Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HJT4

Protein Details
Accession A0A1X2HJT4    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-83GFIKEYSRRRFPPKSARSSPRPSAPHydrophilic
163-189NDQNEKQQQDQQKKKKKKNEMTLETALHydrophilic
445-469GEHQREGKGGRRRRIQRVQYDQDDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-75PPKSAR
175-180KKKKKK
451-458GKGGRRRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MASLEEWATDQLGVFLGALGFDAEAIQMHILPDLARLDTPEALMNHLTDLLGTDPSALGFIKEYSRRRFPPKSARSSPRPSAPKVQTPPLPPSAPPQQPQQHVPSSSSNVFPSLPANANANTNHWPANINVYMKNKTEGDYVSSQKGKKQKSTTASTSAIAQNDQNEKQQQDQQKKKKKKNEMTLETALKELDIQTSTDSKRRPCQCQATKHPLLTVAPNCLNCGKIICTQEGTGPCTFCGTPVLSKEQQVALIAEAKRKRSEAKVQQNQQQQPRRAKAAPTPSVGYAAKAGGGFSYHTEIVDDQEEEERRKRAEAHKEKLLEYQRTSAKRTTVIDQATDFILPSDMSNPWLSPQERALQMKQQQANLKKLQNQGAAAKRRVMTLDIGSRQVTMQDHVSSESESEEEPQEIKAPTPARASADDGSAGTYANNPLLKGIHAPKFMGEHQREGKGGRRRRIQRVQYDQDDAEDDHELQFASRIADDKDVTFEPVSCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.05
7 0.05
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.04
12 0.05
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.18
28 0.17
29 0.19
30 0.2
31 0.18
32 0.16
33 0.16
34 0.14
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.07
46 0.07
47 0.09
48 0.15
49 0.23
50 0.3
51 0.36
52 0.45
53 0.51
54 0.6
55 0.67
56 0.7
57 0.74
58 0.77
59 0.8
60 0.81
61 0.84
62 0.84
63 0.84
64 0.81
65 0.79
66 0.76
67 0.7
68 0.71
69 0.68
70 0.69
71 0.66
72 0.66
73 0.63
74 0.61
75 0.62
76 0.57
77 0.52
78 0.43
79 0.44
80 0.46
81 0.46
82 0.44
83 0.47
84 0.49
85 0.51
86 0.55
87 0.55
88 0.52
89 0.48
90 0.49
91 0.44
92 0.42
93 0.4
94 0.37
95 0.31
96 0.26
97 0.25
98 0.22
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.21
106 0.21
107 0.23
108 0.23
109 0.22
110 0.22
111 0.19
112 0.2
113 0.17
114 0.23
115 0.23
116 0.22
117 0.25
118 0.29
119 0.32
120 0.32
121 0.34
122 0.28
123 0.26
124 0.27
125 0.23
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.29
130 0.32
131 0.32
132 0.34
133 0.41
134 0.41
135 0.45
136 0.49
137 0.51
138 0.54
139 0.61
140 0.61
141 0.6
142 0.56
143 0.48
144 0.45
145 0.39
146 0.33
147 0.26
148 0.22
149 0.2
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.25
154 0.25
155 0.28
156 0.34
157 0.37
158 0.43
159 0.52
160 0.59
161 0.67
162 0.76
163 0.82
164 0.86
165 0.89
166 0.88
167 0.88
168 0.89
169 0.85
170 0.82
171 0.79
172 0.71
173 0.6
174 0.5
175 0.39
176 0.28
177 0.21
178 0.14
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.13
184 0.14
185 0.18
186 0.21
187 0.23
188 0.31
189 0.37
190 0.43
191 0.46
192 0.56
193 0.6
194 0.67
195 0.72
196 0.73
197 0.71
198 0.64
199 0.57
200 0.48
201 0.4
202 0.36
203 0.28
204 0.23
205 0.21
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.2
210 0.14
211 0.14
212 0.12
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.17
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.17
222 0.15
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.11
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.12
231 0.18
232 0.17
233 0.18
234 0.19
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.14
239 0.09
240 0.13
241 0.13
242 0.17
243 0.19
244 0.2
245 0.21
246 0.22
247 0.24
248 0.24
249 0.34
250 0.39
251 0.48
252 0.55
253 0.6
254 0.66
255 0.72
256 0.72
257 0.71
258 0.69
259 0.65
260 0.64
261 0.62
262 0.6
263 0.54
264 0.51
265 0.48
266 0.5
267 0.47
268 0.41
269 0.39
270 0.34
271 0.35
272 0.32
273 0.26
274 0.17
275 0.13
276 0.12
277 0.1
278 0.09
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.12
293 0.14
294 0.16
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.2
299 0.25
300 0.3
301 0.39
302 0.47
303 0.5
304 0.55
305 0.57
306 0.56
307 0.58
308 0.56
309 0.5
310 0.42
311 0.42
312 0.42
313 0.42
314 0.45
315 0.4
316 0.36
317 0.35
318 0.36
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.29
323 0.27
324 0.25
325 0.21
326 0.19
327 0.15
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.17
339 0.18
340 0.17
341 0.2
342 0.23
343 0.28
344 0.32
345 0.32
346 0.34
347 0.4
348 0.46
349 0.47
350 0.46
351 0.49
352 0.51
353 0.57
354 0.56
355 0.55
356 0.53
357 0.56
358 0.57
359 0.53
360 0.49
361 0.49
362 0.51
363 0.53
364 0.49
365 0.48
366 0.42
367 0.4
368 0.38
369 0.32
370 0.26
371 0.24
372 0.3
373 0.27
374 0.29
375 0.28
376 0.27
377 0.25
378 0.25
379 0.21
380 0.15
381 0.16
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.18
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.19
400 0.2
401 0.22
402 0.25
403 0.27
404 0.26
405 0.28
406 0.32
407 0.27
408 0.27
409 0.24
410 0.2
411 0.19
412 0.16
413 0.14
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.13
418 0.14
419 0.12
420 0.14
421 0.14
422 0.15
423 0.2
424 0.26
425 0.29
426 0.3
427 0.31
428 0.31
429 0.35
430 0.39
431 0.43
432 0.38
433 0.4
434 0.43
435 0.46
436 0.46
437 0.45
438 0.49
439 0.48
440 0.55
441 0.56
442 0.61
443 0.66
444 0.75
445 0.83
446 0.85
447 0.85
448 0.87
449 0.87
450 0.83
451 0.8
452 0.69
453 0.6
454 0.53
455 0.43
456 0.34
457 0.27
458 0.22
459 0.16
460 0.17
461 0.15
462 0.12
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.15
469 0.2
470 0.21
471 0.2
472 0.24
473 0.23
474 0.26
475 0.24