Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HNT1

Protein Details
Accession A0A1X2HNT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28HAEVTGQVKHRRKLHKQLFFVDHydrophilic
238-260CVEPNPRKRSKQWRGRLRRLAANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-255RKRSKQWRGRLR
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MDAFRCHAEVTGQVKHRRKLHKQLFFVDLQPEEDNQPKIQILFRTNDGTTDVDTFREAYKACRLGNIIHLSIGWPTDPAENEGKSFKVYQSIQIPTVINEYPIGRPFVSDHPMGTDKPKTIIRATDGSTHLKSNLYCKFWINQRECARLPDCPFLHPSEEEYKAARESWINERLTSRRLVTHDPHDPHESKKSHTMRAMVFAKWIYDTLKPSMVLDVAGGKGDVSMFLTHAFDIPAACVEPNPRKRSKQWRGRLRRLAANLQHPDTERPIEQWPFEREPEFLTCMMDDAFLAEQTRLLDQVTALVGLHADQATEPIVDTALRLGKAFAVIPCCVFAHENRHRRLQSGASVTTTEDFVQYLCEKDTQGRGSVQKAYLDFVGKNVVVYWIPTTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.6
3 0.68
4 0.71
5 0.75
6 0.79
7 0.82
8 0.82
9 0.81
10 0.8
11 0.77
12 0.69
13 0.62
14 0.55
15 0.45
16 0.39
17 0.33
18 0.29
19 0.26
20 0.29
21 0.28
22 0.24
23 0.25
24 0.23
25 0.23
26 0.26
27 0.28
28 0.28
29 0.29
30 0.31
31 0.34
32 0.33
33 0.32
34 0.3
35 0.26
36 0.23
37 0.23
38 0.2
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.24
47 0.28
48 0.28
49 0.3
50 0.31
51 0.3
52 0.38
53 0.39
54 0.31
55 0.26
56 0.26
57 0.23
58 0.22
59 0.2
60 0.12
61 0.07
62 0.08
63 0.11
64 0.12
65 0.15
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.22
70 0.21
71 0.2
72 0.21
73 0.18
74 0.21
75 0.21
76 0.25
77 0.3
78 0.33
79 0.32
80 0.33
81 0.33
82 0.27
83 0.29
84 0.23
85 0.17
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.17
90 0.18
91 0.14
92 0.15
93 0.17
94 0.21
95 0.23
96 0.21
97 0.19
98 0.21
99 0.24
100 0.24
101 0.25
102 0.24
103 0.21
104 0.25
105 0.27
106 0.26
107 0.26
108 0.28
109 0.27
110 0.28
111 0.29
112 0.31
113 0.31
114 0.33
115 0.32
116 0.29
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.24
121 0.27
122 0.26
123 0.26
124 0.27
125 0.3
126 0.34
127 0.43
128 0.4
129 0.43
130 0.46
131 0.51
132 0.5
133 0.51
134 0.46
135 0.41
136 0.41
137 0.4
138 0.35
139 0.31
140 0.32
141 0.29
142 0.3
143 0.25
144 0.25
145 0.22
146 0.24
147 0.23
148 0.22
149 0.21
150 0.19
151 0.19
152 0.16
153 0.13
154 0.14
155 0.19
156 0.25
157 0.25
158 0.25
159 0.27
160 0.28
161 0.29
162 0.28
163 0.22
164 0.19
165 0.21
166 0.25
167 0.26
168 0.3
169 0.35
170 0.35
171 0.37
172 0.39
173 0.37
174 0.35
175 0.4
176 0.36
177 0.3
178 0.38
179 0.38
180 0.37
181 0.39
182 0.4
183 0.32
184 0.38
185 0.39
186 0.29
187 0.27
188 0.22
189 0.2
190 0.16
191 0.16
192 0.11
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.12
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.1
227 0.19
228 0.27
229 0.33
230 0.38
231 0.42
232 0.51
233 0.62
234 0.68
235 0.7
236 0.73
237 0.78
238 0.83
239 0.89
240 0.9
241 0.83
242 0.79
243 0.74
244 0.72
245 0.66
246 0.64
247 0.57
248 0.49
249 0.46
250 0.41
251 0.38
252 0.33
253 0.3
254 0.22
255 0.2
256 0.24
257 0.24
258 0.24
259 0.27
260 0.31
261 0.31
262 0.33
263 0.31
264 0.27
265 0.28
266 0.29
267 0.26
268 0.2
269 0.17
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.11
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.09
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.25
324 0.34
325 0.43
326 0.45
327 0.55
328 0.54
329 0.54
330 0.56
331 0.51
332 0.49
333 0.47
334 0.45
335 0.37
336 0.37
337 0.36
338 0.33
339 0.28
340 0.2
341 0.14
342 0.12
343 0.09
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.21
351 0.28
352 0.27
353 0.29
354 0.33
355 0.35
356 0.38
357 0.44
358 0.42
359 0.39
360 0.37
361 0.36
362 0.33
363 0.33
364 0.28
365 0.23
366 0.27
367 0.22
368 0.21
369 0.19
370 0.19
371 0.16
372 0.17