Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2H9N0

Protein Details
Accession A0A1X2H9N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-32FSTLLRRSQRGKAPRRGTKAFPHydrophilic
241-263HWDVYRPHPKWKKKDPGTPDFCVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-27RGKAPRRG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 9.5, nucl 5.5, pero 5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MSDTDEEPGDFSTLLRRSQRGKAPRRGTKAFPSKEQQEEALETSRDALFELIGETKRVHPKSTSQGVLNRETGETTIVKSKGAHLHAMGHTVKGQTVLFPEEAAWLLNMHNLIVTDPEGMSCHFEDYCTLMFTSADGWINFEKYQTYAYLRRLGYFVLRHRPPAPVSRPHTHPSLLVTWCSWLWGILNRMVRSIFRYFVGFRSLVHHGVFNTNEDVYKRLRIIDAQPWESKETVESAAEFHWDVYRPHPKWKKKDPGTPDFCVAVTSPREALPTLADYQALFQSTWQHAGARHLSRYRRRGEQAPAFLMAVVGDAEGVSFLKITGDGAADLTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.32
4 0.37
5 0.45
6 0.55
7 0.58
8 0.65
9 0.7
10 0.76
11 0.81
12 0.84
13 0.82
14 0.79
15 0.79
16 0.79
17 0.74
18 0.71
19 0.69
20 0.67
21 0.67
22 0.63
23 0.54
24 0.47
25 0.45
26 0.4
27 0.37
28 0.3
29 0.24
30 0.24
31 0.22
32 0.18
33 0.16
34 0.13
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.2
43 0.29
44 0.3
45 0.31
46 0.31
47 0.37
48 0.45
49 0.52
50 0.49
51 0.44
52 0.48
53 0.5
54 0.51
55 0.46
56 0.38
57 0.3
58 0.27
59 0.23
60 0.2
61 0.16
62 0.14
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.23
68 0.26
69 0.28
70 0.28
71 0.23
72 0.28
73 0.28
74 0.33
75 0.28
76 0.22
77 0.22
78 0.2
79 0.19
80 0.15
81 0.14
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.13
134 0.16
135 0.18
136 0.25
137 0.25
138 0.25
139 0.25
140 0.24
141 0.23
142 0.23
143 0.25
144 0.26
145 0.27
146 0.29
147 0.29
148 0.32
149 0.3
150 0.34
151 0.35
152 0.35
153 0.4
154 0.42
155 0.45
156 0.45
157 0.45
158 0.37
159 0.33
160 0.27
161 0.26
162 0.22
163 0.19
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.11
169 0.06
170 0.06
171 0.09
172 0.11
173 0.14
174 0.19
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.17
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.19
187 0.15
188 0.14
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.15
195 0.18
196 0.18
197 0.15
198 0.14
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.13
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.2
210 0.25
211 0.29
212 0.31
213 0.32
214 0.33
215 0.34
216 0.32
217 0.28
218 0.21
219 0.17
220 0.14
221 0.13
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.18
232 0.29
233 0.29
234 0.4
235 0.49
236 0.56
237 0.65
238 0.75
239 0.79
240 0.78
241 0.85
242 0.84
243 0.85
244 0.83
245 0.77
246 0.69
247 0.59
248 0.49
249 0.41
250 0.32
251 0.26
252 0.21
253 0.19
254 0.17
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.14
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.15
268 0.12
269 0.11
270 0.17
271 0.18
272 0.21
273 0.2
274 0.2
275 0.2
276 0.27
277 0.34
278 0.32
279 0.37
280 0.41
281 0.5
282 0.58
283 0.64
284 0.64
285 0.65
286 0.67
287 0.68
288 0.71
289 0.72
290 0.69
291 0.64
292 0.6
293 0.51
294 0.44
295 0.37
296 0.26
297 0.17
298 0.1
299 0.06
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.08