Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HIF8

Protein Details
Accession A0A1X2HIF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-146IRSMNPKRKRHSLKGTRGPNTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-134KRKR
204-205RR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039599  RBM48  
IPR034264  RBM48_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
CDD cd12442  RRM_RBM48  
Amino Acid Sequences MATNRPEYRDSREPRAVKVYTPAQESRFLLFENVPSLGVIDQLIRACRKFGQVVEHHVLDDHPNATDLTDVVWVAFDSLASGRRAKKKLDDTPFFAQLLRVSYAPEYETMDDIRQKLVDRTVNVIRSMNPKRKRHSLKGTRGPNTNSSYRGYTGSHKGDDEGITSNDSGNTITTTATTATTTTMTATATDNDAPPLGSGVIKRRRRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.58
4 0.49
5 0.5
6 0.48
7 0.43
8 0.46
9 0.45
10 0.39
11 0.43
12 0.42
13 0.38
14 0.31
15 0.28
16 0.24
17 0.21
18 0.2
19 0.17
20 0.16
21 0.14
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.17
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.27
39 0.29
40 0.36
41 0.38
42 0.37
43 0.33
44 0.31
45 0.29
46 0.22
47 0.2
48 0.13
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.17
70 0.24
71 0.27
72 0.29
73 0.36
74 0.42
75 0.5
76 0.56
77 0.55
78 0.54
79 0.55
80 0.55
81 0.48
82 0.39
83 0.3
84 0.22
85 0.2
86 0.15
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.15
105 0.17
106 0.16
107 0.2
108 0.24
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.22
113 0.28
114 0.35
115 0.39
116 0.45
117 0.5
118 0.55
119 0.65
120 0.71
121 0.72
122 0.76
123 0.78
124 0.79
125 0.82
126 0.85
127 0.8
128 0.77
129 0.7
130 0.65
131 0.6
132 0.52
133 0.44
134 0.38
135 0.35
136 0.31
137 0.3
138 0.26
139 0.26
140 0.3
141 0.32
142 0.31
143 0.28
144 0.28
145 0.28
146 0.26
147 0.23
148 0.18
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.13
183 0.11
184 0.11
185 0.14
186 0.22
187 0.32