Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0WQ88

Protein Details
Accession J0WQ88    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-43VVVPQNVRRRDQPRPRARRRLGVRYKSAPRRLYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-39RRRDQPRPRARRRLGVRYKSAP
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
KEGG adl:AURDEDRAFT_117602  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MDLRADRAALVVVPQNVRRRDQPRPRARRRLGVRYKSAPRRLYVLIHDPPTVDVTHDAHPLSQPPSPAASPPPSPPPRITHQVARGDSLAGVALRYGVSVSALRRANGLWASDSIHLRAALVIPDGREPVPLPKPRRSVEHGHVRTSTELPLPSAADVVSSFSLTLPRLRLSLDPSESDAEHELLPLSLSARRRKSRPQLSMTAAPAPTNKQPSPIRGMVLPRAGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.33
3 0.36
4 0.39
5 0.46
6 0.49
7 0.56
8 0.64
9 0.69
10 0.73
11 0.8
12 0.87
13 0.89
14 0.89
15 0.89
16 0.87
17 0.87
18 0.87
19 0.85
20 0.82
21 0.8
22 0.84
23 0.83
24 0.83
25 0.76
26 0.66
27 0.62
28 0.57
29 0.51
30 0.46
31 0.45
32 0.41
33 0.4
34 0.39
35 0.34
36 0.32
37 0.3
38 0.24
39 0.17
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.15
51 0.15
52 0.17
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.23
59 0.32
60 0.32
61 0.34
62 0.36
63 0.36
64 0.38
65 0.43
66 0.43
67 0.4
68 0.45
69 0.49
70 0.47
71 0.44
72 0.39
73 0.32
74 0.29
75 0.22
76 0.15
77 0.07
78 0.06
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.03
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.09
97 0.09
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.12
117 0.19
118 0.26
119 0.31
120 0.37
121 0.43
122 0.44
123 0.49
124 0.49
125 0.49
126 0.5
127 0.57
128 0.52
129 0.49
130 0.48
131 0.44
132 0.41
133 0.35
134 0.28
135 0.19
136 0.17
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.19
159 0.24
160 0.24
161 0.23
162 0.25
163 0.26
164 0.25
165 0.25
166 0.22
167 0.17
168 0.15
169 0.14
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.16
177 0.24
178 0.33
179 0.4
180 0.45
181 0.55
182 0.65
183 0.72
184 0.76
185 0.75
186 0.74
187 0.75
188 0.76
189 0.68
190 0.63
191 0.53
192 0.45
193 0.39
194 0.36
195 0.36
196 0.37
197 0.34
198 0.37
199 0.41
200 0.45
201 0.51
202 0.49
203 0.45
204 0.42
205 0.47
206 0.45