FuNGI

A0A1X2HCS0

Protein Details

Accession

A0A1X2HCS0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
399-422	YQPGRTPPPRHPHQHHQQHQQQDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041588 Integrase_H2C2
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2

Amino Acid Sequences

MDMMQHGYEGNPFPSQHDNYYCLHDHHRADTQPTAPANLASHHLAQRPPAYTPIPDIMPYHTNDTSRNDDAYGAAAAAATAEADCYPSDGEFESIVQNYLRNLSSKKRDKALVDRRRYSLIVRVLKDPRNTAISTAQFRFWVKKMFQLVPLRNGMDVVCHDSKPVAMREEIYSILVRAHKEANHGGRDKTSALVRRRYSWIPKELIARFVRHCPFCISRRNGSQSPTIGLVPKTPPDYALDQAPPPINAHGGVPPFLPLRHQEMVDMNKPPDWQTPCGYEPHGSSTPTPTHTADDVVVGAAVPIHSHDATSPVRSFPTNYDQRSDVGPVSGGRCTNGEGGLSSSSSCAVAPAPPPPTPSDSLNSLYQISNIHFVTDPSVGGHQHVDAPPYMCYEKGQVYQPGRTPPPRHPHQHHQQHQQQDDYYFPTATYLACDHQPRRSSQVYSVTNSTPTSNNNNNNNNNTHSTNSASAAAAAAAVAFMFPSQLSSPSPSSSFSSSSSTSVSSSSVLSSPISPPPSSSPSNQLSFAPAYHYMQPSPTSQPNSMGVMGQPF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.32
3	0.35
4	0.37
5	0.38
6	0.36
7	0.43
8	0.42
9	0.37
10	0.4
11	0.41
12	0.4
13	0.42
14	0.47
15	0.44
16	0.45
17	0.47
18	0.43
19	0.42
20	0.4
21	0.37
22	0.31
23	0.29
24	0.26
25	0.22
26	0.24
27	0.2
28	0.24
29	0.25
30	0.29
31	0.28
32	0.32
33	0.35
34	0.34
35	0.33
36	0.33
37	0.32
38	0.29
39	0.32
40	0.31
41	0.28
42	0.27
43	0.26
44	0.26
45	0.27
46	0.28
47	0.3
48	0.29
49	0.29
50	0.3
51	0.35
52	0.37
53	0.36
54	0.35
55	0.29
56	0.27
57	0.26
58	0.24
59	0.19
60	0.12
61	0.09
62	0.07
63	0.07
64	0.06
65	0.05
66	0.04
67	0.03
68	0.04
69	0.04
70	0.05
71	0.05
72	0.06
73	0.07
74	0.07
75	0.08
76	0.08
77	0.1
78	0.09
79	0.1
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.15
87	0.15
88	0.15
89	0.18
90	0.26
91	0.36
92	0.45
93	0.5
94	0.53
95	0.57
96	0.6
97	0.68
98	0.71
99	0.71
100	0.71
101	0.71
102	0.68
103	0.66
104	0.61
105	0.52
106	0.49
107	0.47
108	0.45
109	0.42
110	0.46
111	0.5
112	0.54
113	0.55
114	0.5
115	0.43
116	0.4
117	0.38
118	0.34
119	0.34
120	0.33
121	0.35
122	0.34
123	0.32
124	0.3
125	0.32
126	0.33
127	0.29
128	0.31
129	0.27
130	0.32
131	0.37
132	0.37
133	0.43
134	0.48
135	0.49
136	0.46
137	0.49
138	0.43
139	0.37
140	0.35
141	0.27
142	0.19
143	0.17
144	0.18
145	0.17
146	0.16
147	0.16
148	0.16
149	0.18
150	0.19
151	0.21
152	0.16
153	0.15
154	0.17
155	0.18
156	0.2
157	0.19
158	0.16
159	0.14
160	0.12
161	0.14
162	0.14
163	0.13
164	0.14
165	0.16
166	0.16
167	0.2
168	0.26
169	0.28
170	0.33
171	0.35
172	0.34
173	0.32
174	0.33
175	0.29
176	0.25
177	0.25
178	0.26
179	0.29
180	0.37
181	0.37
182	0.39
183	0.44
184	0.47
185	0.51
186	0.5
187	0.51
188	0.45
189	0.46
190	0.5
191	0.46
192	0.48
193	0.41
194	0.38
195	0.33
196	0.38
197	0.4
198	0.34
199	0.34
200	0.32
201	0.35
202	0.37
203	0.44
204	0.42
205	0.43
206	0.49
207	0.54
208	0.51
209	0.49
210	0.48
211	0.4
212	0.36
213	0.31
214	0.25
215	0.21
216	0.18
217	0.18
218	0.15
219	0.16
220	0.17
221	0.15
222	0.15
223	0.16
224	0.18
225	0.16
226	0.18
227	0.17
228	0.16
229	0.18
230	0.18
231	0.15
232	0.14
233	0.13
234	0.1
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.15
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.2
251	0.24
252	0.26
253	0.26
254	0.2
255	0.2
256	0.2
257	0.2
258	0.22
259	0.21
260	0.21
261	0.21
262	0.25
263	0.24
264	0.26
265	0.25
266	0.21
267	0.18
268	0.22
269	0.21
270	0.18
271	0.18
272	0.2
273	0.21
274	0.21
275	0.23
276	0.17
277	0.18
278	0.17
279	0.17
280	0.14
281	0.12
282	0.1
283	0.08
284	0.07
285	0.05
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.02
290	0.03
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.1
296	0.11
297	0.14
298	0.14
299	0.13
300	0.14
301	0.15
302	0.16
303	0.15
304	0.24
305	0.28
306	0.29
307	0.3
308	0.3
309	0.31
310	0.31
311	0.29
312	0.2
313	0.13
314	0.13
315	0.12
316	0.12
317	0.12
318	0.11
319	0.1
320	0.1
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.09
325	0.08
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.07
337	0.08
338	0.12
339	0.15
340	0.15
341	0.17
342	0.19
343	0.23
344	0.23
345	0.25
346	0.23
347	0.24
348	0.26
349	0.25
350	0.24
351	0.22
352	0.2
353	0.18
354	0.17
355	0.14
356	0.15
357	0.14
358	0.14
359	0.13
360	0.13
361	0.15
362	0.14
363	0.13
364	0.1
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.09
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.13
374	0.15
375	0.14
376	0.17
377	0.17
378	0.13
379	0.13
380	0.15
381	0.17
382	0.19
383	0.23
384	0.27
385	0.3
386	0.34
387	0.37
388	0.4
389	0.42
390	0.47
391	0.47
392	0.49
393	0.56
394	0.59
395	0.65
396	0.66
397	0.71
398	0.75
399	0.82
400	0.81
401	0.82
402	0.81
403	0.8
404	0.76
405	0.69
406	0.6
407	0.51
408	0.44
409	0.37
410	0.32
411	0.23
412	0.19
413	0.17
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.12
418	0.12
419	0.16
420	0.22
421	0.24
422	0.3
423	0.34
424	0.35
425	0.4
426	0.43
427	0.42
428	0.42
429	0.5
430	0.47
431	0.46
432	0.47
433	0.42
434	0.39
435	0.37
436	0.33
437	0.25
438	0.25
439	0.3
440	0.34
441	0.42
442	0.48
443	0.56
444	0.6
445	0.63
446	0.63
447	0.59
448	0.55
449	0.5
450	0.43
451	0.36
452	0.33
453	0.3
454	0.28
455	0.25
456	0.2
457	0.18
458	0.16
459	0.13
460	0.1
461	0.08
462	0.06
463	0.04
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.02
468	0.03
469	0.03
470	0.06
471	0.07
472	0.09
473	0.11
474	0.16
475	0.19
476	0.21
477	0.22
478	0.22
479	0.25
480	0.26
481	0.27
482	0.24
483	0.27
484	0.26
485	0.27
486	0.26
487	0.24
488	0.21
489	0.2
490	0.18
491	0.15
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.14
498	0.16
499	0.21
500	0.24
501	0.22
502	0.25
503	0.3
504	0.35
505	0.36
506	0.37
507	0.39
508	0.41
509	0.44
510	0.43
511	0.37
512	0.36
513	0.34
514	0.31
515	0.28
516	0.25
517	0.25
518	0.3
519	0.32
520	0.28
521	0.3
522	0.32
523	0.3
524	0.35
525	0.39
526	0.39
527	0.38
528	0.41
529	0.41
530	0.42
531	0.39
532	0.33

A0A1X2HCS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer