Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2H1F3

Protein Details
Accession A0A1X2H1F3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-174DVVVKKPKKEKTPGQPKKKVHEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-199KKPKKEKTPGQPKKKVHEEEVKKSAWLNFASGGDKGKKKKMVAAP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13, nucl 12.5, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR002999  Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
CDD cd21182  Tudor_SMN_SPF30-like  
Amino Acid Sequences MSDDTESYQYQLEQVELALSKDPDNEELKKLQHDLKELIALTSQLEQQQQKQKKKSVSPSASPVDRKGSSPSTPTGGGTTAALKAHEFSVGQEVLARWSGDGQFYRATITAIGGADQVFSVVFKGYQDNEMVKAEDVKALHNKKRQGIFEDVVVKKPKKEKTPGQPKKKVHEEEVKKSAWLNFASGGDKGKKKKMVAAPINKKSIFKTPDNPQGKVGVVGSGQGMTAYNRRGKHQYNATEGADNEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.11
4 0.12
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.19
11 0.23
12 0.25
13 0.26
14 0.3
15 0.32
16 0.33
17 0.35
18 0.37
19 0.35
20 0.37
21 0.36
22 0.33
23 0.35
24 0.32
25 0.28
26 0.23
27 0.2
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.13
32 0.17
33 0.19
34 0.26
35 0.36
36 0.44
37 0.51
38 0.58
39 0.63
40 0.67
41 0.74
42 0.77
43 0.77
44 0.75
45 0.71
46 0.7
47 0.69
48 0.66
49 0.59
50 0.51
51 0.47
52 0.4
53 0.37
54 0.35
55 0.33
56 0.3
57 0.31
58 0.3
59 0.27
60 0.26
61 0.25
62 0.21
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.18
126 0.23
127 0.29
128 0.33
129 0.37
130 0.4
131 0.46
132 0.46
133 0.43
134 0.43
135 0.38
136 0.37
137 0.42
138 0.37
139 0.36
140 0.4
141 0.35
142 0.33
143 0.4
144 0.42
145 0.42
146 0.5
147 0.54
148 0.6
149 0.71
150 0.77
151 0.81
152 0.84
153 0.82
154 0.83
155 0.83
156 0.76
157 0.72
158 0.72
159 0.69
160 0.68
161 0.68
162 0.6
163 0.51
164 0.48
165 0.43
166 0.37
167 0.29
168 0.22
169 0.18
170 0.19
171 0.2
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.27
176 0.31
177 0.36
178 0.4
179 0.4
180 0.48
181 0.51
182 0.57
183 0.61
184 0.67
185 0.71
186 0.72
187 0.78
188 0.71
189 0.64
190 0.57
191 0.56
192 0.51
193 0.46
194 0.47
195 0.48
196 0.58
197 0.62
198 0.6
199 0.53
200 0.5
201 0.45
202 0.39
203 0.31
204 0.22
205 0.16
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.13
214 0.18
215 0.23
216 0.25
217 0.31
218 0.39
219 0.43
220 0.5
221 0.56
222 0.58
223 0.6
224 0.65
225 0.62
226 0.57