Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HHN1

Protein Details
Accession A0A1X2HHN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-198ETSTPKSRRQERIQKEDQKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-236KKSGK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007052  CS_dom  
IPR008978  HSP20-like_chaperone  
IPR039742  Shq1  
IPR007009  Shq1_dom  
Gene Ontology GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04925  SHQ1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51203  CS  
CDD cd06463  p23_like  
Amino Acid Sequences MITPTFKVDQDDNFVIVTIHTPHVRAQDVDLHADGNEFRFYLKPYFLRLYFPSSVVEDDASEAVYDPSSGQFVVKLSKATKGEYFPDLDLLTKLLARKGEQDGSKASKKPLIEVMSSEDYGGQEEMQEAVDFDWELPQELPEETINLGMAVYGFNGLHTGYFRHVNETANEINELDNPETSTPKSRRQERIQKEDQKFDEDHYAKDFAEDEDIRRVLDYKTVWYKELKRITKKSGKKPLIREINAVDEIDFARLTISDDSLIQFTDKDKAMMRDLPKKEYLLSSEKATYLGLLDLMFAYSYNHRIFEGENSVESVWCIGKLSSSMACLDQFTTMREVLLASYRRALAYPLYRHWELCQKVMNDVYILFKLGKRAILKALLDMKDMFDHHDVYYIYSKIWLNDYCTWVQQSSDHVIRTLSRELHYFQLQKKDVNFDLELLEQIVTSVLEDERKEAEENSRKELEGGSGEESEEESE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.2
4 0.19
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.2
10 0.25
11 0.27
12 0.26
13 0.26
14 0.3
15 0.31
16 0.33
17 0.3
18 0.26
19 0.23
20 0.24
21 0.21
22 0.15
23 0.14
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.17
28 0.19
29 0.25
30 0.25
31 0.3
32 0.37
33 0.37
34 0.4
35 0.39
36 0.43
37 0.39
38 0.38
39 0.34
40 0.29
41 0.29
42 0.25
43 0.22
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.14
61 0.15
62 0.18
63 0.18
64 0.25
65 0.26
66 0.28
67 0.31
68 0.31
69 0.33
70 0.32
71 0.34
72 0.27
73 0.28
74 0.25
75 0.22
76 0.18
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.2
85 0.24
86 0.3
87 0.29
88 0.31
89 0.34
90 0.39
91 0.44
92 0.42
93 0.4
94 0.37
95 0.36
96 0.36
97 0.38
98 0.35
99 0.3
100 0.28
101 0.32
102 0.31
103 0.31
104 0.28
105 0.21
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.09
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.13
149 0.13
150 0.17
151 0.19
152 0.2
153 0.2
154 0.23
155 0.23
156 0.19
157 0.19
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.2
169 0.21
170 0.3
171 0.38
172 0.46
173 0.54
174 0.63
175 0.72
176 0.73
177 0.79
178 0.8
179 0.82
180 0.77
181 0.76
182 0.67
183 0.61
184 0.52
185 0.44
186 0.44
187 0.35
188 0.31
189 0.26
190 0.26
191 0.22
192 0.22
193 0.2
194 0.11
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.11
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.21
208 0.22
209 0.23
210 0.26
211 0.3
212 0.35
213 0.43
214 0.46
215 0.48
216 0.52
217 0.59
218 0.65
219 0.69
220 0.71
221 0.73
222 0.74
223 0.72
224 0.74
225 0.74
226 0.75
227 0.67
228 0.6
229 0.5
230 0.45
231 0.39
232 0.33
233 0.23
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.09
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.14
257 0.17
258 0.21
259 0.25
260 0.31
261 0.33
262 0.35
263 0.35
264 0.34
265 0.32
266 0.29
267 0.29
268 0.25
269 0.24
270 0.22
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.19
275 0.15
276 0.1
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.19
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.14
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.15
326 0.16
327 0.14
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.17
332 0.18
333 0.16
334 0.22
335 0.26
336 0.28
337 0.34
338 0.34
339 0.35
340 0.36
341 0.4
342 0.34
343 0.34
344 0.36
345 0.3
346 0.33
347 0.34
348 0.32
349 0.23
350 0.22
351 0.21
352 0.15
353 0.15
354 0.13
355 0.13
356 0.16
357 0.17
358 0.21
359 0.2
360 0.22
361 0.25
362 0.29
363 0.28
364 0.3
365 0.36
366 0.32
367 0.32
368 0.3
369 0.27
370 0.24
371 0.24
372 0.22
373 0.17
374 0.18
375 0.16
376 0.2
377 0.19
378 0.2
379 0.24
380 0.21
381 0.19
382 0.21
383 0.22
384 0.19
385 0.24
386 0.22
387 0.25
388 0.29
389 0.33
390 0.31
391 0.32
392 0.33
393 0.29
394 0.28
395 0.23
396 0.23
397 0.26
398 0.28
399 0.27
400 0.25
401 0.26
402 0.27
403 0.3
404 0.31
405 0.27
406 0.25
407 0.27
408 0.29
409 0.33
410 0.38
411 0.4
412 0.39
413 0.46
414 0.47
415 0.49
416 0.5
417 0.51
418 0.47
419 0.46
420 0.41
421 0.32
422 0.32
423 0.28
424 0.25
425 0.19
426 0.17
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.07
431 0.06
432 0.08
433 0.08
434 0.11
435 0.12
436 0.14
437 0.16
438 0.18
439 0.2
440 0.2
441 0.3
442 0.36
443 0.39
444 0.43
445 0.44
446 0.42
447 0.41
448 0.4
449 0.33
450 0.27
451 0.27
452 0.23
453 0.21
454 0.21
455 0.2