Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2H5B0

Protein Details
Accession A0A1X2H5B0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
932-956QSMPPARTSSLKKRKEKPLPEMPTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
944-946KRK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11, nucl 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MYTPYTLQPLLPSVSSLIATADDYASSSPASPSSPRSSSSSFFSRRQQSPNPANSDKQPLVGSPSRFNSLLSQSASVHSSSPPSSSTSTSPPPQSAFTIDAVAAWDNNLYLGTSDGHILHFTLEEQTKARDGEIPYTSRLESKINLGFGRKSVERILVIPQVSKAIALCDATMSFYSLPFFDPIPVSLIPHIKGVSAFTHNVAQEGRIGEDGTVEICVGKRRVIQFYKIGELVQLWKEVPLHEGVITMIQMGHHVCLADHENHKLIDLTAFTSTVLVPTPHVVTSPTTTAGSLVSMTAGAHRVARPVLAVVKEGEFLMVSGTVSNSAQNQTTIGIIVNAYGEPVHGTMQWSSYPKAICVEYPYIAALLRNQTIEIHNVLDQQLLQVIQLNSSIQARGMAFAQGIKVWMEGLARRLRRRPWKAAEQDVNEEEEANYRRQVARYATMPARVLVYGRDAVLAQLVTPLVVQVDGLLDNHEIEIALETADQARNTMSADNNIHVARMQAELDYIYQKAGFLLLQETVFEDALTLLSKGNLDPRVVIAMFGQQAWLSDPAVYLFDGVRGLVDSLGAIENIVGQDPGRQQKNGTDSELRRTLMANAREALEKYLHIERGKFRHLIGQDHAISKAIDSALLHIYILNDNDTAILELLQRPNDCSLQGAIDALQGSKRYYAASILYHTKHMYDKVLELWTKIYTGEYADPRMTDGLGQIKRLLLQDIPNDELSLEATMRYAWWLLGRKAEDSIEVFIRSPRAPEMDMDAILSRLDKEASPSALRTYLEYVVWTRQSQSAEHHTRLAILYLNDVEQVAREHTEECGRLADEYKLSGRSRTFVEFLGDRRQSSEIIRRRLLLIRLLQRSPLYDAQTIMDRVQQDDALFNVERVIVYGRMKEHSKALAILIHNLCDFAGAETYCVTNGESAGTLPDMPTTSAQSMPPARTSSLKKRKEKPLPEMPTEAKQPTPEQMKERRELFAMLLRTYLDLQDSDVMLSRTMHLLATQGYYLDILEVLQWLPDDWPIATLQHFLIRSLRRSLHAYRNGQVVLGISRGENLMVGSELVNLYKEIGPTTVDIYSTCHQCHRPLAESIVVRLPNGNLSHIKCSED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.14
18 0.16
19 0.22
20 0.28
21 0.3
22 0.32
23 0.37
24 0.41
25 0.4
26 0.44
27 0.47
28 0.46
29 0.48
30 0.55
31 0.58
32 0.6
33 0.65
34 0.68
35 0.69
36 0.73
37 0.77
38 0.77
39 0.72
40 0.7
41 0.66
42 0.66
43 0.57
44 0.5
45 0.42
46 0.34
47 0.38
48 0.4
49 0.39
50 0.36
51 0.39
52 0.4
53 0.39
54 0.39
55 0.37
56 0.35
57 0.37
58 0.33
59 0.31
60 0.28
61 0.3
62 0.3
63 0.25
64 0.22
65 0.17
66 0.19
67 0.17
68 0.18
69 0.17
70 0.2
71 0.22
72 0.23
73 0.26
74 0.29
75 0.34
76 0.39
77 0.41
78 0.41
79 0.4
80 0.4
81 0.38
82 0.35
83 0.31
84 0.27
85 0.25
86 0.21
87 0.19
88 0.18
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.14
110 0.14
111 0.16
112 0.17
113 0.19
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.22
119 0.27
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.33
124 0.33
125 0.29
126 0.29
127 0.25
128 0.22
129 0.26
130 0.27
131 0.28
132 0.3
133 0.31
134 0.31
135 0.29
136 0.34
137 0.29
138 0.27
139 0.26
140 0.29
141 0.26
142 0.26
143 0.3
144 0.29
145 0.29
146 0.27
147 0.24
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.15
152 0.11
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.18
175 0.21
176 0.2
177 0.21
178 0.2
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.22
187 0.21
188 0.23
189 0.21
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.12
195 0.13
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.11
205 0.12
206 0.14
207 0.19
208 0.23
209 0.32
210 0.35
211 0.39
212 0.42
213 0.44
214 0.46
215 0.41
216 0.37
217 0.29
218 0.26
219 0.26
220 0.2
221 0.18
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.09
244 0.13
245 0.17
246 0.18
247 0.2
248 0.22
249 0.22
250 0.23
251 0.21
252 0.17
253 0.14
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.14
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.12
337 0.14
338 0.15
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.18
344 0.16
345 0.18
346 0.19
347 0.17
348 0.17
349 0.16
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.15
361 0.14
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.06
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.12
398 0.18
399 0.22
400 0.26
401 0.31
402 0.38
403 0.48
404 0.55
405 0.6
406 0.61
407 0.67
408 0.7
409 0.74
410 0.73
411 0.65
412 0.62
413 0.53
414 0.47
415 0.36
416 0.3
417 0.21
418 0.19
419 0.17
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.16
424 0.16
425 0.2
426 0.18
427 0.19
428 0.2
429 0.25
430 0.24
431 0.25
432 0.25
433 0.22
434 0.2
435 0.16
436 0.15
437 0.1
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.11
481 0.12
482 0.12
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.11
487 0.11
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.04
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.05
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.04
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.08
530 0.08
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.08
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.04
557 0.04
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.03
564 0.03
565 0.06
566 0.09
567 0.14
568 0.16
569 0.16
570 0.16
571 0.2
572 0.26
573 0.25
574 0.26
575 0.27
576 0.27
577 0.32
578 0.35
579 0.31
580 0.26
581 0.25
582 0.25
583 0.25
584 0.26
585 0.21
586 0.19
587 0.2
588 0.21
589 0.2
590 0.18
591 0.12
592 0.1
593 0.12
594 0.14
595 0.16
596 0.16
597 0.18
598 0.21
599 0.25
600 0.29
601 0.27
602 0.24
603 0.27
604 0.28
605 0.29
606 0.26
607 0.28
608 0.26
609 0.26
610 0.26
611 0.21
612 0.19
613 0.15
614 0.15
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.07
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.07
636 0.09
637 0.11
638 0.11
639 0.12
640 0.14
641 0.14
642 0.13
643 0.12
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.06
652 0.07
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.11
662 0.13
663 0.17
664 0.18
665 0.19
666 0.19
667 0.19
668 0.19
669 0.19
670 0.19
671 0.15
672 0.15
673 0.17
674 0.21
675 0.19
676 0.18
677 0.18
678 0.16
679 0.15
680 0.14
681 0.11
682 0.08
683 0.09
684 0.13
685 0.13
686 0.15
687 0.15
688 0.15
689 0.15
690 0.15
691 0.13
692 0.09
693 0.1
694 0.16
695 0.16
696 0.17
697 0.17
698 0.16
699 0.18
700 0.19
701 0.18
702 0.11
703 0.14
704 0.17
705 0.19
706 0.21
707 0.19
708 0.19
709 0.17
710 0.16
711 0.13
712 0.1
713 0.07
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.06
719 0.05
720 0.05
721 0.09
722 0.14
723 0.15
724 0.2
725 0.21
726 0.21
727 0.22
728 0.22
729 0.19
730 0.16
731 0.17
732 0.14
733 0.14
734 0.13
735 0.13
736 0.16
737 0.14
738 0.14
739 0.14
740 0.15
741 0.15
742 0.15
743 0.19
744 0.18
745 0.18
746 0.17
747 0.16
748 0.14
749 0.13
750 0.12
751 0.07
752 0.06
753 0.07
754 0.06
755 0.1
756 0.13
757 0.15
758 0.16
759 0.17
760 0.18
761 0.2
762 0.2
763 0.18
764 0.18
765 0.16
766 0.15
767 0.16
768 0.16
769 0.17
770 0.19
771 0.18
772 0.17
773 0.19
774 0.2
775 0.2
776 0.24
777 0.3
778 0.34
779 0.35
780 0.35
781 0.32
782 0.31
783 0.3
784 0.26
785 0.19
786 0.13
787 0.13
788 0.12
789 0.12
790 0.11
791 0.1
792 0.09
793 0.07
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.09
798 0.09
799 0.11
800 0.15
801 0.15
802 0.14
803 0.15
804 0.14
805 0.15
806 0.16
807 0.16
808 0.13
809 0.15
810 0.16
811 0.19
812 0.2
813 0.23
814 0.22
815 0.22
816 0.24
817 0.25
818 0.25
819 0.21
820 0.24
821 0.22
822 0.25
823 0.32
824 0.3
825 0.27
826 0.28
827 0.28
828 0.26
829 0.28
830 0.35
831 0.34
832 0.39
833 0.41
834 0.4
835 0.42
836 0.45
837 0.43
838 0.39
839 0.39
840 0.4
841 0.44
842 0.43
843 0.43
844 0.38
845 0.38
846 0.37
847 0.34
848 0.3
849 0.26
850 0.26
851 0.25
852 0.28
853 0.27
854 0.22
855 0.21
856 0.17
857 0.17
858 0.18
859 0.17
860 0.14
861 0.14
862 0.13
863 0.15
864 0.14
865 0.13
866 0.12
867 0.11
868 0.11
869 0.11
870 0.13
871 0.11
872 0.13
873 0.16
874 0.18
875 0.21
876 0.24
877 0.25
878 0.26
879 0.26
880 0.26
881 0.24
882 0.23
883 0.24
884 0.22
885 0.28
886 0.25
887 0.23
888 0.22
889 0.21
890 0.19
891 0.15
892 0.15
893 0.08
894 0.1
895 0.09
896 0.1
897 0.1
898 0.11
899 0.1
900 0.1
901 0.1
902 0.07
903 0.07
904 0.08
905 0.08
906 0.07
907 0.08
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.09
912 0.09
913 0.1
914 0.11
915 0.13
916 0.14
917 0.16
918 0.16
919 0.21
920 0.25
921 0.26
922 0.28
923 0.27
924 0.27
925 0.32
926 0.4
927 0.45
928 0.51
929 0.59
930 0.65
931 0.72
932 0.81
933 0.86
934 0.88
935 0.86
936 0.86
937 0.84
938 0.8
939 0.77
940 0.7
941 0.64
942 0.6
943 0.53
944 0.43
945 0.39
946 0.36
947 0.37
948 0.41
949 0.4
950 0.43
951 0.51
952 0.56
953 0.6
954 0.6
955 0.55
956 0.48
957 0.45
958 0.4
959 0.36
960 0.33
961 0.26
962 0.24
963 0.22
964 0.22
965 0.21
966 0.19
967 0.14
968 0.1
969 0.12
970 0.13
971 0.13
972 0.13
973 0.14
974 0.14
975 0.14
976 0.14
977 0.14
978 0.13
979 0.13
980 0.12
981 0.1
982 0.11
983 0.12
984 0.13
985 0.12
986 0.11
987 0.1
988 0.1
989 0.1
990 0.09
991 0.07
992 0.05
993 0.05
994 0.06
995 0.06
996 0.06
997 0.07
998 0.07
999 0.08
1000 0.09
1001 0.1
1002 0.09
1003 0.1
1004 0.1
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.13
1008 0.14
1009 0.17
1010 0.18
1011 0.18
1012 0.25
1013 0.29
1014 0.32
1015 0.37
1016 0.39
1017 0.37
1018 0.43
1019 0.49
1020 0.52
1021 0.56
1022 0.58
1023 0.54
1024 0.57
1025 0.54
1026 0.48
1027 0.41
1028 0.32
1029 0.24
1030 0.2
1031 0.17
1032 0.11
1033 0.12
1034 0.12
1035 0.11
1036 0.09
1037 0.08
1038 0.08
1039 0.08
1040 0.08
1041 0.07
1042 0.09
1043 0.09
1044 0.09
1045 0.1
1046 0.09
1047 0.11
1048 0.13
1049 0.13
1050 0.13
1051 0.13
1052 0.14
1053 0.15
1054 0.18
1055 0.16
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.18
1059 0.23
1060 0.26
1061 0.27
1062 0.3
1063 0.32
1064 0.37
1065 0.45
1066 0.45
1067 0.45
1068 0.44
1069 0.46
1070 0.47
1071 0.45
1072 0.44
1073 0.42
1074 0.37
1075 0.32
1076 0.3
1077 0.27
1078 0.26
1079 0.26
1080 0.28
1081 0.27
1082 0.31
1083 0.38