23
450	0.21
451	0.21
452	0.26
453	0.23
454	0.28
455	0.31
456	0.31
457	0.31
458	0.31
459	0.3
460	0.27
461	0.31
462	0.29
463	0.26
464	0.27
465	0.32
466	0.32
467	0.32
468	0.34
469	0.32
470	0.28
471	0.28
472	0.25
473	0.22
474	0.23
475	0.22
476	0.16
477	0.15
478	0.16
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.1
486	0.09
487	0.11
488	0.12
489	0.11
490	0.13
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.15
496	0.23
497	0.24
498	0.23
499	0.24
500	0.23
501	0.31
502	0.35
503	0.34
504	0.27
505	0.27
506	0.28
507	0.28
508	0.32
509	0.26
510	0.26
511	0.28
512	0.31
513	0.32
514	0.31
515	0.31
516	0.29
517	0.28
518	0.26
519	0.21
520	0.2
521	0.18
522	0.18
523	0.17
524	0.15
525	0.14
526	0.13
527	0.15
528	0.13
529	0.12
530	0.11
531	0.12
532	0.13
533	0.13
534	0.12
535	0.09
536	0.1
537	0.1
538	0.12
539	0.18
540	0.23
541	0.32
542	0.4
543	0.46
544	0.49
545	0.57
546	0.61
547	0.59
548	0.6
549	0.59
550	0.58
551	0.55
552	0.52
553	0.49
554	0.44
555	0.4
556	0.33
557	0.28
558	0.25
559	0.27
560	0.29
561	0.29
562	0.3
563	0.37
564	0.42
565	0.42
566	0.45
567	0.49
568	0.57
569	0.62
570	0.67
571	0.69
572	0.74
573	0.81
574	0.82
575	0.85
576	0.81
577	0.79
578	0.8
579	0.8
580	0.75
581	0.67
582	0.59

J0D9T5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer