Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1X2HTT4

Protein Details
Accession A0A1X2HTT4    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31VQEKPKVQTSRKGKKAWRKNIDLNDVDKHydrophilic
253-284HVPSKKATQRKTQTKRNKEKRARQEKLRAAIKHydrophilic
372-402MQKRNIIEPRVRQKRDRKYALKEYERRTYKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-20RKGKKAW
66-74KKMKGKKKL
114-131KRKREGAEILPPPKKKGG
257-290KKATQRKTQTKRNKEKRARQEKLRAAIKRNEKEM
408-423SRKAEQKEKQKQQKKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MAAVQEKPKVQTSRKGKKAWRKNIDLNDVDKALEGQRAEERVFGQKVSQDDALFTIDTAGDAEVAKKMKGKKKLKVDEILGERSAVPAVGVKALNDRKQDGSRYTKQQVDRLVKRKREGAEILPPPKKKGGKQVYDMWVEEESAEPQDTNGFLESVQVRKARAPTTFTKKPAAAIHQPSVALPHPGASYNPTAEEHQELLRLATDIEERKLAAQRRLDEQRSYRKELNDLPNEDQELSDDGDSDEDDNEGEGHVPSKKATQRKTQTKRNKEKRARQEKLRAAIKRNEKEMRKQIDLVEQLEKELAEHQAKVELATKRRQEMKEENEKMGKQRLSRHKYQDVNVELKLTDELSESLRQLKPEGSVFTDRYVSMQKRNIIEPRVRQKRDRKYALKEYERRTYKNFDAAESRKAEQKEKQKQQKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.8
4 0.83
5 0.89
6 0.9
7 0.89
8 0.87
9 0.88
10 0.88
11 0.88
12 0.82
13 0.74
14 0.68
15 0.58
16 0.49
17 0.39
18 0.31
19 0.23
20 0.21
21 0.18
22 0.16
23 0.2
24 0.22
25 0.23
26 0.23
27 0.24
28 0.28
29 0.29
30 0.27
31 0.24
32 0.25
33 0.27
34 0.29
35 0.29
36 0.22
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.18
41 0.16
42 0.12
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.1
51 0.12
52 0.12
53 0.17
54 0.25
55 0.33
56 0.43
57 0.52
58 0.57
59 0.67
60 0.77
61 0.8
62 0.79
63 0.76
64 0.74
65 0.7
66 0.65
67 0.54
68 0.45
69 0.36
70 0.29
71 0.24
72 0.15
73 0.1
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.2
80 0.25
81 0.3
82 0.3
83 0.32
84 0.34
85 0.38
86 0.42
87 0.41
88 0.44
89 0.47
90 0.53
91 0.55
92 0.57
93 0.56
94 0.56
95 0.58
96 0.6
97 0.62
98 0.63
99 0.67
100 0.67
101 0.67
102 0.69
103 0.62
104 0.59
105 0.54
106 0.49
107 0.49
108 0.51
109 0.56
110 0.56
111 0.54
112 0.5
113 0.53
114 0.52
115 0.46
116 0.49
117 0.52
118 0.52
119 0.56
120 0.62
121 0.61
122 0.59
123 0.56
124 0.46
125 0.36
126 0.3
127 0.24
128 0.17
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.11
142 0.11
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.18
147 0.22
148 0.22
149 0.23
150 0.26
151 0.31
152 0.39
153 0.44
154 0.44
155 0.45
156 0.42
157 0.43
158 0.42
159 0.4
160 0.38
161 0.37
162 0.36
163 0.33
164 0.32
165 0.29
166 0.28
167 0.22
168 0.16
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.14
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.06
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.15
198 0.17
199 0.2
200 0.22
201 0.24
202 0.3
203 0.36
204 0.37
205 0.36
206 0.39
207 0.45
208 0.47
209 0.5
210 0.48
211 0.43
212 0.44
213 0.48
214 0.51
215 0.47
216 0.45
217 0.42
218 0.39
219 0.39
220 0.36
221 0.28
222 0.2
223 0.14
224 0.12
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.04
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.14
244 0.19
245 0.26
246 0.31
247 0.4
248 0.5
249 0.61
250 0.69
251 0.74
252 0.8
253 0.84
254 0.9
255 0.91
256 0.91
257 0.91
258 0.92
259 0.93
260 0.93
261 0.9
262 0.88
263 0.87
264 0.83
265 0.82
266 0.79
267 0.73
268 0.68
269 0.68
270 0.69
271 0.63
272 0.64
273 0.63
274 0.59
275 0.63
276 0.66
277 0.65
278 0.58
279 0.56
280 0.5
281 0.5
282 0.48
283 0.42
284 0.36
285 0.3
286 0.27
287 0.25
288 0.22
289 0.15
290 0.14
291 0.16
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.16
296 0.16
297 0.17
298 0.22
299 0.23
300 0.25
301 0.33
302 0.36
303 0.39
304 0.47
305 0.48
306 0.49
307 0.53
308 0.59
309 0.62
310 0.63
311 0.61
312 0.59
313 0.59
314 0.55
315 0.54
316 0.48
317 0.41
318 0.47
319 0.54
320 0.56
321 0.63
322 0.68
323 0.69
324 0.71
325 0.71
326 0.7
327 0.65
328 0.61
329 0.53
330 0.46
331 0.36
332 0.31
333 0.27
334 0.18
335 0.13
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.15
340 0.15
341 0.21
342 0.22
343 0.22
344 0.22
345 0.23
346 0.24
347 0.25
348 0.27
349 0.26
350 0.3
351 0.3
352 0.31
353 0.31
354 0.28
355 0.27
356 0.33
357 0.31
358 0.33
359 0.38
360 0.42
361 0.43
362 0.5
363 0.54
364 0.53
365 0.57
366 0.59
367 0.64
368 0.69
369 0.71
370 0.74
371 0.78
372 0.82
373 0.85
374 0.86
375 0.84
376 0.83
377 0.89
378 0.9
379 0.9
380 0.88
381 0.83
382 0.83
383 0.81
384 0.76
385 0.7
386 0.68
387 0.62
388 0.62
389 0.56
390 0.5
391 0.53
392 0.52
393 0.54
394 0.51
395 0.47
396 0.45
397 0.47
398 0.49
399 0.48
400 0.56
401 0.59
402 0.66
403 0.75