Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HMA2

Protein Details
Accession A0A1X2HMA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-241QLINRSKPSPKLRARRAWMHLSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-249KPSPKLRARRAWMHLSRQSRRSRRS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041545  DUF5601  
IPR045046  Vps9-like  
IPR037191  VPS9_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF18151  DUF5601  
Amino Acid Sequences MFDSFSLDPSSITADHPKYTILASHVQLPVRGEKIISVMLIQKPISRADIREWATSRQQQQEDVRQTIELGPNEPLAPRVKDFLKTFRRRPQRNLDRAGEIVNDFLTDMEHAMQQKQTTQTDIDERLDVMESYICQELYDLLFTNSSGDESMQDEALQSRIAALNLLDLNLEHLGVMVEHPAEAEAAEKAVKAAGKKLQQLNSILPAKEKLDTLVATHQLINRSKPSPKLRARRAWMHLSRQSRRSRRSAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.24
4 0.24
5 0.22
6 0.22
7 0.22
8 0.18
9 0.21
10 0.2
11 0.26
12 0.29
13 0.29
14 0.3
15 0.29
16 0.3
17 0.27
18 0.26
19 0.19
20 0.17
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.12
25 0.15
26 0.17
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.2
31 0.21
32 0.25
33 0.21
34 0.22
35 0.24
36 0.32
37 0.33
38 0.37
39 0.38
40 0.38
41 0.43
42 0.47
43 0.48
44 0.48
45 0.46
46 0.46
47 0.5
48 0.55
49 0.54
50 0.49
51 0.44
52 0.36
53 0.36
54 0.33
55 0.32
56 0.23
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.15
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.23
69 0.26
70 0.33
71 0.41
72 0.46
73 0.53
74 0.59
75 0.68
76 0.68
77 0.74
78 0.76
79 0.76
80 0.77
81 0.77
82 0.7
83 0.62
84 0.57
85 0.5
86 0.4
87 0.29
88 0.2
89 0.13
90 0.1
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.09
101 0.09
102 0.11
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.19
110 0.17
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.1
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.13
181 0.19
182 0.24
183 0.31
184 0.38
185 0.41
186 0.44
187 0.46
188 0.45
189 0.46
190 0.46
191 0.39
192 0.34
193 0.32
194 0.29
195 0.28
196 0.25
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.24
205 0.25
206 0.29
207 0.31
208 0.33
209 0.33
210 0.35
211 0.38
212 0.46
213 0.52
214 0.56
215 0.63
216 0.69
217 0.74
218 0.8
219 0.83
220 0.84
221 0.82
222 0.82
223 0.8
224 0.79
225 0.77
226 0.77
227 0.77
228 0.76
229 0.8
230 0.79
231 0.79