Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HCL5

Protein Details
Accession A0A1X2HCL5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-71SNEDDKKKNRGANKGQRGKKRIVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-68KKKNRGANKGQRGKKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013785  Aldolase_TIM  
IPR035587  DUS-like_FMN-bd  
IPR018517  tRNA_hU_synthase_CS  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0050660  F:flavin adenine dinucleotide binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0102265  F:tRNA-dihydrouridine47 synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01207  Dus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01136  UPF0034  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd02801  DUS_like_FMN  
Amino Acid Sequences MSTERRSGEAPIKAEFRKERWFDDEEDQNLSANNAVFGDEEAEGQKFSNEDDKKKNRGANKGQRGKKRIVDQIRICNHIARAEECPFGEKCRHSHDLETYLATRPADLGDKCIQFDLFGKCRHGYKCRFLKAHLDENNKLIVNEELVKLNPKYTRNGLSSEMQRALNKRKYGFPKFNSVFVPFVKAKAEAEKKRKLEDQSEEASKRVALEGENGEAVKPEGSNDTAGQEKASEDINPTPAEVKEKIEDKTVQHTAEEFKLGAIDTEKPFKKTIDFRDKTYLAPLTTVGNLPFRRICKEYGVDITCGEMALVKNLLQGQQSEWALTKRHVSEDIFGIQICGSKPEMVAQACEVINQEVDVDFVDLNMGCPIDLVCNTGSGSALPEQKTKMARVLQGMRLMMDTPVTVKFRTGYKEGVFTTHKLMPIFENLNISLATLHGRSRQQRYTRLANWDFIQQLKSQSETIPIYGNGDVLSFEDYNRHKAETGVDGIMVGRGALIKPWIFDEIKQQRHWDISSRERFDMMRRFCDYGLEHWGTDSQGVNITRRFLCEWQSFLYRYIPVGLLEVLPQRINDRAPPFTGRDDLETLMASPRSADWVKLSEMFLGPAPEDFKFVPKHKSNSFEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.49
3 0.47
4 0.51
5 0.52
6 0.53
7 0.52
8 0.54
9 0.51
10 0.53
11 0.55
12 0.46
13 0.47
14 0.42
15 0.36
16 0.33
17 0.28
18 0.23
19 0.16
20 0.14
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.12
33 0.1
34 0.11
35 0.2
36 0.24
37 0.31
38 0.42
39 0.5
40 0.57
41 0.64
42 0.69
43 0.67
44 0.72
45 0.76
46 0.76
47 0.79
48 0.81
49 0.83
50 0.86
51 0.85
52 0.82
53 0.78
54 0.75
55 0.75
56 0.74
57 0.76
58 0.74
59 0.78
60 0.75
61 0.72
62 0.64
63 0.58
64 0.5
65 0.43
66 0.38
67 0.3
68 0.31
69 0.29
70 0.3
71 0.27
72 0.29
73 0.26
74 0.27
75 0.31
76 0.29
77 0.3
78 0.36
79 0.41
80 0.39
81 0.44
82 0.46
83 0.45
84 0.43
85 0.42
86 0.36
87 0.33
88 0.33
89 0.27
90 0.21
91 0.17
92 0.17
93 0.2
94 0.18
95 0.21
96 0.25
97 0.26
98 0.27
99 0.27
100 0.26
101 0.2
102 0.25
103 0.28
104 0.26
105 0.28
106 0.32
107 0.33
108 0.39
109 0.44
110 0.48
111 0.48
112 0.53
113 0.59
114 0.65
115 0.65
116 0.62
117 0.67
118 0.64
119 0.66
120 0.64
121 0.62
122 0.55
123 0.54
124 0.55
125 0.45
126 0.38
127 0.29
128 0.22
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.13
133 0.14
134 0.18
135 0.17
136 0.21
137 0.24
138 0.24
139 0.28
140 0.32
141 0.38
142 0.36
143 0.39
144 0.38
145 0.39
146 0.4
147 0.4
148 0.38
149 0.33
150 0.34
151 0.37
152 0.43
153 0.44
154 0.44
155 0.42
156 0.47
157 0.55
158 0.62
159 0.66
160 0.6
161 0.64
162 0.6
163 0.62
164 0.56
165 0.5
166 0.42
167 0.33
168 0.36
169 0.25
170 0.25
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.25
175 0.34
176 0.37
177 0.45
178 0.52
179 0.53
180 0.57
181 0.61
182 0.57
183 0.55
184 0.53
185 0.51
186 0.47
187 0.52
188 0.48
189 0.43
190 0.38
191 0.31
192 0.25
193 0.19
194 0.15
195 0.08
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.16
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.2
232 0.21
233 0.23
234 0.25
235 0.23
236 0.29
237 0.3
238 0.27
239 0.24
240 0.24
241 0.23
242 0.21
243 0.2
244 0.13
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.18
253 0.19
254 0.2
255 0.22
256 0.22
257 0.26
258 0.29
259 0.38
260 0.42
261 0.43
262 0.45
263 0.51
264 0.51
265 0.47
266 0.43
267 0.35
268 0.24
269 0.23
270 0.2
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.17
280 0.2
281 0.22
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.27
287 0.27
288 0.24
289 0.22
290 0.2
291 0.16
292 0.14
293 0.11
294 0.07
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.16
313 0.13
314 0.15
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.18
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.11
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.1
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.04
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.08
367 0.1
368 0.14
369 0.14
370 0.16
371 0.17
372 0.21
373 0.23
374 0.22
375 0.24
376 0.24
377 0.25
378 0.29
379 0.33
380 0.33
381 0.34
382 0.33
383 0.28
384 0.25
385 0.22
386 0.16
387 0.12
388 0.08
389 0.07
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.13
395 0.15
396 0.19
397 0.2
398 0.22
399 0.21
400 0.26
401 0.26
402 0.28
403 0.28
404 0.25
405 0.27
406 0.26
407 0.27
408 0.22
409 0.23
410 0.2
411 0.23
412 0.23
413 0.2
414 0.19
415 0.17
416 0.18
417 0.17
418 0.15
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.08
423 0.09
424 0.13
425 0.18
426 0.24
427 0.31
428 0.39
429 0.44
430 0.52
431 0.57
432 0.61
433 0.61
434 0.65
435 0.6
436 0.55
437 0.5
438 0.45
439 0.4
440 0.32
441 0.29
442 0.21
443 0.23
444 0.21
445 0.22
446 0.19
447 0.18
448 0.22
449 0.21
450 0.21
451 0.18
452 0.17
453 0.18
454 0.17
455 0.16
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.11
461 0.09
462 0.09
463 0.15
464 0.16
465 0.21
466 0.22
467 0.23
468 0.2
469 0.21
470 0.24
471 0.22
472 0.24
473 0.19
474 0.18
475 0.16
476 0.16
477 0.15
478 0.12
479 0.07
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.11
488 0.15
489 0.15
490 0.16
491 0.26
492 0.33
493 0.39
494 0.41
495 0.43
496 0.42
497 0.45
498 0.46
499 0.43
500 0.41
501 0.45
502 0.52
503 0.54
504 0.52
505 0.5
506 0.49
507 0.49
508 0.51
509 0.46
510 0.43
511 0.42
512 0.43
513 0.41
514 0.46
515 0.4
516 0.34
517 0.37
518 0.33
519 0.29
520 0.27
521 0.28
522 0.23
523 0.23
524 0.2
525 0.12
526 0.16
527 0.18
528 0.21
529 0.21
530 0.26
531 0.24
532 0.27
533 0.3
534 0.26
535 0.32
536 0.33
537 0.35
538 0.35
539 0.39
540 0.37
541 0.36
542 0.37
543 0.3
544 0.27
545 0.26
546 0.23
547 0.18
548 0.18
549 0.16
550 0.13
551 0.15
552 0.17
553 0.16
554 0.16
555 0.16
556 0.16
557 0.19
558 0.2
559 0.25
560 0.28
561 0.29
562 0.32
563 0.36
564 0.38
565 0.39
566 0.41
567 0.35
568 0.34
569 0.33
570 0.31
571 0.27
572 0.24
573 0.21
574 0.22
575 0.2
576 0.16
577 0.14
578 0.13
579 0.19
580 0.19
581 0.2
582 0.19
583 0.22
584 0.25
585 0.28
586 0.28
587 0.25
588 0.25
589 0.25
590 0.22
591 0.2
592 0.18
593 0.17
594 0.18
595 0.15
596 0.18
597 0.18
598 0.22
599 0.28
600 0.32
601 0.4
602 0.46
603 0.54
604 0.57