FuNGI

A0A1X2H317

Protein Details

Accession

A0A1X2H317

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
475-500	VVEETQRKKKREGKRRDRDHRLEGLI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
481-492	RKKKREGKRRDR

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028802 SMG8 IPR019354 SMG8/SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MRSKLLFHLNTTGQPFLHIIPTAVSESWQDDTQEAVCRNYTFGNPPSISAWLNEQAMSDPLHSNAANALRNFVVHWLKTSGGRHHAGLSSARKGDAARLSTSALPNVTQFASMLVALSDILLRGPSNIGSKSAWRTSLFNRYPATKNIIQQIDAVLRKKVRSITEIERIFSKSHSTDVMHKCLEAYSQESPPCYGQQYHTWKKENVLRMYRCLTRGPCADECAARLERECDSVWNQGRRSCETLSLTGKPCRLKMGHTANSAANEAMQDRALSGAHHSSGVSIFHGCTCGKMQRLREDPFSLQEANVDFYSRFTCCMKDEERYAIDIEKTMAQEERAPVKIHEHLPQCSPVLLYLGSSSTYRNSVGLEKYEGFMNNTNYLLPWTLGMLAGSNAAKSKGKEEKQHAQQVQVTSSAQPDMTKDTNEWPLPGKGGKAKAPANEPINKAASIASLDAFPSLAASRNMPDVPATKPTPKVVEETQRKKKREGKRRDRDHRLEGLIRGYFGAEYECPQGHRFLSCGEGKVCKLGHKGHPKDHANHVVHQDLPLFALCPCNFGQSGQRLTATDVMAQLQRIYCVSPEAPVSIVMKPKIRISAGGSVIETHLGFEHDLVLPNNGVYVLRLPYIYTDGLGNPITPDVSGQDIQRAILEKDSFHVSPVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.23
4	0.24
5	0.2
6	0.17
7	0.16
8	0.18
9	0.19
10	0.17
11	0.16
12	0.14
13	0.16
14	0.19
15	0.19
16	0.18
17	0.15
18	0.17
19	0.19
20	0.24
21	0.23
22	0.23
23	0.24
24	0.23
25	0.25
26	0.25
27	0.26
28	0.26
29	0.28
30	0.34
31	0.32
32	0.33
33	0.34
34	0.34
35	0.31
36	0.26
37	0.27
38	0.23
39	0.23
40	0.22
41	0.2
42	0.19
43	0.2
44	0.2
45	0.17
46	0.14
47	0.14
48	0.18
49	0.17
50	0.16
51	0.18
52	0.23
53	0.25
54	0.24
55	0.26
56	0.22
57	0.23
58	0.23
59	0.25
60	0.25
61	0.21
62	0.24
63	0.24
64	0.25
65	0.3
66	0.35
67	0.34
68	0.36
69	0.37
70	0.36
71	0.37
72	0.37
73	0.34
74	0.36
75	0.35
76	0.34
77	0.33
78	0.32
79	0.3
80	0.29
81	0.32
82	0.32
83	0.3
84	0.26
85	0.26
86	0.28
87	0.31
88	0.32
89	0.27
90	0.22
91	0.19
92	0.17
93	0.18
94	0.16
95	0.13
96	0.12
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.05
106	0.04
107	0.04
108	0.05
109	0.05
110	0.05
111	0.07
112	0.09
113	0.12
114	0.13
115	0.15
116	0.16
117	0.2
118	0.25
119	0.28
120	0.29
121	0.27
122	0.31
123	0.34
124	0.44
125	0.42
126	0.41
127	0.41
128	0.43
129	0.45
130	0.45
131	0.47
132	0.4
133	0.41
134	0.43
135	0.43
136	0.38
137	0.35
138	0.34
139	0.33
140	0.32
141	0.3
142	0.27
143	0.27
144	0.27
145	0.3
146	0.32
147	0.29
148	0.29
149	0.34
150	0.36
151	0.43
152	0.44
153	0.42
154	0.39
155	0.38
156	0.35
157	0.3
158	0.27
159	0.18
160	0.18
161	0.21
162	0.2
163	0.28
164	0.32
165	0.37
166	0.33
167	0.32
168	0.31
169	0.28
170	0.27
171	0.19
172	0.18
173	0.16
174	0.2
175	0.21
176	0.21
177	0.23
178	0.23
179	0.23
180	0.21
181	0.2
182	0.18
183	0.27
184	0.36
185	0.44
186	0.49
187	0.53
188	0.51
189	0.55
190	0.59
191	0.58
192	0.57
193	0.57
194	0.52
195	0.52
196	0.55
197	0.53
198	0.48
199	0.44
200	0.38
201	0.34
202	0.35
203	0.36
204	0.32
205	0.32
206	0.32
207	0.27
208	0.27
209	0.27
210	0.24
211	0.19
212	0.18
213	0.17
214	0.16
215	0.18
216	0.18
217	0.15
218	0.16
219	0.24
220	0.29
221	0.33
222	0.33
223	0.34
224	0.37
225	0.38
226	0.39
227	0.32
228	0.3
229	0.27
230	0.3
231	0.32
232	0.33
233	0.33
234	0.33
235	0.36
236	0.33
237	0.31
238	0.32
239	0.29
240	0.27
241	0.32
242	0.38
243	0.41
244	0.41
245	0.43
246	0.39
247	0.39
248	0.37
249	0.27
250	0.17
251	0.11
252	0.1
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.07
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.09
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.13
277	0.17
278	0.21
279	0.24
280	0.31
281	0.37
282	0.39
283	0.4
284	0.41
285	0.38
286	0.35
287	0.34
288	0.27
289	0.2
290	0.19
291	0.15
292	0.14
293	0.13
294	0.11
295	0.09
296	0.09
297	0.11
298	0.09
299	0.1
300	0.09
301	0.11
302	0.11
303	0.16
304	0.17
305	0.18
306	0.2
307	0.22
308	0.22
309	0.21
310	0.21
311	0.17
312	0.15
313	0.13
314	0.12
315	0.1
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.1
321	0.12
322	0.14
323	0.14
324	0.15
325	0.14
326	0.17
327	0.21
328	0.21
329	0.26
330	0.26
331	0.25
332	0.26
333	0.27
334	0.25
335	0.21
336	0.18
337	0.12
338	0.1
339	0.09
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.13
360	0.16
361	0.16
362	0.15
363	0.15
364	0.14
365	0.13
366	0.13
367	0.12
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.09
382	0.09
383	0.16
384	0.23
385	0.28
386	0.35
387	0.42
388	0.5
389	0.56
390	0.65
391	0.6
392	0.55
393	0.54
394	0.48
395	0.42
396	0.34
397	0.26
398	0.18
399	0.17
400	0.14
401	0.11
402	0.1
403	0.09
404	0.13
405	0.14
406	0.14
407	0.14
408	0.17
409	0.23
410	0.23
411	0.23
412	0.21
413	0.2
414	0.21
415	0.21
416	0.2
417	0.19
418	0.22
419	0.24
420	0.27
421	0.3
422	0.31
423	0.34
424	0.38
425	0.38
426	0.41
427	0.39
428	0.37
429	0.36
430	0.32
431	0.29
432	0.23
433	0.19
434	0.14
435	0.12
436	0.09
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.13
449	0.13
450	0.12
451	0.14
452	0.13
453	0.15
454	0.2
455	0.22
456	0.24
457	0.26
458	0.29
459	0.31
460	0.3
461	0.32
462	0.32
463	0.39
464	0.46
465	0.53
466	0.62
467	0.67
468	0.69
469	0.73
470	0.77
471	0.77
472	0.77
473	0.79
474	0.79
475	0.81
476	0.9
477	0.92
478	0.93
479	0.91
480	0.87
481	0.83
482	0.77
483	0.7
484	0.6
485	0.54
486	0.44
487	0.36
488	0.28
489	0.22
490	0.16
491	0.12
492	0.12
493	0.08
494	0.09
495	0.13
496	0.13
497	0.15
498	0.16
499	0.18
500	0.17
501	0.17
502	0.16
503	0.14
504	0.19
505	0.19
506	0.22
507	0.22
508	0.24
509	0.23
510	0.27
511	0.27
512	0.26
513	0.29
514	0.33
515	0.4
516	0.48
517	0.54
518	0.57
519	0.66
520	0.68
521	0.68
522	0.7
523	0.7
524	0.62
525	0.61
526	0.57
527	0.5
528	0.44
529	0.41
530	0.33
531	0.23
532	0.2
533	0.15
534	0.12
535	0.1
536	0.17
537	0.15
538	0.17
539	0.18
540	0.2
541	0.2
542	0.21
543	0.28
544	0.27
545	0.31
546	0.29
547	0.3
548	0.28
549	0.3
550	0.33
551	0.27
552	0.22
553	0.19
554	0.19
555	0.19
556	0.19
557	0.18
558	0.14
559	0.14
560	0.13
561	0.14
562	0.12
563	0.15
564	0.15
565	0.14
566	0.15
567	0.15
568	0.15
569	0.17
570	0.18
571	0.18
572	0.23
573	0.24
574	0.28
575	0.29
576	0.32
577	0.35
578	0.34
579	0.33
580	0.33
581	0.38
582	0.36
583	0.36
584	0.33
585	0.29
586	0.28
587	0.26
588	0.21
589	0.13
590	0.11
591	0.1
592	0.1
593	0.09
594	0.11
595	0.11
596	0.14
597	0.15
598	0.16
599	0.15
600	0.15
601	0.15
602	0.12
603	0.11
604	0.09
605	0.11
606	0.11
607	0.12
608	0.13
609	0.13
610	0.14
611	0.18
612	0.17
613	0.14
614	0.14
615	0.14
616	0.17
617	0.17
618	0.15
619	0.13
620	0.13
621	0.13
622	0.11
623	0.12
624	0.1
625	0.14
626	0.16
627	0.16
628	0.21
629	0.21
630	0.21
631	0.23
632	0.25
633	0.21
634	0.25
635	0.26
636	0.21
637	0.23
638	0.29
639	0.26

A0A1X2H317

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer