Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HHW4

Protein Details
Accession A0A1X2HHW4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-124KASDAKTEESKRKRTKRKVKPLTPEELAHydrophilic
165-190LVPEDPKITKRRKKYTKNRRINYVEGHydrophilic
270-312NVEHAKQHKALQKKRKREDEADSDVKRTFKQREKVKRDHDATQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-117SKRKRTKRKVKP
173-183TKRRKKYTKNR
278-286KALQKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MADQVKKDLLGLTEEVEQDRQSDSEIEQERDTRFSTRNLRKAHNPIDFEDSHQEDDSDSNDDYSGSDDSDSDNNDSDDDAVQDNRFSQSELQQEEGKASDAKTEESKRKRTKRKVKPLTPEELAKFEAEQKRAGVCYLSRIPPFMKPHRLKELLSKYAEVGRMHLVPEDPKITKRRKKYTKNRRINYVEGWVEFKDKKQAKTLAEHLNMKQIGGKRKSNYYHEMWTIKYLPKFKWNHLMEQITYEQRAREHKLRTEIAQATRENKAYLQNVEHAKQHKALQKKRKREDEADSDVKRTFKQREKVKRDHDATQPKRAMTEDMKSVLANVFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.19
5 0.16
6 0.17
7 0.15
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.21
12 0.25
13 0.27
14 0.27
15 0.31
16 0.31
17 0.31
18 0.33
19 0.28
20 0.26
21 0.32
22 0.41
23 0.47
24 0.53
25 0.57
26 0.61
27 0.66
28 0.73
29 0.75
30 0.72
31 0.65
32 0.6
33 0.61
34 0.55
35 0.5
36 0.47
37 0.4
38 0.34
39 0.31
40 0.28
41 0.22
42 0.22
43 0.2
44 0.16
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.12
51 0.11
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.11
56 0.13
57 0.14
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.17
76 0.22
77 0.24
78 0.25
79 0.25
80 0.25
81 0.25
82 0.23
83 0.2
84 0.15
85 0.13
86 0.14
87 0.13
88 0.14
89 0.2
90 0.25
91 0.33
92 0.4
93 0.5
94 0.57
95 0.67
96 0.76
97 0.81
98 0.86
99 0.88
100 0.92
101 0.93
102 0.92
103 0.92
104 0.88
105 0.83
106 0.75
107 0.69
108 0.59
109 0.5
110 0.42
111 0.31
112 0.25
113 0.25
114 0.27
115 0.23
116 0.23
117 0.21
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.15
122 0.1
123 0.15
124 0.18
125 0.2
126 0.19
127 0.21
128 0.22
129 0.26
130 0.33
131 0.34
132 0.4
133 0.41
134 0.47
135 0.53
136 0.55
137 0.5
138 0.52
139 0.54
140 0.49
141 0.46
142 0.41
143 0.33
144 0.34
145 0.36
146 0.27
147 0.2
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.12
153 0.1
154 0.11
155 0.13
156 0.12
157 0.15
158 0.22
159 0.31
160 0.37
161 0.46
162 0.55
163 0.63
164 0.73
165 0.81
166 0.85
167 0.87
168 0.91
169 0.87
170 0.86
171 0.8
172 0.73
173 0.65
174 0.6
175 0.5
176 0.4
177 0.37
178 0.28
179 0.26
180 0.22
181 0.2
182 0.23
183 0.26
184 0.27
185 0.32
186 0.37
187 0.36
188 0.41
189 0.48
190 0.47
191 0.47
192 0.49
193 0.42
194 0.43
195 0.41
196 0.35
197 0.32
198 0.28
199 0.32
200 0.34
201 0.4
202 0.35
203 0.43
204 0.48
205 0.5
206 0.51
207 0.46
208 0.46
209 0.45
210 0.45
211 0.38
212 0.37
213 0.35
214 0.33
215 0.33
216 0.33
217 0.3
218 0.37
219 0.4
220 0.4
221 0.47
222 0.45
223 0.47
224 0.49
225 0.51
226 0.42
227 0.42
228 0.42
229 0.33
230 0.33
231 0.27
232 0.22
233 0.22
234 0.27
235 0.3
236 0.33
237 0.38
238 0.42
239 0.49
240 0.5
241 0.49
242 0.52
243 0.51
244 0.48
245 0.47
246 0.44
247 0.4
248 0.41
249 0.4
250 0.33
251 0.28
252 0.3
253 0.28
254 0.29
255 0.28
256 0.31
257 0.35
258 0.36
259 0.39
260 0.36
261 0.36
262 0.36
263 0.41
264 0.4
265 0.46
266 0.54
267 0.6
268 0.67
269 0.75
270 0.81
271 0.85
272 0.87
273 0.84
274 0.84
275 0.82
276 0.81
277 0.79
278 0.71
279 0.63
280 0.57
281 0.51
282 0.45
283 0.43
284 0.43
285 0.43
286 0.51
287 0.59
288 0.68
289 0.76
290 0.83
291 0.85
292 0.86
293 0.82
294 0.8
295 0.8
296 0.8
297 0.76
298 0.76
299 0.71
300 0.61
301 0.58
302 0.53
303 0.49
304 0.44
305 0.43
306 0.39
307 0.37
308 0.37
309 0.35
310 0.34