Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HDC8

Protein Details
Accession A0A1X2HDC8    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-30DEVIKDRRREPRRTPSSQSAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-18R
20-21PR
215-234GGGGRARERGGGRNRGERSK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MASQLDRALDEVIKDRRREPRRTPSSQSAGGGRINKRSDRGVASRLGNSPFTRTVQLRGNRGSAGGNPGKRDSNSQWRHDLFDDDPRSGRNINSRLSGRFGQAGSSNRRNGPRGSDRFDRSSGSGRGDRNSGTEIVVENLHYNVIEKDLQDLFAMVGTVSKARIEFDRSGRSTGVAHISYTKPSDAEAAIAKYNNVELDGQPMQIKMAERERSEGGGGRARERGGGRNRGERSKNVRSETDLDQEMDAYMNKPAEVKVKDKEEKRNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.49
4 0.57
5 0.64
6 0.67
7 0.69
8 0.73
9 0.79
10 0.81
11 0.81
12 0.79
13 0.74
14 0.67
15 0.59
16 0.52
17 0.49
18 0.47
19 0.4
20 0.41
21 0.42
22 0.42
23 0.42
24 0.42
25 0.42
26 0.42
27 0.44
28 0.4
29 0.41
30 0.41
31 0.42
32 0.42
33 0.39
34 0.36
35 0.32
36 0.33
37 0.3
38 0.29
39 0.3
40 0.28
41 0.3
42 0.35
43 0.39
44 0.41
45 0.41
46 0.41
47 0.36
48 0.36
49 0.32
50 0.25
51 0.27
52 0.27
53 0.26
54 0.26
55 0.29
56 0.31
57 0.3
58 0.35
59 0.34
60 0.39
61 0.44
62 0.46
63 0.51
64 0.49
65 0.52
66 0.47
67 0.44
68 0.34
69 0.37
70 0.35
71 0.29
72 0.28
73 0.26
74 0.27
75 0.24
76 0.24
77 0.23
78 0.24
79 0.25
80 0.3
81 0.31
82 0.3
83 0.34
84 0.33
85 0.26
86 0.25
87 0.23
88 0.19
89 0.21
90 0.25
91 0.27
92 0.31
93 0.33
94 0.34
95 0.37
96 0.38
97 0.35
98 0.37
99 0.4
100 0.4
101 0.44
102 0.47
103 0.47
104 0.48
105 0.48
106 0.42
107 0.34
108 0.34
109 0.3
110 0.27
111 0.28
112 0.25
113 0.25
114 0.25
115 0.23
116 0.19
117 0.18
118 0.15
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.08
151 0.12
152 0.16
153 0.2
154 0.28
155 0.29
156 0.31
157 0.3
158 0.3
159 0.25
160 0.23
161 0.23
162 0.16
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.17
169 0.12
170 0.12
171 0.14
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.14
194 0.22
195 0.26
196 0.26
197 0.3
198 0.31
199 0.3
200 0.3
201 0.29
202 0.25
203 0.26
204 0.26
205 0.25
206 0.26
207 0.25
208 0.28
209 0.27
210 0.33
211 0.35
212 0.43
213 0.45
214 0.52
215 0.57
216 0.61
217 0.63
218 0.64
219 0.64
220 0.65
221 0.69
222 0.64
223 0.62
224 0.59
225 0.59
226 0.55
227 0.52
228 0.44
229 0.37
230 0.32
231 0.3
232 0.24
233 0.21
234 0.17
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.15
241 0.22
242 0.25
243 0.3
244 0.34
245 0.44
246 0.52
247 0.58