Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0LDX2

Protein Details
Accession J0LDX2    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-282PTGPRDRDRDHRDSRDHREREBasic
306-334GYSSRHDSDRRRSDRDRERSRSPRRGSRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-296DHRERERDRGDRDRGDRDRG
299-299R
301-333RDRDRGYSSRHDSDRRRSDRDRERSRSPRRGSR
Subcellular Location(s) cysk 10, cyto 7.5, cyto_nucl 7, nucl 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
KEGG adl:AURDEDRAFT_117518  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRLAEMQRKLLEQMMGPEAMGLAVANFGWEDERTCRNFLCGTCPHILFTNTKMDLGACPKSHTERLRTEYLAAKEKNANDPIFAKIQNEYEQNIFAFVDECDRRIRAAHRRLEKTPEENAKTTNLMREIGEIELAIQGGMEKIETLGEQGKVEESMQEMSAVEALKAEKSEKERELQQLTETSGASGHQKLRVCDVCGAYLSVLDSDRRLADHFGGKMHLGYHELRNLLKKFAEDRAARKTAPLGPPAGVSTVAMGPPSAPTGPRDRDRDHRDSRDHRERERDRGDRDRGDRDRGYDRDRDRDRGYSSRHDSDRRRSDRDRERSRSPRRGSRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.23
4 0.21
5 0.19
6 0.15
7 0.13
8 0.11
9 0.07
10 0.04
11 0.04
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.04
16 0.06
17 0.06
18 0.09
19 0.13
20 0.2
21 0.23
22 0.25
23 0.26
24 0.27
25 0.31
26 0.29
27 0.33
28 0.3
29 0.32
30 0.35
31 0.35
32 0.34
33 0.33
34 0.34
35 0.28
36 0.28
37 0.32
38 0.27
39 0.27
40 0.26
41 0.23
42 0.24
43 0.28
44 0.3
45 0.22
46 0.24
47 0.27
48 0.32
49 0.39
50 0.41
51 0.42
52 0.45
53 0.49
54 0.52
55 0.5
56 0.48
57 0.47
58 0.46
59 0.48
60 0.4
61 0.38
62 0.38
63 0.39
64 0.43
65 0.42
66 0.37
67 0.31
68 0.32
69 0.31
70 0.3
71 0.28
72 0.22
73 0.19
74 0.22
75 0.23
76 0.23
77 0.22
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.15
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.25
94 0.29
95 0.38
96 0.44
97 0.52
98 0.57
99 0.59
100 0.64
101 0.61
102 0.55
103 0.54
104 0.55
105 0.49
106 0.45
107 0.44
108 0.38
109 0.36
110 0.32
111 0.28
112 0.21
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.12
158 0.17
159 0.18
160 0.2
161 0.23
162 0.28
163 0.3
164 0.28
165 0.25
166 0.22
167 0.21
168 0.2
169 0.16
170 0.11
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.23
180 0.25
181 0.25
182 0.26
183 0.25
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.14
188 0.12
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.15
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.24
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.22
219 0.23
220 0.26
221 0.33
222 0.3
223 0.33
224 0.39
225 0.41
226 0.39
227 0.37
228 0.37
229 0.35
230 0.36
231 0.34
232 0.28
233 0.25
234 0.26
235 0.26
236 0.22
237 0.16
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.19
251 0.26
252 0.32
253 0.38
254 0.41
255 0.51
256 0.59
257 0.65
258 0.67
259 0.69
260 0.72
261 0.75
262 0.8
263 0.81
264 0.79
265 0.75
266 0.77
267 0.74
268 0.74
269 0.76
270 0.73
271 0.7
272 0.73
273 0.74
274 0.72
275 0.72
276 0.72
277 0.67
278 0.68
279 0.63
280 0.58
281 0.58
282 0.55
283 0.55
284 0.53
285 0.54
286 0.56
287 0.59
288 0.61
289 0.57
290 0.58
291 0.59
292 0.58
293 0.59
294 0.59
295 0.62
296 0.63
297 0.65
298 0.68
299 0.7
300 0.73
301 0.78
302 0.75
303 0.76
304 0.75
305 0.79
306 0.81
307 0.83
308 0.83
309 0.8
310 0.83
311 0.85
312 0.89
313 0.89
314 0.87