Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HMB8

Protein Details
Accession A0A1X2HMB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-85YLSSSSSSSKKSKKQQPTSREAKPASKKSQDAKKEQKQQEAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-76KKSKKQQPTSREAKPASKKSQDAK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13414  TPR_11  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSSQQQQASSSASERMKKLFEDKDWKFYAALTAGVVAAGAGAYYLSSSSSSSKKSKKQQPTSREAKPASKKSQDAKKEQKQQEAAPAAGAAAGPQADEYETMSEEAIAALSPEKRAEAAQALKAKGNSLFTSKKYEDAIRLYSQAILFKPDAIFYANRAACFANLGKQAEVIENCNAALKLDPVYVKAMNRRAGAHEKLNNFTDALYDYTCVCILDGFKNENAAKSMERLLKQVASARSHEMMKTKKPRLPSSTFVNAYFDSFRPLKIDLPEENAVNGDAMFAQAYRALEAKQFDQALELCEKAIELQCSRPYHAYALNLLGTFHFLKGDNTAAMECLDKSIELDPKFVQSYIKRSSLYMEQGNIAAAFKQFDDAIAINPAEPDVYYHRGQVNYISGQFDAAAKDYAESLKLDDSFVFAHIQLGVVQYKLGSISSAMSTFNNTLKRFPESADVQNYYGELLVDQQKVQEAIDAFGKAIELDPKNPLPYINKAMLMYQAMGDAEEATALCKKALECK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.38
4 0.39
5 0.45
6 0.45
7 0.49
8 0.54
9 0.56
10 0.6
11 0.6
12 0.59
13 0.51
14 0.43
15 0.4
16 0.3
17 0.26
18 0.18
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.12
23 0.06
24 0.05
25 0.04
26 0.03
27 0.02
28 0.02
29 0.02
30 0.03
31 0.03
32 0.04
33 0.05
34 0.07
35 0.11
36 0.15
37 0.21
38 0.3
39 0.39
40 0.48
41 0.58
42 0.67
43 0.74
44 0.82
45 0.86
46 0.87
47 0.88
48 0.88
49 0.85
50 0.84
51 0.77
52 0.76
53 0.76
54 0.76
55 0.75
56 0.74
57 0.73
58 0.72
59 0.77
60 0.77
61 0.77
62 0.78
63 0.79
64 0.83
65 0.82
66 0.83
67 0.78
68 0.72
69 0.71
70 0.64
71 0.54
72 0.43
73 0.36
74 0.27
75 0.22
76 0.18
77 0.09
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.12
104 0.16
105 0.19
106 0.24
107 0.29
108 0.3
109 0.32
110 0.32
111 0.31
112 0.27
113 0.27
114 0.22
115 0.23
116 0.26
117 0.26
118 0.34
119 0.33
120 0.34
121 0.34
122 0.35
123 0.34
124 0.34
125 0.36
126 0.29
127 0.3
128 0.28
129 0.27
130 0.25
131 0.23
132 0.19
133 0.18
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.21
143 0.2
144 0.2
145 0.21
146 0.21
147 0.18
148 0.2
149 0.19
150 0.15
151 0.18
152 0.2
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.17
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.13
172 0.15
173 0.16
174 0.21
175 0.26
176 0.28
177 0.29
178 0.29
179 0.31
180 0.36
181 0.37
182 0.38
183 0.38
184 0.36
185 0.38
186 0.38
187 0.33
188 0.27
189 0.24
190 0.18
191 0.13
192 0.12
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.16
211 0.14
212 0.14
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.2
220 0.24
221 0.22
222 0.21
223 0.21
224 0.22
225 0.23
226 0.23
227 0.23
228 0.24
229 0.23
230 0.29
231 0.37
232 0.41
233 0.41
234 0.46
235 0.51
236 0.53
237 0.55
238 0.5
239 0.48
240 0.5
241 0.49
242 0.43
243 0.39
244 0.32
245 0.28
246 0.25
247 0.18
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.19
256 0.16
257 0.21
258 0.22
259 0.2
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.11
264 0.1
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.19
296 0.21
297 0.23
298 0.23
299 0.22
300 0.22
301 0.24
302 0.22
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.12
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.1
329 0.15
330 0.15
331 0.18
332 0.17
333 0.2
334 0.21
335 0.2
336 0.22
337 0.19
338 0.25
339 0.29
340 0.32
341 0.3
342 0.29
343 0.32
344 0.32
345 0.34
346 0.29
347 0.25
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.19
352 0.14
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.11
372 0.16
373 0.16
374 0.2
375 0.23
376 0.23
377 0.24
378 0.24
379 0.24
380 0.23
381 0.23
382 0.21
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.16
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.11
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.12
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.11
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.13
426 0.15
427 0.2
428 0.25
429 0.24
430 0.27
431 0.29
432 0.35
433 0.33
434 0.33
435 0.36
436 0.34
437 0.4
438 0.44
439 0.44
440 0.39
441 0.38
442 0.36
443 0.29
444 0.24
445 0.17
446 0.09
447 0.11
448 0.16
449 0.17
450 0.17
451 0.18
452 0.19
453 0.2
454 0.2
455 0.2
456 0.15
457 0.15
458 0.18
459 0.18
460 0.16
461 0.15
462 0.15
463 0.11
464 0.12
465 0.18
466 0.17
467 0.19
468 0.25
469 0.28
470 0.3
471 0.3
472 0.32
473 0.29
474 0.35
475 0.39
476 0.37
477 0.37
478 0.35
479 0.36
480 0.36
481 0.33
482 0.26
483 0.2
484 0.17
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.1
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.13