Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HIY5

Protein Details
Accession A0A1X2HIY5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-266FVNEPKPVKPKNKKVQQKRTLRSFLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-254KPKNKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 12.5, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLRQTTRISHNVVAYSKKHAQTGAISAWHRQAHTVTNQTLDFMRPETNAPVAAKTLTNQLRQALTQNDQDATWETYVKLKEANHLHYVSAELHSMTLRSFRLQDLQGYGKEARDTMGLRINFVREQMRKNDCALDIRDYNHLLNFYGRTGKIQACYDIWKEMLNQRRSHGPDWHVRPTLHTYNLYMRAMIQAGKPGKAFGVYKSMREHKVKPNAFTYATLIDALGRRGDHEAADRMFKDAFVNEPKPVKPKNKKVQQKRTLRSFLSSEPIPAPELTATQRAATSARLLPKEQTLKPTDGVFSALVDAHGRAGNMSGMSHVFKSMMPSYHVKPTLDIYNKLVKWYCHHDQMEAARRIFYEMDSSAIKPNVSTFNYLMRAQALKHKRAGIAEKIMNTMKQIYNLSPLQSMYRVLIRSHTSKKRESEAERLYREYVAAKQSQNDRLRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.47
4 0.45
5 0.44
6 0.4
7 0.39
8 0.37
9 0.41
10 0.37
11 0.36
12 0.34
13 0.35
14 0.4
15 0.39
16 0.35
17 0.32
18 0.29
19 0.3
20 0.36
21 0.41
22 0.36
23 0.37
24 0.37
25 0.36
26 0.35
27 0.3
28 0.24
29 0.19
30 0.2
31 0.17
32 0.19
33 0.21
34 0.21
35 0.23
36 0.22
37 0.21
38 0.2
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.25
43 0.27
44 0.29
45 0.3
46 0.32
47 0.33
48 0.33
49 0.37
50 0.33
51 0.31
52 0.32
53 0.32
54 0.3
55 0.27
56 0.28
57 0.26
58 0.24
59 0.21
60 0.17
61 0.15
62 0.2
63 0.21
64 0.2
65 0.21
66 0.19
67 0.26
68 0.32
69 0.36
70 0.36
71 0.37
72 0.36
73 0.32
74 0.33
75 0.27
76 0.21
77 0.17
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.2
89 0.21
90 0.23
91 0.24
92 0.27
93 0.26
94 0.28
95 0.28
96 0.24
97 0.23
98 0.21
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.21
104 0.2
105 0.21
106 0.23
107 0.24
108 0.22
109 0.23
110 0.28
111 0.24
112 0.29
113 0.35
114 0.4
115 0.39
116 0.4
117 0.42
118 0.36
119 0.37
120 0.35
121 0.32
122 0.29
123 0.29
124 0.3
125 0.28
126 0.27
127 0.23
128 0.21
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.19
142 0.23
143 0.22
144 0.2
145 0.19
146 0.16
147 0.17
148 0.21
149 0.29
150 0.3
151 0.31
152 0.31
153 0.38
154 0.41
155 0.43
156 0.43
157 0.39
158 0.42
159 0.47
160 0.52
161 0.48
162 0.44
163 0.44
164 0.44
165 0.43
166 0.38
167 0.32
168 0.28
169 0.3
170 0.34
171 0.31
172 0.24
173 0.2
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.11
187 0.19
188 0.19
189 0.21
190 0.26
191 0.31
192 0.34
193 0.37
194 0.42
195 0.41
196 0.51
197 0.51
198 0.49
199 0.47
200 0.45
201 0.42
202 0.37
203 0.3
204 0.2
205 0.17
206 0.15
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.09
227 0.11
228 0.15
229 0.17
230 0.18
231 0.21
232 0.22
233 0.28
234 0.33
235 0.41
236 0.45
237 0.54
238 0.62
239 0.69
240 0.78
241 0.83
242 0.88
243 0.88
244 0.89
245 0.86
246 0.84
247 0.81
248 0.72
249 0.64
250 0.56
251 0.48
252 0.41
253 0.34
254 0.26
255 0.21
256 0.2
257 0.18
258 0.15
259 0.14
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.19
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.27
277 0.33
278 0.31
279 0.34
280 0.33
281 0.34
282 0.34
283 0.34
284 0.28
285 0.22
286 0.22
287 0.16
288 0.12
289 0.11
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.13
310 0.16
311 0.16
312 0.19
313 0.23
314 0.25
315 0.33
316 0.35
317 0.31
318 0.29
319 0.3
320 0.36
321 0.36
322 0.35
323 0.32
324 0.38
325 0.38
326 0.4
327 0.4
328 0.32
329 0.33
330 0.39
331 0.4
332 0.4
333 0.4
334 0.38
335 0.41
336 0.48
337 0.53
338 0.51
339 0.46
340 0.38
341 0.37
342 0.38
343 0.33
344 0.25
345 0.19
346 0.14
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.2
351 0.21
352 0.2
353 0.16
354 0.19
355 0.23
356 0.23
357 0.26
358 0.23
359 0.28
360 0.32
361 0.32
362 0.3
363 0.26
364 0.26
365 0.23
366 0.32
367 0.33
368 0.35
369 0.39
370 0.42
371 0.42
372 0.47
373 0.52
374 0.49
375 0.5
376 0.49
377 0.45
378 0.46
379 0.45
380 0.39
381 0.35
382 0.33
383 0.26
384 0.26
385 0.27
386 0.25
387 0.3
388 0.31
389 0.31
390 0.27
391 0.27
392 0.25
393 0.24
394 0.24
395 0.2
396 0.23
397 0.22
398 0.21
399 0.26
400 0.29
401 0.35
402 0.44
403 0.51
404 0.53
405 0.59
406 0.64
407 0.67
408 0.71
409 0.69
410 0.7
411 0.7
412 0.74
413 0.7
414 0.68
415 0.61
416 0.52
417 0.48
418 0.4
419 0.35
420 0.32
421 0.34
422 0.33
423 0.38
424 0.45
425 0.53