Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HDP1

Protein Details
Accession A0A1X2HDP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSLSPDPSGNPKRPRKRTVPKRELEALVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-22PKRPRKRTVPKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031824  RNF220_mid  
IPR040178  RNF220_RING  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16563  RING-HC_RNF220  
Amino Acid Sequences MSLSPDPSGNPKRPRKRTVPKRELEALVDNNGKRARRDFPACPVCKERIDPGQWPVHYQYELSRMDVTASVPEKGRKRGAAMLARQQLEGRRTKRSAYEERLERIQKNRQLRADTLQRMDDTSSSSITEATAAQAPLGEGIQLCPICSEALIGDSDAVNIHIDQCLIRQSENEAQQHHQQQQHQQGSWDEYEWAGQTRVRASALMEGGYSGAGFATTRKEEEDEDVDEDVDVEEEDEAYGESQYNEQDLVRQVEDDDDWDVTEEEEGGGGGEQVNVFSGASSDNPPSLVLDSLKARIHQLETASKTIPRCLICLEPYTTPLTSIVCWHVHCERCWLQTLGTKKLCPQCQKITTPADLRRIYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.86
3 0.89
4 0.91
5 0.92
6 0.92
7 0.88
8 0.86
9 0.85
10 0.76
11 0.7
12 0.66
13 0.57
14 0.52
15 0.51
16 0.43
17 0.42
18 0.43
19 0.4
20 0.36
21 0.38
22 0.38
23 0.41
24 0.48
25 0.47
26 0.53
27 0.62
28 0.62
29 0.63
30 0.62
31 0.58
32 0.54
33 0.52
34 0.48
35 0.46
36 0.47
37 0.46
38 0.47
39 0.5
40 0.46
41 0.47
42 0.45
43 0.39
44 0.35
45 0.32
46 0.29
47 0.29
48 0.3
49 0.28
50 0.25
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.26
60 0.29
61 0.34
62 0.38
63 0.34
64 0.36
65 0.41
66 0.47
67 0.48
68 0.49
69 0.52
70 0.53
71 0.52
72 0.49
73 0.44
74 0.41
75 0.39
76 0.42
77 0.37
78 0.38
79 0.39
80 0.42
81 0.47
82 0.5
83 0.54
84 0.53
85 0.59
86 0.56
87 0.58
88 0.62
89 0.6
90 0.55
91 0.52
92 0.54
93 0.52
94 0.55
95 0.58
96 0.56
97 0.56
98 0.55
99 0.56
100 0.56
101 0.54
102 0.47
103 0.43
104 0.37
105 0.34
106 0.32
107 0.25
108 0.19
109 0.16
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.12
157 0.18
158 0.23
159 0.24
160 0.23
161 0.24
162 0.3
163 0.34
164 0.35
165 0.33
166 0.31
167 0.35
168 0.43
169 0.44
170 0.39
171 0.36
172 0.32
173 0.32
174 0.29
175 0.23
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.15
209 0.17
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.07
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.11
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.11
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.07
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.13
278 0.15
279 0.18
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.21
284 0.23
285 0.22
286 0.25
287 0.29
288 0.31
289 0.33
290 0.33
291 0.33
292 0.32
293 0.33
294 0.34
295 0.28
296 0.25
297 0.26
298 0.29
299 0.28
300 0.32
301 0.31
302 0.27
303 0.29
304 0.31
305 0.28
306 0.24
307 0.22
308 0.19
309 0.16
310 0.18
311 0.2
312 0.2
313 0.2
314 0.24
315 0.3
316 0.34
317 0.34
318 0.4
319 0.41
320 0.41
321 0.45
322 0.42
323 0.38
324 0.39
325 0.44
326 0.45
327 0.45
328 0.44
329 0.46
330 0.54
331 0.59
332 0.62
333 0.64
334 0.64
335 0.67
336 0.71
337 0.71
338 0.69
339 0.68
340 0.68
341 0.67
342 0.66