Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HGI4

Protein Details
Accession A0A1X2HGI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-51AANSPSTTSKAKKKKKQAAKPAPTLRPYYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-43KAKKKKKQAAKP
412-424RRERNYRRARAKL
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
PS01360  ZF_MYND_1  
CDD cd20071  SET_SMYD  
Amino Acid Sequences MVAADTKAEPASHPPEEKPENLAANSPSTTSKAKKKKKQAAKPAPTLRPYYVQYMKDYPVELRSNKAKGRHAVAAADLPKGTTVCHEKGTAFVVRSDYLDQQCHVCLASLTTKLMCSDCQKAFYCSQTCLERDDTHTLVCSAMAQVDAIARSTDVEPDFLRLIALLLARRARGGVQEEEPVPNAPTPYWCTEDLVSHRSKADPGFLEVFGEAAPRLLSELPEQAQIPVDEIITLACRINSNAHGLGDNEARNTDVALGLFPVGAMFFNHACNPTCAFVGTENGKLAFRTIRDVGQGEELTVSYIDVYAPRDERRNTLLGSKHFWCKCKRCTTPMDESVDRFLQSVTCDQCGEDVYVIPPAPIDLVVQGKSSLDEPASEYKCAKCGHTSPSEDVASRVKQAESQYMEAMKAIRRERNYRRARAKLEPLVKKETKPGDLHPQNAVRLNASIPLMNCLRHEEDLTAAIDVNKAILDFMERNARQNLPENTPEVSDFWQNLGEMCDMMAAKYQALGSGPLVKRWKKEAQTAFANTIRIRSVVFGKDHPKTKLAQRLMTRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.41
3 0.46
4 0.46
5 0.44
6 0.43
7 0.41
8 0.39
9 0.41
10 0.34
11 0.33
12 0.32
13 0.28
14 0.24
15 0.24
16 0.29
17 0.31
18 0.4
19 0.47
20 0.58
21 0.66
22 0.76
23 0.83
24 0.88
25 0.92
26 0.93
27 0.94
28 0.93
29 0.94
30 0.92
31 0.9
32 0.83
33 0.77
34 0.69
35 0.64
36 0.57
37 0.55
38 0.52
39 0.47
40 0.47
41 0.47
42 0.46
43 0.42
44 0.41
45 0.34
46 0.34
47 0.38
48 0.34
49 0.36
50 0.4
51 0.45
52 0.48
53 0.53
54 0.53
55 0.52
56 0.57
57 0.56
58 0.51
59 0.46
60 0.43
61 0.43
62 0.37
63 0.32
64 0.26
65 0.2
66 0.19
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.2
71 0.21
72 0.23
73 0.25
74 0.24
75 0.26
76 0.3
77 0.28
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.23
83 0.24
84 0.26
85 0.25
86 0.26
87 0.24
88 0.23
89 0.23
90 0.22
91 0.19
92 0.14
93 0.11
94 0.12
95 0.15
96 0.15
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.24
105 0.24
106 0.29
107 0.3
108 0.33
109 0.35
110 0.39
111 0.37
112 0.33
113 0.35
114 0.35
115 0.34
116 0.33
117 0.35
118 0.3
119 0.32
120 0.35
121 0.31
122 0.27
123 0.27
124 0.23
125 0.19
126 0.17
127 0.13
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.08
139 0.08
140 0.11
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.14
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.08
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.21
164 0.22
165 0.23
166 0.23
167 0.2
168 0.17
169 0.15
170 0.13
171 0.11
172 0.12
173 0.15
174 0.17
175 0.19
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.24
180 0.25
181 0.27
182 0.25
183 0.23
184 0.23
185 0.22
186 0.23
187 0.19
188 0.21
189 0.17
190 0.19
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.17
195 0.16
196 0.11
197 0.1
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.1
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.15
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.07
295 0.09
296 0.11
297 0.16
298 0.17
299 0.2
300 0.22
301 0.23
302 0.22
303 0.26
304 0.29
305 0.27
306 0.31
307 0.31
308 0.35
309 0.36
310 0.4
311 0.43
312 0.46
313 0.52
314 0.58
315 0.6
316 0.59
317 0.63
318 0.65
319 0.66
320 0.64
321 0.62
322 0.53
323 0.49
324 0.46
325 0.39
326 0.33
327 0.24
328 0.17
329 0.12
330 0.12
331 0.16
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.06
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.07
360 0.07
361 0.1
362 0.18
363 0.2
364 0.2
365 0.21
366 0.21
367 0.26
368 0.26
369 0.25
370 0.22
371 0.24
372 0.29
373 0.35
374 0.38
375 0.36
376 0.4
377 0.4
378 0.35
379 0.33
380 0.31
381 0.25
382 0.24
383 0.22
384 0.18
385 0.2
386 0.21
387 0.27
388 0.25
389 0.26
390 0.26
391 0.25
392 0.25
393 0.22
394 0.22
395 0.18
396 0.21
397 0.24
398 0.28
399 0.32
400 0.42
401 0.51
402 0.59
403 0.66
404 0.7
405 0.75
406 0.78
407 0.79
408 0.78
409 0.78
410 0.76
411 0.76
412 0.74
413 0.69
414 0.7
415 0.66
416 0.59
417 0.58
418 0.55
419 0.51
420 0.46
421 0.46
422 0.48
423 0.5
424 0.51
425 0.5
426 0.49
427 0.46
428 0.47
429 0.43
430 0.33
431 0.29
432 0.26
433 0.23
434 0.19
435 0.18
436 0.14
437 0.18
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.2
442 0.22
443 0.22
444 0.23
445 0.19
446 0.19
447 0.21
448 0.21
449 0.16
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.1
454 0.09
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.09
460 0.09
461 0.12
462 0.22
463 0.22
464 0.26
465 0.3
466 0.32
467 0.31
468 0.38
469 0.41
470 0.37
471 0.4
472 0.39
473 0.36
474 0.36
475 0.34
476 0.28
477 0.25
478 0.22
479 0.2
480 0.19
481 0.19
482 0.18
483 0.17
484 0.18
485 0.16
486 0.12
487 0.11
488 0.12
489 0.1
490 0.11
491 0.14
492 0.12
493 0.11
494 0.13
495 0.13
496 0.11
497 0.12
498 0.13
499 0.11
500 0.21
501 0.21
502 0.27
503 0.36
504 0.39
505 0.42
506 0.48
507 0.56
508 0.53
509 0.62
510 0.64
511 0.64
512 0.68
513 0.69
514 0.68
515 0.61
516 0.59
517 0.49
518 0.43
519 0.37
520 0.28
521 0.24
522 0.21
523 0.24
524 0.26
525 0.29
526 0.33
527 0.4
528 0.47
529 0.53
530 0.54
531 0.51
532 0.5
533 0.56
534 0.59
535 0.58
536 0.59