Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HFI9

Protein Details
Accession A0A1X2HFI9    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-57SLNDKRSGKEYPKRTGRPKQQHQKSQEWTQPSHydrophilic
62-85SETQPINPQKRTRQRTGPQTQAPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-238SRKKDITRPKAAK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF08519  RFC1  
CDD cd00009  AAA  
Amino Acid Sequences MSAHTHVLEIDADGPTKIRVKKDHTSLNDKRSGKEYPKRTGRPKQQHQKSQEWTQPSPNRLSETQPINPQKRTRQRTGPQTQAPDIGTDTVYEADAEYPAQQNIPYSGGGAYNSAASGDPFVQTQVSDEGSSKKNKCSDMKPDTSDKGPSQGNKKQANTSNRRAKQNATQIADKPTSREKEPAPRFEKQEPVSNPVKQYEARPDSEADNRGSETMPTEKPQKSSASRKKDITRPKAAKPTSGTRTAKMKTSDVCSREEEALSSIGATRASPVKAQKDSKKDANILPAESQISSADLPMEGNADTYNQIDPMESITLPQAPENISYDSNGEKSANGNVPGSSHSQHCTSTNAKHNDNPEMEVASDTPPAGVRSDIISSKQHEQQTKEDIVNGSGPRDLERNSLQATSKQDGADVALPPTEEGMDDKTKSSNNTKRKKVASKNENPFLVKTTASVVAERSKVPLKERTWPERYRPRTLQDIVGNKKLIRNMKLWLTSWKRSLQDDNIQLTKTEKEIFNYRAILISGPPGIGKTSAVHLLAKETNFEMLELNASDARSKGVLESKLSEMFDNRTMTEFYTRAQERKKRVLLLMDEVDGMQGANDRGGAATLAKLIEKTKIPVICICNNPKSKVVKPLKAVCFAVQFTRSKSESMAPRLSSIGSHEKIRIASQAIEELVRGTKSDIRQILNLLTTFKLGDNSGPLGPQAAKELILKHGKDIRRSMFDIPTALLDNRHWQLTNLNTKCNVYFDNDTMAPMMIHENYVRYTPGRTPKGVSTEIGELQCIADAAESIADGDILEAALHGPQHDYGLAQAHSMLSCVRPAYFMHGTNKMKHEHHNYPLHLANMRREAKSKRVLRDLRDTTLHNAIKRRHPLPLLTNRDDIRQDNVPALNGLISHYFQDESTHQEVLDIMDAYGLDKAHLDSLEHLTIGEKDIFGPRGAATTRTKMAFGRRYARLSKDSNVKDIKKYVYRNDALEQGDQDTIDWYDDDDNDFDDENMEDFMEGLADVDEQQLFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.21
4 0.25
5 0.29
6 0.36
7 0.44
8 0.53
9 0.61
10 0.68
11 0.69
12 0.75
13 0.77
14 0.78
15 0.79
16 0.72
17 0.66
18 0.61
19 0.62
20 0.61
21 0.62
22 0.61
23 0.63
24 0.72
25 0.78
26 0.84
27 0.86
28 0.87
29 0.89
30 0.92
31 0.92
32 0.92
33 0.93
34 0.9
35 0.9
36 0.87
37 0.85
38 0.81
39 0.77
40 0.7
41 0.7
42 0.7
43 0.65
44 0.63
45 0.57
46 0.56
47 0.5
48 0.52
49 0.5
50 0.49
51 0.5
52 0.53
53 0.6
54 0.61
55 0.66
56 0.68
57 0.71
58 0.75
59 0.78
60 0.77
61 0.78
62 0.8
63 0.84
64 0.85
65 0.85
66 0.81
67 0.8
68 0.73
69 0.67
70 0.58
71 0.48
72 0.4
73 0.32
74 0.24
75 0.17
76 0.16
77 0.12
78 0.12
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.19
117 0.23
118 0.32
119 0.33
120 0.37
121 0.41
122 0.47
123 0.53
124 0.56
125 0.62
126 0.63
127 0.68
128 0.67
129 0.68
130 0.65
131 0.61
132 0.58
133 0.48
134 0.45
135 0.42
136 0.42
137 0.45
138 0.47
139 0.53
140 0.56
141 0.58
142 0.61
143 0.64
144 0.69
145 0.69
146 0.74
147 0.75
148 0.74
149 0.79
150 0.74
151 0.7
152 0.69
153 0.7
154 0.68
155 0.62
156 0.6
157 0.55
158 0.59
159 0.58
160 0.49
161 0.42
162 0.42
163 0.42
164 0.39
165 0.41
166 0.4
167 0.47
168 0.55
169 0.61
170 0.59
171 0.61
172 0.64
173 0.64
174 0.67
175 0.59
176 0.6
177 0.53
178 0.53
179 0.53
180 0.51
181 0.48
182 0.41
183 0.42
184 0.34
185 0.35
186 0.4
187 0.39
188 0.37
189 0.37
190 0.37
191 0.37
192 0.41
193 0.4
194 0.32
195 0.28
196 0.26
197 0.25
198 0.24
199 0.21
200 0.17
201 0.19
202 0.19
203 0.21
204 0.28
205 0.3
206 0.32
207 0.35
208 0.39
209 0.42
210 0.51
211 0.58
212 0.6
213 0.64
214 0.69
215 0.73
216 0.75
217 0.78
218 0.76
219 0.77
220 0.73
221 0.75
222 0.78
223 0.71
224 0.68
225 0.63
226 0.63
227 0.57
228 0.61
229 0.55
230 0.49
231 0.56
232 0.51
233 0.52
234 0.46
235 0.44
236 0.38
237 0.42
238 0.46
239 0.4
240 0.41
241 0.38
242 0.38
243 0.36
244 0.32
245 0.26
246 0.2
247 0.19
248 0.15
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.11
256 0.12
257 0.15
258 0.2
259 0.26
260 0.33
261 0.41
262 0.47
263 0.52
264 0.58
265 0.61
266 0.62
267 0.6
268 0.55
269 0.56
270 0.5
271 0.44
272 0.38
273 0.33
274 0.28
275 0.23
276 0.21
277 0.13
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.14
309 0.15
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.1
318 0.11
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.18
333 0.2
334 0.21
335 0.27
336 0.35
337 0.38
338 0.39
339 0.41
340 0.43
341 0.45
342 0.42
343 0.37
344 0.28
345 0.24
346 0.22
347 0.19
348 0.17
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.1
360 0.11
361 0.13
362 0.15
363 0.17
364 0.22
365 0.27
366 0.3
367 0.32
368 0.35
369 0.37
370 0.4
371 0.4
372 0.36
373 0.33
374 0.29
375 0.26
376 0.26
377 0.22
378 0.16
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.15
386 0.17
387 0.17
388 0.19
389 0.19
390 0.21
391 0.25
392 0.23
393 0.23
394 0.21
395 0.19
396 0.17
397 0.18
398 0.17
399 0.13
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.05
407 0.05
408 0.08
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.13
413 0.15
414 0.18
415 0.27
416 0.32
417 0.4
418 0.48
419 0.55
420 0.6
421 0.67
422 0.74
423 0.74
424 0.76
425 0.77
426 0.78
427 0.8
428 0.77
429 0.72
430 0.63
431 0.54
432 0.47
433 0.37
434 0.27
435 0.19
436 0.16
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.14
442 0.15
443 0.15
444 0.15
445 0.17
446 0.18
447 0.21
448 0.27
449 0.26
450 0.34
451 0.41
452 0.46
453 0.5
454 0.52
455 0.57
456 0.6
457 0.63
458 0.62
459 0.6
460 0.55
461 0.55
462 0.53
463 0.5
464 0.46
465 0.48
466 0.44
467 0.43
468 0.41
469 0.34
470 0.34
471 0.33
472 0.32
473 0.26
474 0.25
475 0.23
476 0.27
477 0.29
478 0.28
479 0.32
480 0.34
481 0.34
482 0.35
483 0.37
484 0.34
485 0.34
486 0.36
487 0.33
488 0.34
489 0.36
490 0.35
491 0.32
492 0.31
493 0.29
494 0.27
495 0.23
496 0.17
497 0.15
498 0.12
499 0.13
500 0.18
501 0.2
502 0.21
503 0.21
504 0.2
505 0.18
506 0.18
507 0.16
508 0.11
509 0.1
510 0.08
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.11
524 0.13
525 0.12
526 0.12
527 0.1
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.08
532 0.06
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.07
544 0.11
545 0.12
546 0.13
547 0.15
548 0.17
549 0.19
550 0.19
551 0.18
552 0.14
553 0.15
554 0.18
555 0.17
556 0.15
557 0.15
558 0.15
559 0.15
560 0.17
561 0.15
562 0.12
563 0.18
564 0.19
565 0.22
566 0.29
567 0.35
568 0.39
569 0.48
570 0.51
571 0.46
572 0.47
573 0.48
574 0.43
575 0.41
576 0.35
577 0.27
578 0.23
579 0.2
580 0.18
581 0.12
582 0.1
583 0.05
584 0.05
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.07
599 0.09
600 0.1
601 0.12
602 0.15
603 0.16
604 0.17
605 0.21
606 0.26
607 0.28
608 0.33
609 0.37
610 0.4
611 0.42
612 0.43
613 0.45
614 0.45
615 0.43
616 0.48
617 0.51
618 0.49
619 0.52
620 0.59
621 0.57
622 0.55
623 0.53
624 0.44
625 0.39
626 0.34
627 0.3
628 0.25
629 0.22
630 0.21
631 0.25
632 0.24
633 0.22
634 0.22
635 0.26
636 0.28
637 0.33
638 0.35
639 0.3
640 0.31
641 0.31
642 0.29
643 0.23
644 0.22
645 0.23
646 0.2
647 0.21
648 0.22
649 0.23
650 0.23
651 0.24
652 0.22
653 0.16
654 0.16
655 0.14
656 0.15
657 0.14
658 0.13
659 0.12
660 0.11
661 0.1
662 0.09
663 0.08
664 0.08
665 0.12
666 0.14
667 0.2
668 0.23
669 0.23
670 0.24
671 0.26
672 0.26
673 0.24
674 0.23
675 0.18
676 0.15
677 0.13
678 0.13
679 0.12
680 0.11
681 0.09
682 0.1
683 0.1
684 0.12
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.11
692 0.1
693 0.11
694 0.12
695 0.14
696 0.18
697 0.24
698 0.23
699 0.25
700 0.32
701 0.34
702 0.37
703 0.42
704 0.41
705 0.41
706 0.43
707 0.43
708 0.39
709 0.37
710 0.33
711 0.27
712 0.24
713 0.2
714 0.18
715 0.15
716 0.13
717 0.18
718 0.18
719 0.19
720 0.18
721 0.16
722 0.2
723 0.27
724 0.37
725 0.33
726 0.35
727 0.35
728 0.36
729 0.36
730 0.34
731 0.27
732 0.22
733 0.23
734 0.21
735 0.24
736 0.23
737 0.23
738 0.21
739 0.2
740 0.14
741 0.12
742 0.13
743 0.08
744 0.09
745 0.09
746 0.09
747 0.1
748 0.11
749 0.12
750 0.11
751 0.13
752 0.19
753 0.29
754 0.32
755 0.33
756 0.35
757 0.39
758 0.44
759 0.43
760 0.37
761 0.3
762 0.29
763 0.31
764 0.28
765 0.23
766 0.17
767 0.15
768 0.15
769 0.11
770 0.08
771 0.04
772 0.04
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.03
782 0.03
783 0.03
784 0.03
785 0.03
786 0.04
787 0.04
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.07
792 0.07
793 0.07
794 0.08
795 0.12
796 0.12
797 0.11
798 0.11
799 0.11
800 0.11
801 0.11
802 0.11
803 0.07
804 0.09
805 0.09
806 0.09
807 0.1
808 0.11
809 0.18
810 0.21
811 0.26
812 0.29
813 0.38
814 0.41
815 0.45
816 0.49
817 0.47
818 0.45
819 0.49
820 0.53
821 0.51
822 0.57
823 0.6
824 0.57
825 0.57
826 0.57
827 0.51
828 0.46
829 0.41
830 0.38
831 0.39
832 0.42
833 0.38
834 0.42
835 0.44
836 0.49
837 0.56
838 0.58
839 0.55
840 0.62
841 0.67
842 0.67
843 0.73
844 0.69
845 0.64
846 0.6
847 0.56
848 0.49
849 0.53
850 0.5
851 0.43
852 0.45
853 0.46
854 0.52
855 0.57
856 0.55
857 0.52
858 0.52
859 0.54
860 0.57
861 0.62
862 0.62
863 0.58
864 0.62
865 0.56
866 0.57
867 0.54
868 0.46
869 0.4
870 0.36
871 0.32
872 0.31
873 0.31
874 0.28
875 0.25
876 0.23
877 0.18
878 0.14
879 0.14
880 0.11
881 0.11
882 0.11
883 0.12
884 0.12
885 0.12
886 0.15
887 0.15
888 0.2
889 0.22
890 0.22
891 0.2
892 0.2
893 0.2
894 0.18
895 0.2
896 0.13
897 0.1
898 0.1
899 0.1
900 0.1
901 0.11
902 0.1
903 0.08
904 0.08
905 0.09
906 0.11
907 0.11
908 0.12
909 0.13
910 0.18
911 0.19
912 0.18
913 0.17
914 0.16
915 0.17
916 0.19
917 0.16
918 0.11
919 0.12
920 0.17
921 0.18
922 0.17
923 0.18
924 0.15
925 0.19
926 0.2
927 0.24
928 0.24
929 0.28
930 0.33
931 0.33
932 0.34
933 0.33
934 0.42
935 0.45
936 0.47
937 0.5
938 0.51
939 0.57
940 0.61
941 0.64
942 0.61
943 0.58
944 0.58
945 0.61
946 0.58
947 0.6
948 0.64
949 0.62
950 0.61
951 0.62
952 0.62
953 0.6
954 0.64
955 0.64
956 0.65
957 0.64
958 0.62
959 0.59
960 0.57
961 0.52
962 0.48
963 0.4
964 0.32
965 0.3
966 0.25
967 0.22
968 0.18
969 0.15
970 0.13
971 0.12
972 0.11
973 0.13
974 0.14
975 0.16
976 0.15
977 0.15
978 0.16
979 0.16
980 0.15
981 0.13
982 0.13
983 0.11
984 0.11
985 0.1
986 0.08
987 0.08
988 0.08
989 0.07
990 0.06
991 0.05
992 0.05
993 0.06
994 0.06
995 0.08