Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HGR0

Protein Details
Accession A0A1X2HGR0    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-103DEKTESTTKPVKKRKTLGKSTKQKSLREKTPNVEHydrophilic
713-740AEKKAKREEIRLEKKKRRQEKREAAAAABasic
847-869DDEDTNQKKKKNKKTPVEDKTAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-93VKKRKTLGKSTKQK
671-742KDGKKKEEPIKEKPAKEDKKLKQQKKTDLSPEEIAAAREQRRAEKKAKREEIRLEKKKRRQEKREAAAAAKS
855-859KKKNK
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 12.666, cyto_mito 10.333, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR045209  Rrp5  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
IPR008847  Suf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PF05843  Suf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05693  S1_Rrp5_repeat_hs1_sc1  
cd05697  S1_Rrp5_repeat_hs5  
Amino Acid Sequences MGAQKRKAAASSSQVKQSAATATINAAAAAETGFQRGGASALTPLEHREISNQVASDLFNNKSVEIASDDEKTESTTKPVKKRKTLGKSTKQKSLREKTPNVEIERLHAQKLIPGTLLLACISAVKDMEISVDLPFQLSGRIPITEISEEVTAAVERVAEGSDSDSEDEDEDMDSDSDESGPKLPQLKEMFHIGQYVRCRITGVKMEDVQGKVRAVIELSMRPASVNQEVPKVDLTEGVTATASVHSVEDHGYTLSFGIDDITGFCKTKEAQTYVDQYNKGNELVAGQVLECVVIKGGNSRTVQVSIDPKKVAAGLAKDPSKSLDSVVPGLLVNGLVEEVVPQGLVVKFMGLYTAKIHHSQIPHTDDLTKVYKPADNIKFRTLYTVMGADEKIVGGSLLPHIVSLSTPTNKDGKSVFEVLAYGTVLDTVTVQRSSKTGVTAFIPDIENVNAFAKPGHINDQGVFDYKGTYGPGTTHRARVLKYWGVDAVASVSLNSAVIDQKYMSRHDIAIGDRVKATVKALTPNGLIVSLTPSIDGYVPSNHFSDAQLTKPEKKFKPDSSVSCRVLNLDHERKQILLTAKQSLVESKLPIFESFEDMEAGKTSHGVIERLQSTGCMVRFYGRARGWLPLNQMSETQIDNINDAFRVGQTVRAHVLSVNKGTRRVLLSLIKDGKKKEEPIKEKPAKEDKKLKQQKKTDLSPEEIAAAREQRRAEKKAKREEIRLEKKKRRQEKREAAAAAKSQKNKDESDEDEEMEEQENGVDAMEIDTTEAAAASDDSSDEEEDAEEQDTQEPTAKDDSSSSSSSESESEDEDDSKSKAGALSLGGFDWSGQKTQNDSDSDSSDSDDEDTNQKKKKNKKTPVEDKTAELASSAPQSVADFERLVVSSPNSSYIWVNYMAHQLQLSEIEKARAIAERALKTINFREEQEKKNVWVALMNLENTYGTEGSLEDVFKRSCTYNEPKDMYLQLANIYERSQKKDKAEALWKRALKEFSQASDVWTQYAKFCLQHDNAEAARELLQRCVKVLPKHEHIKTITRFAQLEYKHGEPERGRTIFEGVLNSHPKRLDIWNMYLDMEIKFSAPESVNRLFERMTAMKLSSKKMKFIFKKWLQYAQQHGSEDDVELVKQKATDYVNSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.44
4 0.41
5 0.35
6 0.28
7 0.25
8 0.19
9 0.18
10 0.2
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.09
18 0.07
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.19
36 0.22
37 0.25
38 0.28
39 0.26
40 0.22
41 0.22
42 0.22
43 0.23
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.19
52 0.17
53 0.19
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.22
61 0.2
62 0.24
63 0.3
64 0.37
65 0.47
66 0.57
67 0.64
68 0.71
69 0.79
70 0.84
71 0.86
72 0.89
73 0.9
74 0.91
75 0.92
76 0.88
77 0.88
78 0.85
79 0.82
80 0.82
81 0.81
82 0.8
83 0.8
84 0.81
85 0.76
86 0.78
87 0.77
88 0.71
89 0.66
90 0.56
91 0.5
92 0.52
93 0.49
94 0.4
95 0.34
96 0.3
97 0.28
98 0.31
99 0.27
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.15
104 0.16
105 0.13
106 0.1
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.13
170 0.2
171 0.2
172 0.27
173 0.31
174 0.32
175 0.33
176 0.39
177 0.38
178 0.32
179 0.35
180 0.28
181 0.29
182 0.31
183 0.34
184 0.28
185 0.26
186 0.27
187 0.24
188 0.3
189 0.33
190 0.33
191 0.34
192 0.35
193 0.38
194 0.41
195 0.41
196 0.38
197 0.32
198 0.28
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.18
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.22
214 0.21
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.28
219 0.25
220 0.21
221 0.19
222 0.19
223 0.16
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.1
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.19
256 0.25
257 0.25
258 0.27
259 0.32
260 0.39
261 0.4
262 0.45
263 0.4
264 0.34
265 0.35
266 0.33
267 0.28
268 0.22
269 0.17
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.09
284 0.11
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.21
289 0.22
290 0.23
291 0.21
292 0.29
293 0.28
294 0.32
295 0.3
296 0.29
297 0.28
298 0.28
299 0.25
300 0.2
301 0.18
302 0.18
303 0.24
304 0.27
305 0.26
306 0.26
307 0.27
308 0.25
309 0.22
310 0.19
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.17
315 0.15
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.08
320 0.06
321 0.04
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.09
338 0.06
339 0.07
340 0.09
341 0.12
342 0.14
343 0.15
344 0.17
345 0.19
346 0.21
347 0.23
348 0.28
349 0.3
350 0.29
351 0.28
352 0.28
353 0.25
354 0.27
355 0.27
356 0.21
357 0.17
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.28
362 0.33
363 0.37
364 0.4
365 0.43
366 0.43
367 0.41
368 0.44
369 0.35
370 0.27
371 0.21
372 0.19
373 0.16
374 0.15
375 0.15
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.03
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.07
392 0.11
393 0.12
394 0.13
395 0.16
396 0.2
397 0.2
398 0.22
399 0.2
400 0.2
401 0.22
402 0.23
403 0.21
404 0.17
405 0.17
406 0.15
407 0.15
408 0.11
409 0.07
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.11
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.13
426 0.14
427 0.15
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.12
432 0.13
433 0.12
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.15
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.2
448 0.18
449 0.19
450 0.18
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.09
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.12
460 0.18
461 0.19
462 0.21
463 0.24
464 0.27
465 0.27
466 0.28
467 0.3
468 0.28
469 0.27
470 0.25
471 0.22
472 0.2
473 0.19
474 0.16
475 0.11
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.09
489 0.11
490 0.12
491 0.13
492 0.13
493 0.14
494 0.15
495 0.17
496 0.15
497 0.2
498 0.19
499 0.18
500 0.17
501 0.17
502 0.16
503 0.14
504 0.14
505 0.1
506 0.1
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.11
514 0.1
515 0.06
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.08
526 0.1
527 0.11
528 0.12
529 0.11
530 0.12
531 0.12
532 0.15
533 0.14
534 0.14
535 0.18
536 0.2
537 0.26
538 0.3
539 0.39
540 0.36
541 0.41
542 0.46
543 0.45
544 0.51
545 0.51
546 0.53
547 0.53
548 0.6
549 0.55
550 0.5
551 0.46
552 0.38
553 0.33
554 0.3
555 0.29
556 0.28
557 0.29
558 0.29
559 0.3
560 0.29
561 0.29
562 0.29
563 0.24
564 0.2
565 0.19
566 0.2
567 0.2
568 0.21
569 0.21
570 0.17
571 0.17
572 0.14
573 0.13
574 0.11
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.13
579 0.11
580 0.13
581 0.12
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.09
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.08
595 0.11
596 0.12
597 0.12
598 0.12
599 0.11
600 0.11
601 0.13
602 0.13
603 0.09
604 0.09
605 0.1
606 0.13
607 0.15
608 0.21
609 0.18
610 0.21
611 0.22
612 0.25
613 0.25
614 0.25
615 0.28
616 0.25
617 0.26
618 0.23
619 0.22
620 0.21
621 0.21
622 0.18
623 0.15
624 0.13
625 0.12
626 0.12
627 0.12
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.08
632 0.05
633 0.07
634 0.06
635 0.12
636 0.12
637 0.13
638 0.15
639 0.15
640 0.15
641 0.14
642 0.18
643 0.14
644 0.18
645 0.21
646 0.21
647 0.22
648 0.22
649 0.23
650 0.22
651 0.21
652 0.21
653 0.22
654 0.23
655 0.28
656 0.34
657 0.35
658 0.36
659 0.36
660 0.37
661 0.37
662 0.41
663 0.42
664 0.46
665 0.5
666 0.55
667 0.66
668 0.67
669 0.65
670 0.67
671 0.69
672 0.65
673 0.66
674 0.68
675 0.63
676 0.67
677 0.76
678 0.76
679 0.75
680 0.77
681 0.8
682 0.77
683 0.77
684 0.74
685 0.68
686 0.64
687 0.56
688 0.48
689 0.39
690 0.32
691 0.26
692 0.18
693 0.19
694 0.16
695 0.18
696 0.19
697 0.25
698 0.3
699 0.35
700 0.44
701 0.47
702 0.55
703 0.62
704 0.71
705 0.68
706 0.69
707 0.73
708 0.75
709 0.78
710 0.79
711 0.79
712 0.79
713 0.82
714 0.85
715 0.86
716 0.86
717 0.85
718 0.86
719 0.87
720 0.85
721 0.84
722 0.77
723 0.68
724 0.61
725 0.55
726 0.5
727 0.44
728 0.41
729 0.35
730 0.37
731 0.38
732 0.36
733 0.36
734 0.34
735 0.33
736 0.36
737 0.35
738 0.31
739 0.28
740 0.27
741 0.23
742 0.19
743 0.15
744 0.08
745 0.06
746 0.06
747 0.05
748 0.05
749 0.04
750 0.03
751 0.04
752 0.04
753 0.04
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.04
758 0.03
759 0.03
760 0.03
761 0.03
762 0.03
763 0.04
764 0.04
765 0.05
766 0.06
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.07
774 0.06
775 0.07
776 0.09
777 0.09
778 0.09
779 0.14
780 0.13
781 0.14
782 0.17
783 0.17
784 0.15
785 0.16
786 0.19
787 0.19
788 0.2
789 0.19
790 0.17
791 0.18
792 0.18
793 0.18
794 0.15
795 0.12
796 0.12
797 0.13
798 0.13
799 0.13
800 0.13
801 0.14
802 0.13
803 0.13
804 0.11
805 0.1
806 0.1
807 0.09
808 0.09
809 0.09
810 0.1
811 0.1
812 0.1
813 0.09
814 0.08
815 0.08
816 0.1
817 0.1
818 0.1
819 0.11
820 0.13
821 0.15
822 0.18
823 0.23
824 0.22
825 0.24
826 0.25
827 0.25
828 0.27
829 0.24
830 0.23
831 0.18
832 0.16
833 0.14
834 0.13
835 0.12
836 0.17
837 0.21
838 0.27
839 0.32
840 0.36
841 0.43
842 0.52
843 0.62
844 0.67
845 0.73
846 0.77
847 0.83
848 0.9
849 0.9
850 0.89
851 0.8
852 0.71
853 0.65
854 0.55
855 0.43
856 0.32
857 0.24
858 0.16
859 0.16
860 0.13
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.11
865 0.12
866 0.13
867 0.11
868 0.11
869 0.13
870 0.13
871 0.13
872 0.13
873 0.12
874 0.12
875 0.13
876 0.16
877 0.14
878 0.15
879 0.15
880 0.15
881 0.16
882 0.16
883 0.16
884 0.15
885 0.21
886 0.19
887 0.19
888 0.18
889 0.16
890 0.14
891 0.18
892 0.17
893 0.15
894 0.16
895 0.16
896 0.17
897 0.17
898 0.17
899 0.16
900 0.17
901 0.18
902 0.24
903 0.25
904 0.26
905 0.28
906 0.27
907 0.28
908 0.33
909 0.34
910 0.29
911 0.3
912 0.38
913 0.43
914 0.47
915 0.52
916 0.5
917 0.46
918 0.49
919 0.48
920 0.38
921 0.33
922 0.3
923 0.26
924 0.26
925 0.24
926 0.19
927 0.18
928 0.17
929 0.15
930 0.16
931 0.1
932 0.08
933 0.07
934 0.07
935 0.09
936 0.1
937 0.1
938 0.09
939 0.13
940 0.13
941 0.14
942 0.16
943 0.16
944 0.17
945 0.25
946 0.33
947 0.38
948 0.47
949 0.5
950 0.48
951 0.5
952 0.5
953 0.44
954 0.37
955 0.29
956 0.22
957 0.21
958 0.21
959 0.18
960 0.19
961 0.23
962 0.25
963 0.32
964 0.37
965 0.4
966 0.45
967 0.53
968 0.56
969 0.57
970 0.64
971 0.66
972 0.67
973 0.69
974 0.67
975 0.61
976 0.62
977 0.56
978 0.47
979 0.46
980 0.42
981 0.36
982 0.38
983 0.35
984 0.32
985 0.35
986 0.33
987 0.27
988 0.24
989 0.22
990 0.19
991 0.23
992 0.21
993 0.18
994 0.2
995 0.27
996 0.28
997 0.32
998 0.33
999 0.35
1000 0.34
1001 0.33
1002 0.31
1003 0.24
1004 0.25
1005 0.25
1006 0.23
1007 0.24
1008 0.28
1009 0.27
1010 0.28
1011 0.33
1012 0.36
1013 0.38
1014 0.47
1015 0.48
1016 0.53
1017 0.62
1018 0.63
1019 0.65
1020 0.62
1021 0.65
1022 0.61
1023 0.61
1024 0.57
1025 0.52
1026 0.5
1027 0.45
1028 0.49
1029 0.4
1030 0.41
1031 0.38
1032 0.35
1033 0.36
1034 0.36
1035 0.41
1036 0.35
1037 0.42
1038 0.45
1039 0.41
1040 0.4
1041 0.36
1042 0.38
1043 0.34
1044 0.34
1045 0.3
1046 0.23
1047 0.29
1048 0.36
1049 0.36
1050 0.37
1051 0.34
1052 0.33
1053 0.33
1054 0.37
1055 0.39
1056 0.37
1057 0.41
1058 0.41
1059 0.41
1060 0.41
1061 0.38
1062 0.34
1063 0.25
1064 0.2
1065 0.15
1066 0.12
1067 0.1
1068 0.1
1069 0.14
1070 0.15
1071 0.18
1072 0.23
1073 0.28
1074 0.32
1075 0.33
1076 0.34
1077 0.3
1078 0.29
1079 0.33
1080 0.29
1081 0.27
1082 0.25
1083 0.26
1084 0.31
1085 0.35
1086 0.41
1087 0.43
1088 0.44
1089 0.48
1090 0.52
1091 0.61
1092 0.63
1093 0.66
1094 0.71
1095 0.7
1096 0.78
1097 0.76
1098 0.8
1099 0.76
1100 0.75
1101 0.76
1102 0.73
1103 0.7
1104 0.61
1105 0.55
1106 0.48
1107 0.42
1108 0.35
1109 0.28
1110 0.21
1111 0.16
1112 0.17
1113 0.18
1114 0.16
1115 0.16
1116 0.16
1117 0.19
1118 0.21