Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HMT5

Protein Details
Accession A0A1X2HMT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-149SASSPTAKRQRKQAPKPILPKSTHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-75RSSKAKESTAEGGRGKGRGGRVARSSSGRPKKS
218-223ARRAAR
237-250PTKRIKEPKHPMRW
493-502KAMRTFRPKK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MGYTYSQWLKQVSQSNPARPKPGSGRGHGTTTPKSTARSTTSRSSKAKESTAEGGRGKGRGGRVARSSSGRPKKSATPAPAAAAGTDLAPSTLTEPAPVDTSTAADRPANASVKTKRTRSQLPNDSASSPTAKRQRKQAPKPILPKSTHTPSSSTSVATTSASTSTSTSITATTATTTAATTAATTTKTKAPQRLKRRPEVSAAAETVPKAESSVRPARRAAREPAAVVKSDEPAQPTKRIKEPKHPMRWSLKDAERSEGRIRHLLGGKHKLQYILKGHADQGRTQIGVEETEELTNMWACEFEPRQSTDANPGLVAVCGGTSLLLLDVQQGRYVKKYSHNEPKEEFLCVAWTLLRGPDELQDDKAPEDAHCSVVAVAGRLGSIKLINTLHNECYDFLMGHEKQVHRIQFSREHPRWLLSASDDMTIRLWDIGAPHANQAACLAQFQSPPTAGVPSCFGFSADLSLLVAGCRNGTLLQFMPTPADLKKLAPGKAMRTFRPKKRFPAGDEWHEGYVDDVYVSHSGNSVVSRATEDEEILVWRATKSTASDADVAISFEWPDSEGFSGLRFKVFESAKRRALMAGDYEGRILVYDMNRTSKTLDDGSFEQFSPDQTLSHPQSNGLVRDVCLSPNGQYLVSVDSNNTVFIWKSEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.57
3 0.64
4 0.66
5 0.66
6 0.58
7 0.63
8 0.61
9 0.64
10 0.61
11 0.58
12 0.62
13 0.58
14 0.63
15 0.59
16 0.56
17 0.52
18 0.5
19 0.5
20 0.44
21 0.44
22 0.42
23 0.44
24 0.45
25 0.46
26 0.47
27 0.52
28 0.58
29 0.63
30 0.65
31 0.63
32 0.65
33 0.64
34 0.64
35 0.58
36 0.54
37 0.54
38 0.53
39 0.55
40 0.48
41 0.46
42 0.43
43 0.41
44 0.36
45 0.32
46 0.3
47 0.31
48 0.34
49 0.36
50 0.39
51 0.43
52 0.45
53 0.46
54 0.51
55 0.54
56 0.6
57 0.58
58 0.56
59 0.56
60 0.6
61 0.65
62 0.67
63 0.62
64 0.6
65 0.58
66 0.57
67 0.55
68 0.46
69 0.36
70 0.28
71 0.21
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.13
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.15
95 0.2
96 0.22
97 0.21
98 0.28
99 0.33
100 0.42
101 0.49
102 0.52
103 0.52
104 0.57
105 0.66
106 0.68
107 0.72
108 0.72
109 0.72
110 0.72
111 0.68
112 0.62
113 0.53
114 0.46
115 0.39
116 0.31
117 0.32
118 0.36
119 0.42
120 0.43
121 0.52
122 0.61
123 0.68
124 0.77
125 0.8
126 0.81
127 0.82
128 0.88
129 0.87
130 0.84
131 0.76
132 0.71
133 0.68
134 0.65
135 0.61
136 0.53
137 0.47
138 0.41
139 0.43
140 0.39
141 0.32
142 0.24
143 0.2
144 0.19
145 0.17
146 0.15
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.17
175 0.24
176 0.29
177 0.37
178 0.46
179 0.54
180 0.65
181 0.73
182 0.76
183 0.79
184 0.79
185 0.73
186 0.68
187 0.65
188 0.58
189 0.51
190 0.44
191 0.35
192 0.32
193 0.28
194 0.23
195 0.17
196 0.12
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.17
201 0.27
202 0.29
203 0.32
204 0.35
205 0.42
206 0.47
207 0.5
208 0.48
209 0.46
210 0.44
211 0.42
212 0.45
213 0.39
214 0.33
215 0.29
216 0.25
217 0.19
218 0.2
219 0.2
220 0.16
221 0.2
222 0.22
223 0.29
224 0.32
225 0.35
226 0.4
227 0.49
228 0.51
229 0.56
230 0.65
231 0.67
232 0.74
233 0.73
234 0.72
235 0.72
236 0.73
237 0.67
238 0.64
239 0.59
240 0.56
241 0.54
242 0.52
243 0.44
244 0.43
245 0.44
246 0.39
247 0.37
248 0.32
249 0.31
250 0.31
251 0.34
252 0.33
253 0.34
254 0.38
255 0.39
256 0.38
257 0.38
258 0.36
259 0.32
260 0.35
261 0.32
262 0.31
263 0.29
264 0.28
265 0.3
266 0.3
267 0.31
268 0.25
269 0.24
270 0.2
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.19
297 0.2
298 0.18
299 0.16
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.05
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.02
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.14
322 0.14
323 0.21
324 0.27
325 0.33
326 0.43
327 0.46
328 0.49
329 0.49
330 0.52
331 0.44
332 0.4
333 0.32
334 0.21
335 0.18
336 0.14
337 0.13
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.1
346 0.13
347 0.13
348 0.15
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.16
353 0.13
354 0.09
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.04
372 0.07
373 0.08
374 0.1
375 0.14
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.12
384 0.1
385 0.16
386 0.15
387 0.17
388 0.21
389 0.2
390 0.24
391 0.29
392 0.3
393 0.25
394 0.28
395 0.3
396 0.34
397 0.4
398 0.46
399 0.43
400 0.46
401 0.45
402 0.44
403 0.4
404 0.33
405 0.27
406 0.18
407 0.2
408 0.16
409 0.17
410 0.15
411 0.14
412 0.14
413 0.12
414 0.11
415 0.08
416 0.07
417 0.05
418 0.06
419 0.09
420 0.11
421 0.12
422 0.12
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.14
427 0.12
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.12
440 0.12
441 0.14
442 0.12
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.1
447 0.1
448 0.12
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.05
457 0.05
458 0.04
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.09
463 0.09
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.12
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.2
475 0.24
476 0.25
477 0.29
478 0.32
479 0.35
480 0.42
481 0.46
482 0.46
483 0.51
484 0.59
485 0.63
486 0.71
487 0.71
488 0.71
489 0.76
490 0.78
491 0.74
492 0.76
493 0.73
494 0.7
495 0.7
496 0.63
497 0.54
498 0.47
499 0.39
500 0.29
501 0.22
502 0.14
503 0.08
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.11
518 0.13
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.12
525 0.12
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.11
531 0.13
532 0.17
533 0.19
534 0.21
535 0.22
536 0.22
537 0.23
538 0.22
539 0.2
540 0.15
541 0.12
542 0.1
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.11
552 0.16
553 0.15
554 0.17
555 0.16
556 0.16
557 0.23
558 0.26
559 0.32
560 0.35
561 0.43
562 0.46
563 0.47
564 0.47
565 0.41
566 0.4
567 0.35
568 0.31
569 0.29
570 0.26
571 0.25
572 0.25
573 0.23
574 0.21
575 0.18
576 0.14
577 0.13
578 0.12
579 0.17
580 0.19
581 0.25
582 0.26
583 0.27
584 0.28
585 0.26
586 0.29
587 0.28
588 0.27
589 0.26
590 0.28
591 0.32
592 0.33
593 0.3
594 0.28
595 0.24
596 0.24
597 0.24
598 0.22
599 0.18
600 0.18
601 0.27
602 0.3
603 0.35
604 0.34
605 0.3
606 0.36
607 0.4
608 0.4
609 0.35
610 0.32
611 0.27
612 0.31
613 0.31
614 0.25
615 0.22
616 0.21
617 0.18
618 0.22
619 0.23
620 0.18
621 0.18
622 0.18
623 0.22
624 0.22
625 0.21
626 0.16
627 0.19
628 0.19
629 0.19
630 0.18
631 0.14
632 0.13