Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HDS3

Protein Details
Accession A0A1X2HDS3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-194NPLAVKELKKSRKEKKSKKDKKDKKDTKDKIAKHERTBasic
211-242RERERGRERDSERRHHRHRHHSDRRSSRDYRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-242ELKKSRKEKKSKKDKKDKKDTKDKIAKHERTSDRVSKRGSSREQDRERERERGRERDSERRHHRHRHHSDRRSSRDYRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNLKKSWHPATLKNQERVWKEERKHSEEQRKIEQMKKELMEERQLQELQRLQEEVGQKQRSDRLDWMYAAPNTGGPKAGSDEMEEYLLGKKNVDSLIRDKNSRETVASSADERFAISNANANNERDIQAKIREDPLLMIKRREQASLRAIMDNPLAVKELKKSRKEKKSKKDKKDKKDTKDKIAKHERTSDRVSKRGSSREQDRERERERGRERDSERRHHRHRHHSDRRSSRDYRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.5
3 0.6
4 0.68
5 0.67
6 0.67
7 0.67
8 0.66
9 0.64
10 0.6
11 0.59
12 0.55
13 0.59
14 0.64
15 0.64
16 0.69
17 0.73
18 0.77
19 0.75
20 0.77
21 0.76
22 0.76
23 0.74
24 0.71
25 0.68
26 0.62
27 0.62
28 0.57
29 0.53
30 0.49
31 0.46
32 0.47
33 0.45
34 0.41
35 0.39
36 0.39
37 0.34
38 0.34
39 0.35
40 0.3
41 0.26
42 0.25
43 0.2
44 0.23
45 0.26
46 0.25
47 0.3
48 0.3
49 0.29
50 0.31
51 0.37
52 0.35
53 0.36
54 0.35
55 0.32
56 0.33
57 0.34
58 0.33
59 0.32
60 0.3
61 0.26
62 0.22
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.13
80 0.12
81 0.1
82 0.1
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.17
88 0.27
89 0.29
90 0.3
91 0.28
92 0.32
93 0.34
94 0.32
95 0.28
96 0.21
97 0.2
98 0.21
99 0.21
100 0.16
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.1
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.09
110 0.08
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.16
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.17
127 0.21
128 0.25
129 0.24
130 0.25
131 0.26
132 0.31
133 0.32
134 0.34
135 0.28
136 0.27
137 0.31
138 0.35
139 0.33
140 0.29
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.2
145 0.15
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.14
151 0.23
152 0.31
153 0.39
154 0.48
155 0.58
156 0.68
157 0.79
158 0.83
159 0.85
160 0.89
161 0.91
162 0.93
163 0.94
164 0.94
165 0.94
166 0.95
167 0.94
168 0.93
169 0.93
170 0.9
171 0.89
172 0.88
173 0.82
174 0.81
175 0.82
176 0.79
177 0.72
178 0.75
179 0.69
180 0.66
181 0.69
182 0.67
183 0.62
184 0.61
185 0.6
186 0.56
187 0.58
188 0.61
189 0.6
190 0.6
191 0.63
192 0.68
193 0.72
194 0.74
195 0.76
196 0.76
197 0.74
198 0.75
199 0.7
200 0.7
201 0.69
202 0.7
203 0.68
204 0.68
205 0.7
206 0.71
207 0.75
208 0.76
209 0.78
210 0.79
211 0.83
212 0.84
213 0.88
214 0.88
215 0.91
216 0.92
217 0.92
218 0.92
219 0.93
220 0.93
221 0.92
222 0.89