Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HE21

Protein Details
Accession A0A1X2HE21    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-146GDESSQPPPKRQRREEVVGKKQHKKKQPAAQKTQHDARLHydrophilic
656-696ADNKPSRSNGKKPQGGRPPKRDRPQQKGGRPQQNREKRQRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-107K
111-135SSQPPPKRQRREEVVGKKQHKKKQP
320-328KKQPKAKGE
653-696RRTADNKPSRSNGKKPQGGRPPKRDRPQQKGGRPQQNREKRQRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12414  RRM2_RBM28_like  
cd12416  RRM4_RBM28_like  
Amino Acid Sequences METKPKEKRTDGAISTLFVRNLGPKVTSQALEQLFADVGPIRHCFVVADTANGKVKEDDPNFKNRGFGYVRFALVDDAKQALEQLNRKKFMDNTIEVSYAKSKAVRKGDESSQPPPKRQRREEVVGKKQHKKKQPAAQKTQHDARLIIRNLPWKYNEEGLQKVFSAHGSVKDVSLPRKSPGGPLRGFGFVEMASVEEAEKAMEALNGSKHHGRTIVVDWSIPKDKYQKMEQEEEDKESNQKGADDDDDEAMEDANEDDDEDDDDDEEKEKENMDVEQDEDDEDEVEDESEDESENDESDDQDEAKEESEEESEDDDTKAKKQPKAKGEKRYPDASSGTTLFVRNLLFETTDGDLKAKFQQWGPVIYARIARDRNTSLSRGTGFVCMRQKEDADKIIKEADAMRALVAKETDETTLSMREKKKKGLVYDSILTPEAGAAFSEKFTLDGRVLDVTLAVSADRAGQIKTDKANRLKKEDKRNTYLMNEGVVFPNTPAAETMTEGELQRRQQSYASRKRLINTDPALFISKVRLSIRNMPLTIDEKELRKLGIQAVQMFKNQVKAKEREDLSKEEKEEGWHRLPKVKQAKIVRAKDRVDTNGQLRSRGYGFLEFYEHSHALAALRYLNNNPSLFAGKRLIVEFSLENQNVIERKQLRRTADNKPSRSNGKKPQGGRPPKRDRPQQKGGRPQQNREKRQRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.44
4 0.36
5 0.26
6 0.25
7 0.22
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.19
12 0.25
13 0.28
14 0.28
15 0.24
16 0.3
17 0.28
18 0.28
19 0.27
20 0.23
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.14
33 0.22
34 0.2
35 0.23
36 0.22
37 0.27
38 0.32
39 0.31
40 0.31
41 0.24
42 0.26
43 0.32
44 0.36
45 0.41
46 0.4
47 0.49
48 0.52
49 0.5
50 0.51
51 0.42
52 0.44
53 0.39
54 0.38
55 0.36
56 0.37
57 0.37
58 0.34
59 0.34
60 0.28
61 0.25
62 0.23
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.14
68 0.15
69 0.2
70 0.26
71 0.35
72 0.42
73 0.46
74 0.47
75 0.5
76 0.49
77 0.51
78 0.53
79 0.46
80 0.43
81 0.42
82 0.43
83 0.39
84 0.39
85 0.34
86 0.26
87 0.24
88 0.24
89 0.26
90 0.32
91 0.41
92 0.43
93 0.44
94 0.49
95 0.54
96 0.58
97 0.58
98 0.58
99 0.61
100 0.6
101 0.63
102 0.68
103 0.71
104 0.73
105 0.75
106 0.77
107 0.76
108 0.81
109 0.84
110 0.84
111 0.84
112 0.84
113 0.85
114 0.84
115 0.84
116 0.84
117 0.83
118 0.82
119 0.82
120 0.82
121 0.84
122 0.85
123 0.86
124 0.87
125 0.86
126 0.84
127 0.81
128 0.76
129 0.67
130 0.57
131 0.52
132 0.52
133 0.45
134 0.4
135 0.36
136 0.4
137 0.4
138 0.42
139 0.39
140 0.33
141 0.35
142 0.35
143 0.38
144 0.34
145 0.36
146 0.34
147 0.33
148 0.3
149 0.27
150 0.23
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.14
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.21
159 0.24
160 0.25
161 0.29
162 0.29
163 0.26
164 0.31
165 0.31
166 0.35
167 0.39
168 0.43
169 0.38
170 0.38
171 0.39
172 0.36
173 0.35
174 0.27
175 0.22
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.1
193 0.11
194 0.14
195 0.18
196 0.18
197 0.19
198 0.2
199 0.19
200 0.2
201 0.22
202 0.24
203 0.2
204 0.21
205 0.2
206 0.24
207 0.28
208 0.25
209 0.24
210 0.26
211 0.29
212 0.33
213 0.39
214 0.42
215 0.42
216 0.49
217 0.48
218 0.49
219 0.47
220 0.47
221 0.42
222 0.35
223 0.32
224 0.26
225 0.24
226 0.17
227 0.16
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.12
305 0.18
306 0.23
307 0.26
308 0.33
309 0.41
310 0.48
311 0.59
312 0.64
313 0.69
314 0.73
315 0.77
316 0.74
317 0.72
318 0.63
319 0.55
320 0.49
321 0.39
322 0.32
323 0.25
324 0.21
325 0.17
326 0.16
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.18
347 0.19
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.19
352 0.19
353 0.22
354 0.17
355 0.21
356 0.2
357 0.2
358 0.21
359 0.22
360 0.26
361 0.25
362 0.26
363 0.21
364 0.22
365 0.22
366 0.19
367 0.18
368 0.19
369 0.16
370 0.2
371 0.24
372 0.23
373 0.24
374 0.24
375 0.24
376 0.22
377 0.25
378 0.26
379 0.24
380 0.23
381 0.22
382 0.22
383 0.21
384 0.19
385 0.17
386 0.13
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.13
402 0.14
403 0.2
404 0.25
405 0.33
406 0.36
407 0.41
408 0.47
409 0.47
410 0.51
411 0.52
412 0.51
413 0.47
414 0.47
415 0.42
416 0.37
417 0.32
418 0.27
419 0.19
420 0.14
421 0.09
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.08
450 0.1
451 0.13
452 0.18
453 0.24
454 0.3
455 0.38
456 0.47
457 0.5
458 0.57
459 0.64
460 0.67
461 0.72
462 0.76
463 0.74
464 0.72
465 0.73
466 0.67
467 0.61
468 0.56
469 0.46
470 0.37
471 0.29
472 0.24
473 0.21
474 0.17
475 0.15
476 0.1
477 0.12
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.12
485 0.1
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.16
490 0.17
491 0.22
492 0.22
493 0.22
494 0.25
495 0.34
496 0.42
497 0.49
498 0.56
499 0.57
500 0.58
501 0.59
502 0.62
503 0.56
504 0.54
505 0.48
506 0.42
507 0.36
508 0.36
509 0.36
510 0.3
511 0.27
512 0.22
513 0.19
514 0.21
515 0.23
516 0.26
517 0.27
518 0.37
519 0.43
520 0.45
521 0.43
522 0.4
523 0.41
524 0.4
525 0.37
526 0.32
527 0.28
528 0.25
529 0.27
530 0.27
531 0.24
532 0.22
533 0.22
534 0.21
535 0.24
536 0.25
537 0.27
538 0.3
539 0.31
540 0.31
541 0.32
542 0.29
543 0.32
544 0.33
545 0.35
546 0.38
547 0.41
548 0.44
549 0.5
550 0.52
551 0.52
552 0.53
553 0.53
554 0.52
555 0.53
556 0.5
557 0.44
558 0.43
559 0.4
560 0.41
561 0.4
562 0.42
563 0.41
564 0.42
565 0.47
566 0.48
567 0.53
568 0.58
569 0.56
570 0.57
571 0.6
572 0.68
573 0.71
574 0.78
575 0.76
576 0.74
577 0.72
578 0.69
579 0.66
580 0.61
581 0.57
582 0.53
583 0.49
584 0.49
585 0.47
586 0.44
587 0.38
588 0.37
589 0.32
590 0.29
591 0.27
592 0.23
593 0.23
594 0.22
595 0.25
596 0.22
597 0.22
598 0.27
599 0.24
600 0.2
601 0.19
602 0.18
603 0.15
604 0.16
605 0.15
606 0.14
607 0.15
608 0.17
609 0.19
610 0.22
611 0.26
612 0.25
613 0.25
614 0.23
615 0.27
616 0.25
617 0.27
618 0.27
619 0.24
620 0.27
621 0.27
622 0.26
623 0.21
624 0.23
625 0.2
626 0.21
627 0.28
628 0.26
629 0.25
630 0.23
631 0.27
632 0.26
633 0.25
634 0.29
635 0.27
636 0.34
637 0.44
638 0.5
639 0.52
640 0.6
641 0.65
642 0.68
643 0.72
644 0.75
645 0.72
646 0.73
647 0.75
648 0.75
649 0.78
650 0.77
651 0.77
652 0.78
653 0.79
654 0.77
655 0.8
656 0.8
657 0.83
658 0.84
659 0.84
660 0.84
661 0.87
662 0.92
663 0.92
664 0.92
665 0.9
666 0.91
667 0.9
668 0.89
669 0.9
670 0.91
671 0.91
672 0.89
673 0.89
674 0.89
675 0.9
676 0.9