Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2H5L3

Protein Details
Accession A0A1X2H5L3    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-60FGNTPFKKAPIVRRRLRKIRRRVVYSLKKPVSHydrophilic
68-92YNRIMDRKLKQLKKQTKELKEQGYTHydrophilic
184-226KLPTSRFKEPGKRGRPPKRHTLQDPEGKRRPGRPPKIAPRPVGBasic
371-395SIPPGPQTHAKRPRGRPRKDPAPEEBasic
423-445QPSANIPKKSRGRPAKKAVPVDQHydrophilic
524-545VTNAVERPTKRPRGRPPKNSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-50KKAPIVRRRLRKIRRR
189-321RFKEPGKRGRPPKRHTLQDPEGKRRPGRPPKIAPRPVGRPPKAASLSIGTAIKRSPGRPRKMPSSTAEPKRPRGRPPKAATLSIETGIKRSPGRPRKMPSSTAEPKRPRGRPPTKLSASAPILLPRGRGRPRK
380-416AKRPRGRPRKDPAPEELIPRPSIEIPRRRGHPNMKAT
420-440RPIQPSANIPKKSRGRPAKKA
455-463RRGPGRPRK
530-545RPTKRPRGRPPKNSKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVGQNMEEEEFTFTAADVQQGSISHLPGFGNTPFKKAPIVRRRLRKIRRRVVYSLKKPVSVNLRNITYNRIMDRKLKQLKKQTKELKEQGYTDDEINAFLNGDMEEDSSENDNEHDDEHENSDNNYKTTSRQVQARNAPLNKTTVSDNNILSSRLRPRTHPLAPSFIFHYDCPHWPCILAYKVKLPTSRFKEPGKRGRPPKRHTLQDPEGKRRPGRPPKIAPRPVGRPPKAASLSIGTAIKRSPGRPRKMPSSTAEPKRPRGRPPKAATLSIETGIKRSPGRPRKMPSSTAEPKRPRGRPPTKLSASAPILLPRGRGRPRKSVTPQGLAGLFLSAGGPTRRLSKAERIALLTQPLQSFSSLSSLSSLSSLSIPPGPQTHAKRPRGRPRKDPAPEELIPRPSIEIPRRRGHPNMKATNVTRPIQPSANIPKKSRGRPAKKAVPVDQPVQPSTGTPRRGPGRPRKIPTNTAQQQRVPIVIDELTRAQRPNQPTRSADSATEESGREIAKHRAGRTSKRTAETSSAVTNAVERPTKRPRGRPPKNSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.17
9 0.16
10 0.17
11 0.16
12 0.17
13 0.16
14 0.16
15 0.19
16 0.18
17 0.26
18 0.26
19 0.31
20 0.3
21 0.32
22 0.38
23 0.41
24 0.49
25 0.5
26 0.59
27 0.63
28 0.73
29 0.82
30 0.86
31 0.9
32 0.9
33 0.9
34 0.91
35 0.91
36 0.88
37 0.86
38 0.86
39 0.87
40 0.86
41 0.86
42 0.79
43 0.73
44 0.66
45 0.64
46 0.63
47 0.59
48 0.57
49 0.53
50 0.54
51 0.53
52 0.53
53 0.53
54 0.47
55 0.44
56 0.41
57 0.39
58 0.38
59 0.43
60 0.47
61 0.52
62 0.57
63 0.61
64 0.65
65 0.71
66 0.78
67 0.78
68 0.83
69 0.83
70 0.82
71 0.84
72 0.84
73 0.81
74 0.76
75 0.7
76 0.63
77 0.57
78 0.49
79 0.39
80 0.34
81 0.25
82 0.21
83 0.2
84 0.16
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.16
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.24
110 0.23
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.28
116 0.34
117 0.32
118 0.39
119 0.44
120 0.52
121 0.59
122 0.64
123 0.64
124 0.59
125 0.58
126 0.52
127 0.48
128 0.4
129 0.34
130 0.29
131 0.24
132 0.26
133 0.26
134 0.25
135 0.25
136 0.25
137 0.25
138 0.23
139 0.23
140 0.28
141 0.32
142 0.34
143 0.34
144 0.4
145 0.48
146 0.52
147 0.54
148 0.49
149 0.49
150 0.48
151 0.47
152 0.42
153 0.35
154 0.32
155 0.25
156 0.27
157 0.22
158 0.26
159 0.29
160 0.27
161 0.25
162 0.24
163 0.24
164 0.25
165 0.27
166 0.25
167 0.22
168 0.27
169 0.31
170 0.34
171 0.38
172 0.36
173 0.4
174 0.45
175 0.51
176 0.5
177 0.52
178 0.59
179 0.65
180 0.72
181 0.71
182 0.72
183 0.75
184 0.81
185 0.85
186 0.8
187 0.81
188 0.79
189 0.78
190 0.75
191 0.74
192 0.71
193 0.7
194 0.72
195 0.7
196 0.68
197 0.64
198 0.62
199 0.58
200 0.61
201 0.63
202 0.65
203 0.65
204 0.69
205 0.75
206 0.83
207 0.83
208 0.77
209 0.72
210 0.7
211 0.69
212 0.7
213 0.61
214 0.55
215 0.5
216 0.53
217 0.49
218 0.43
219 0.35
220 0.27
221 0.25
222 0.23
223 0.22
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.15
228 0.14
229 0.16
230 0.24
231 0.32
232 0.39
233 0.46
234 0.51
235 0.57
236 0.59
237 0.62
238 0.55
239 0.55
240 0.57
241 0.57
242 0.61
243 0.56
244 0.59
245 0.63
246 0.64
247 0.64
248 0.66
249 0.68
250 0.68
251 0.7
252 0.72
253 0.66
254 0.64
255 0.56
256 0.49
257 0.42
258 0.32
259 0.29
260 0.18
261 0.16
262 0.14
263 0.15
264 0.12
265 0.14
266 0.24
267 0.31
268 0.38
269 0.44
270 0.49
271 0.56
272 0.6
273 0.61
274 0.54
275 0.55
276 0.57
277 0.57
278 0.61
279 0.56
280 0.59
281 0.63
282 0.64
283 0.62
284 0.64
285 0.66
286 0.66
287 0.7
288 0.72
289 0.66
290 0.66
291 0.6
292 0.55
293 0.47
294 0.4
295 0.32
296 0.24
297 0.23
298 0.2
299 0.2
300 0.16
301 0.22
302 0.28
303 0.36
304 0.39
305 0.48
306 0.51
307 0.59
308 0.62
309 0.65
310 0.62
311 0.58
312 0.54
313 0.45
314 0.42
315 0.32
316 0.26
317 0.16
318 0.11
319 0.07
320 0.06
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.19
330 0.27
331 0.34
332 0.38
333 0.39
334 0.38
335 0.38
336 0.37
337 0.36
338 0.28
339 0.23
340 0.19
341 0.18
342 0.16
343 0.14
344 0.13
345 0.11
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.12
362 0.14
363 0.21
364 0.27
365 0.36
366 0.45
367 0.54
368 0.62
369 0.71
370 0.79
371 0.83
372 0.84
373 0.83
374 0.83
375 0.85
376 0.83
377 0.77
378 0.71
379 0.69
380 0.64
381 0.59
382 0.54
383 0.46
384 0.39
385 0.35
386 0.31
387 0.26
388 0.31
389 0.34
390 0.38
391 0.41
392 0.47
393 0.52
394 0.54
395 0.6
396 0.62
397 0.63
398 0.65
399 0.66
400 0.64
401 0.66
402 0.63
403 0.64
404 0.6
405 0.52
406 0.45
407 0.41
408 0.4
409 0.36
410 0.35
411 0.34
412 0.39
413 0.47
414 0.49
415 0.48
416 0.54
417 0.6
418 0.66
419 0.69
420 0.69
421 0.7
422 0.75
423 0.82
424 0.83
425 0.82
426 0.83
427 0.78
428 0.77
429 0.71
430 0.65
431 0.59
432 0.53
433 0.46
434 0.4
435 0.33
436 0.25
437 0.29
438 0.33
439 0.32
440 0.3
441 0.37
442 0.42
443 0.49
444 0.58
445 0.6
446 0.64
447 0.7
448 0.75
449 0.78
450 0.79
451 0.8
452 0.76
453 0.76
454 0.73
455 0.72
456 0.71
457 0.64
458 0.62
459 0.56
460 0.51
461 0.42
462 0.34
463 0.28
464 0.24
465 0.22
466 0.19
467 0.21
468 0.22
469 0.23
470 0.24
471 0.25
472 0.3
473 0.38
474 0.46
475 0.49
476 0.53
477 0.53
478 0.58
479 0.61
480 0.56
481 0.5
482 0.46
483 0.41
484 0.36
485 0.36
486 0.3
487 0.24
488 0.25
489 0.23
490 0.18
491 0.2
492 0.24
493 0.3
494 0.35
495 0.37
496 0.44
497 0.51
498 0.6
499 0.64
500 0.68
501 0.68
502 0.67
503 0.68
504 0.63
505 0.62
506 0.56
507 0.51
508 0.44
509 0.37
510 0.32
511 0.29
512 0.27
513 0.23
514 0.25
515 0.27
516 0.26
517 0.33
518 0.43
519 0.54
520 0.6
521 0.67
522 0.73
523 0.79
524 0.88
525 0.91