Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2G4SEC0

Protein Details
Accession A0A2G4SEC0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
320-341SVTRINIQKNPKTKKNICNYLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 13.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences AKTCVVGNNKADDSIAIIKAFNDCKTGGTVSFPKSGTWYPKSLINVSGLNNVRIDFAGHIVLPPFDPKYKGGSAYLKIQGNNIHMSGGGTITGNGQSWYDNTAPIVFSATAKNSVLGNFRIINAPRGHIADVGSENVVYENIYLRTRSTNSNFHRNTDAWGTAWSKNIVLRNSEFTVGDDCTAISTGVTNLTVTNVKCVEGHGFSIGSLGRGTQPDYVKSVHFINNECHRCQNGIRIKTVPGGKGSIEDVRFQNVKLIAAENPIAITTHYWCEQNHNCNIDNSLSIKNVVIDNVSGSTSNKDMPVINIDCSKRGLCSGFSVTRINIQKNPKTKKNICNYLVGSDKIPYC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.23
7 0.26
8 0.22
9 0.2
10 0.18
11 0.19
12 0.22
13 0.24
14 0.19
15 0.23
16 0.28
17 0.29
18 0.34
19 0.33
20 0.3
21 0.33
22 0.38
23 0.4
24 0.38
25 0.38
26 0.34
27 0.39
28 0.43
29 0.4
30 0.37
31 0.32
32 0.31
33 0.29
34 0.36
35 0.32
36 0.29
37 0.28
38 0.26
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.22
56 0.24
57 0.26
58 0.29
59 0.32
60 0.32
61 0.37
62 0.42
63 0.39
64 0.37
65 0.37
66 0.36
67 0.33
68 0.32
69 0.26
70 0.19
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.11
75 0.08
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.12
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.16
103 0.15
104 0.16
105 0.15
106 0.15
107 0.19
108 0.19
109 0.23
110 0.21
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.2
115 0.16
116 0.16
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.12
133 0.14
134 0.19
135 0.22
136 0.29
137 0.33
138 0.43
139 0.43
140 0.43
141 0.45
142 0.4
143 0.38
144 0.31
145 0.28
146 0.18
147 0.19
148 0.2
149 0.18
150 0.19
151 0.17
152 0.15
153 0.16
154 0.2
155 0.18
156 0.18
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.18
162 0.15
163 0.16
164 0.13
165 0.12
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.06
179 0.09
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.11
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.18
205 0.17
206 0.18
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.21
211 0.25
212 0.34
213 0.37
214 0.36
215 0.36
216 0.32
217 0.33
218 0.32
219 0.35
220 0.35
221 0.34
222 0.36
223 0.36
224 0.36
225 0.39
226 0.41
227 0.33
228 0.26
229 0.24
230 0.21
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.19
235 0.2
236 0.19
237 0.22
238 0.23
239 0.21
240 0.24
241 0.2
242 0.2
243 0.18
244 0.19
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.12
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.23
260 0.3
261 0.36
262 0.4
263 0.41
264 0.41
265 0.4
266 0.42
267 0.34
268 0.3
269 0.25
270 0.22
271 0.19
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.13
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.23
292 0.22
293 0.24
294 0.29
295 0.29
296 0.3
297 0.32
298 0.3
299 0.23
300 0.25
301 0.25
302 0.2
303 0.24
304 0.3
305 0.3
306 0.32
307 0.34
308 0.31
309 0.37
310 0.42
311 0.41
312 0.41
313 0.47
314 0.53
315 0.6
316 0.69
317 0.7
318 0.75
319 0.79
320 0.82
321 0.84
322 0.86
323 0.79
324 0.78
325 0.72
326 0.68
327 0.63
328 0.55
329 0.46