Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HP17

Protein Details
Accession A0A1X2HP17    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-225VNGFQQFKKKKGKKGKKKDAQQPVVFHydrophilic
245-269ELKVQREEQKRKRKEEERRRYSRSPBasic
296-322YYETSSRRHRRDSRSPPRRRRASPSMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-217KKKKGKKGKKK
253-267QKRKRKEEERRRYSR
302-335RRHRRDSRSPPRRRRASPSMSPSPPPVRRRPSPP
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPMSLYGDLPDPGKSSSNPDQAKGHDSPGTSFSSLYSSLPAPGTNPPPQQSSPSPRLPPFSSSPSSSTATATTNAGPSAAQPSVQKKDASPAAPAPPSSASAGWGSASHFRPVRRRPVIQAKPKLRPVIPAGATIVSTTTVNKQQQVQQQQQEQQQQQLQQRKDEPEEPTLQIPKAPVMPRAFAGSASSHLPFHSTSDDVNGFQQFKKKKGKKGKKKDAQQPVVFDMNEDYDPHRPNDYQQYKEELKVQREEQKRKRKEEERRRYSRSPSPYSSASDRSPSPPRNRGRAYAPPTDYYETSSRRHRRDSRSPPRRRRASPSMSPSPPPVRRRPSPPMRPEPQSSRMDLEETAEDAYMRRVRLSERGRLPQQPEPAQPAQPAQPRSEYDDDTMPMGLGFGADLRGADERQRAPPAFVQAKTMEPPRRQPTPPPPSTVVLLTNMVGPGEVDDMLQTETADECSNYGKVERCLIYEIPHGAEDTAVRIFVKFFEKAAAQRAIQHLNGRLFGGRKVVARYFDDERFDRLDLAPGPDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.25
3 0.33
4 0.42
5 0.43
6 0.44
7 0.47
8 0.47
9 0.53
10 0.47
11 0.42
12 0.36
13 0.35
14 0.34
15 0.32
16 0.33
17 0.27
18 0.25
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.19
23 0.19
24 0.15
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.21
30 0.27
31 0.31
32 0.36
33 0.36
34 0.41
35 0.43
36 0.47
37 0.49
38 0.52
39 0.52
40 0.55
41 0.59
42 0.57
43 0.62
44 0.58
45 0.55
46 0.51
47 0.51
48 0.47
49 0.44
50 0.43
51 0.41
52 0.41
53 0.36
54 0.32
55 0.27
56 0.24
57 0.22
58 0.21
59 0.19
60 0.17
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.17
69 0.24
70 0.29
71 0.33
72 0.33
73 0.29
74 0.37
75 0.41
76 0.38
77 0.35
78 0.34
79 0.36
80 0.37
81 0.37
82 0.31
83 0.27
84 0.27
85 0.25
86 0.2
87 0.16
88 0.15
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.17
94 0.19
95 0.22
96 0.25
97 0.29
98 0.38
99 0.44
100 0.53
101 0.54
102 0.56
103 0.61
104 0.69
105 0.75
106 0.76
107 0.79
108 0.77
109 0.77
110 0.79
111 0.76
112 0.66
113 0.61
114 0.55
115 0.54
116 0.47
117 0.4
118 0.35
119 0.3
120 0.29
121 0.23
122 0.19
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.18
128 0.2
129 0.22
130 0.25
131 0.31
132 0.39
133 0.46
134 0.5
135 0.5
136 0.55
137 0.58
138 0.62
139 0.63
140 0.57
141 0.54
142 0.5
143 0.49
144 0.5
145 0.52
146 0.48
147 0.45
148 0.49
149 0.48
150 0.49
151 0.48
152 0.44
153 0.41
154 0.43
155 0.39
156 0.37
157 0.35
158 0.31
159 0.27
160 0.23
161 0.2
162 0.22
163 0.21
164 0.23
165 0.23
166 0.24
167 0.23
168 0.26
169 0.24
170 0.19
171 0.19
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.23
192 0.22
193 0.29
194 0.39
195 0.45
196 0.52
197 0.62
198 0.72
199 0.77
200 0.86
201 0.9
202 0.88
203 0.91
204 0.91
205 0.91
206 0.88
207 0.8
208 0.72
209 0.64
210 0.57
211 0.47
212 0.37
213 0.27
214 0.19
215 0.17
216 0.14
217 0.12
218 0.14
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.17
223 0.19
224 0.29
225 0.33
226 0.32
227 0.32
228 0.38
229 0.37
230 0.38
231 0.43
232 0.37
233 0.34
234 0.34
235 0.36
236 0.38
237 0.45
238 0.54
239 0.57
240 0.63
241 0.67
242 0.71
243 0.77
244 0.78
245 0.81
246 0.82
247 0.83
248 0.83
249 0.84
250 0.84
251 0.79
252 0.76
253 0.72
254 0.69
255 0.64
256 0.57
257 0.52
258 0.46
259 0.44
260 0.41
261 0.37
262 0.3
263 0.26
264 0.24
265 0.25
266 0.3
267 0.34
268 0.38
269 0.43
270 0.47
271 0.52
272 0.54
273 0.52
274 0.51
275 0.54
276 0.53
277 0.51
278 0.49
279 0.42
280 0.43
281 0.42
282 0.36
283 0.3
284 0.29
285 0.25
286 0.27
287 0.34
288 0.39
289 0.41
290 0.5
291 0.55
292 0.59
293 0.67
294 0.76
295 0.77
296 0.81
297 0.88
298 0.89
299 0.91
300 0.91
301 0.84
302 0.82
303 0.81
304 0.78
305 0.76
306 0.73
307 0.71
308 0.65
309 0.61
310 0.57
311 0.55
312 0.54
313 0.52
314 0.52
315 0.52
316 0.55
317 0.62
318 0.67
319 0.69
320 0.72
321 0.75
322 0.75
323 0.73
324 0.73
325 0.7
326 0.67
327 0.64
328 0.57
329 0.5
330 0.43
331 0.38
332 0.34
333 0.29
334 0.24
335 0.16
336 0.14
337 0.13
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.15
347 0.24
348 0.29
349 0.33
350 0.37
351 0.45
352 0.48
353 0.53
354 0.56
355 0.53
356 0.55
357 0.51
358 0.47
359 0.47
360 0.46
361 0.42
362 0.38
363 0.35
364 0.34
365 0.35
366 0.35
367 0.3
368 0.31
369 0.31
370 0.36
371 0.38
372 0.33
373 0.29
374 0.3
375 0.28
376 0.25
377 0.23
378 0.16
379 0.12
380 0.1
381 0.08
382 0.05
383 0.04
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.07
390 0.07
391 0.11
392 0.16
393 0.18
394 0.22
395 0.28
396 0.28
397 0.29
398 0.32
399 0.38
400 0.38
401 0.36
402 0.36
403 0.32
404 0.34
405 0.34
406 0.39
407 0.38
408 0.37
409 0.46
410 0.48
411 0.53
412 0.54
413 0.6
414 0.63
415 0.66
416 0.66
417 0.63
418 0.61
419 0.56
420 0.55
421 0.47
422 0.38
423 0.3
424 0.27
425 0.21
426 0.18
427 0.16
428 0.13
429 0.11
430 0.09
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.15
450 0.18
451 0.19
452 0.26
453 0.26
454 0.26
455 0.29
456 0.3
457 0.3
458 0.3
459 0.3
460 0.25
461 0.25
462 0.23
463 0.19
464 0.19
465 0.16
466 0.13
467 0.12
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.13
473 0.17
474 0.16
475 0.16
476 0.19
477 0.22
478 0.24
479 0.31
480 0.32
481 0.28
482 0.33
483 0.38
484 0.38
485 0.38
486 0.41
487 0.4
488 0.38
489 0.39
490 0.35
491 0.33
492 0.3
493 0.29
494 0.3
495 0.26
496 0.27
497 0.31
498 0.34
499 0.36
500 0.37
501 0.41
502 0.42
503 0.43
504 0.46
505 0.42
506 0.42
507 0.41
508 0.39
509 0.36
510 0.31
511 0.32
512 0.28