Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HBQ2

Protein Details
Accession A0A1X2HBQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-99APFSTHERKKRSKGDKRSLELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-91RKKRSKG
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR015847  ExoRNase_PH_dom2  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
PF03725  RNase_PH_C  
CDD cd11370  RNase_PH_RRP41  
Amino Acid Sequences MSRLELLTPEGLRIDGRRANELRRITAKTSVFSQSDGSAYIEQGNTKCLAAVYGPREARHRQQIQADRANINVEFNVAPFSTHERKKRSKGDKRSLELATFIRQTFEPIVLTSQFPRSQIDIYLQIFQHDGGMLQACINAATLALVDAGIPMLDYVCACSAGSIDKTPVLDLNYVEESTDTPELTLALLPRTGQVNLVELESRLHIEQLKDVTDLATEGCLQIHTILDQVIRDNSEYLMNRLNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.3
5 0.33
6 0.37
7 0.44
8 0.46
9 0.46
10 0.48
11 0.51
12 0.46
13 0.5
14 0.47
15 0.42
16 0.42
17 0.41
18 0.36
19 0.32
20 0.31
21 0.24
22 0.22
23 0.21
24 0.2
25 0.15
26 0.14
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.16
39 0.16
40 0.23
41 0.24
42 0.25
43 0.3
44 0.33
45 0.39
46 0.44
47 0.45
48 0.42
49 0.5
50 0.58
51 0.61
52 0.64
53 0.61
54 0.51
55 0.47
56 0.45
57 0.36
58 0.28
59 0.19
60 0.14
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.16
68 0.21
69 0.27
70 0.34
71 0.4
72 0.48
73 0.57
74 0.66
75 0.7
76 0.74
77 0.79
78 0.83
79 0.84
80 0.81
81 0.78
82 0.69
83 0.59
84 0.51
85 0.41
86 0.33
87 0.26
88 0.21
89 0.16
90 0.15
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.08
117 0.07
118 0.04
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.02
134 0.03
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.1
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.14
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.17
195 0.19
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.14
201 0.14
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.22
223 0.23
224 0.24