Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HHH1

Protein Details
Accession A0A1X2HHH1    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-314CPRANKPFLKRHKMHNHMRTBasic
361-399AYFHSRSLRKHIKSHQQPRPKQRRGRRRHQAQQQQELLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
369-388RKHIKSHQQPRPKQRRGRRR
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043359  GLI-like  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSCSPVFNQHGFPDSEVPPSCVSDIMPNNSFWPYLPNGTPAVDTSTLSEGASSMGIRTPDFLPTTPEHQTRAYYDYNQHNNTTSIVNNPRNGYDPALLPMVNSSISATPAYISPAITPKDDWATMTAEQHHYTYAYPQQHPQAAQEHILIPSPSIVPSQPMLYTPSRSQNMVFENLSRSELIDRVVQLERERYTPPGTTANPAAEMTTAAIPTALTTAPFSYPVNSPSDEIHGSPLLMTGLEQEDEYQDDVKQVHICRWADCDLQTSSLSSLIEHIGRDHIGSGKPSYLCEWAECPRANKPFLKRHKMHNHMRTHTGERPFVCSVPDCLKRFSRLDSLNTHIKTHSNVRPFACTIPGCDKAYFHSRSLRKHIKSHQQPRPKQRRGRRRHQAQQQQELLSPQPMAVAPDGDKAPTQPAEISQQQQEEQQQPCFYYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.32
4 0.32
5 0.29
6 0.29
7 0.27
8 0.22
9 0.22
10 0.23
11 0.28
12 0.32
13 0.32
14 0.31
15 0.32
16 0.33
17 0.32
18 0.24
19 0.23
20 0.2
21 0.23
22 0.24
23 0.25
24 0.25
25 0.26
26 0.26
27 0.23
28 0.24
29 0.2
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.09
40 0.07
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.13
45 0.13
46 0.16
47 0.18
48 0.18
49 0.21
50 0.23
51 0.28
52 0.32
53 0.34
54 0.33
55 0.32
56 0.35
57 0.32
58 0.34
59 0.33
60 0.31
61 0.36
62 0.43
63 0.49
64 0.49
65 0.48
66 0.45
67 0.42
68 0.39
69 0.34
70 0.25
71 0.25
72 0.31
73 0.34
74 0.36
75 0.36
76 0.36
77 0.38
78 0.39
79 0.34
80 0.27
81 0.24
82 0.22
83 0.22
84 0.2
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.16
102 0.17
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.16
110 0.18
111 0.18
112 0.2
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.19
118 0.16
119 0.15
120 0.17
121 0.2
122 0.24
123 0.24
124 0.27
125 0.31
126 0.34
127 0.34
128 0.33
129 0.31
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.21
134 0.19
135 0.2
136 0.17
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.19
152 0.25
153 0.25
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.27
158 0.27
159 0.25
160 0.19
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.16
165 0.14
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.18
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.18
189 0.17
190 0.15
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.16
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.2
243 0.21
244 0.2
245 0.24
246 0.25
247 0.23
248 0.23
249 0.23
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.15
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.15
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.19
279 0.19
280 0.25
281 0.26
282 0.27
283 0.31
284 0.35
285 0.38
286 0.4
287 0.45
288 0.5
289 0.58
290 0.66
291 0.62
292 0.68
293 0.76
294 0.79
295 0.81
296 0.8
297 0.79
298 0.73
299 0.76
300 0.7
301 0.65
302 0.62
303 0.57
304 0.52
305 0.44
306 0.45
307 0.41
308 0.36
309 0.32
310 0.26
311 0.25
312 0.28
313 0.35
314 0.32
315 0.34
316 0.37
317 0.4
318 0.41
319 0.42
320 0.42
321 0.39
322 0.42
323 0.42
324 0.44
325 0.48
326 0.47
327 0.44
328 0.36
329 0.34
330 0.33
331 0.37
332 0.38
333 0.36
334 0.4
335 0.41
336 0.44
337 0.44
338 0.42
339 0.4
340 0.33
341 0.31
342 0.33
343 0.36
344 0.34
345 0.33
346 0.32
347 0.31
348 0.39
349 0.38
350 0.34
351 0.38
352 0.41
353 0.48
354 0.58
355 0.63
356 0.6
357 0.66
358 0.73
359 0.74
360 0.8
361 0.84
362 0.83
363 0.84
364 0.88
365 0.91
366 0.92
367 0.91
368 0.91
369 0.91
370 0.92
371 0.91
372 0.93
373 0.93
374 0.92
375 0.92
376 0.93
377 0.93
378 0.92
379 0.91
380 0.87
381 0.78
382 0.69
383 0.61
384 0.52
385 0.43
386 0.33
387 0.23
388 0.18
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.18
395 0.19
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.22
400 0.2
401 0.21
402 0.18
403 0.21
404 0.27
405 0.32
406 0.35
407 0.34
408 0.36
409 0.35
410 0.39
411 0.43
412 0.43
413 0.42
414 0.44
415 0.41