FuNGI

A0A1X2HJK8

Protein Details

Accession

A0A1X2HJK8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-29	RQAGRLHKTSRRLWRQYPSPWAA	Hydrophilic
1016-1045	DGSLAKKEKVRTKARGKKRTHAFSARNPSS	Hydrophilic
1259-1282	MDEEEKSKKKTPSRRYVHTWDDLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1021-1035	KKEKVRTKARGKKRT

Subcellular Location(s)

mito 25.5, cyto_mito 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MSLALARQAGRLHKTSRRLWRQYPSPWAAHARSPLSLPFLRTNATAAHASVQEEDHRDLFETLADEQSRKNPIILPNPALDSFRLTARVLPSNVAEQFAILNACIQSGAMDRAERIMQEMYKSKNEEMRVFLDIHIYNSFLNGFASATQPLNKQCLMWYDGMRKYGLTANADTYAIVIKTFIRSGSYHTARATLNEMRQNNIDLQQMMESIFLSDKDMPMFRKLVEEGMRGTNAQSQQALQELDAIIAKQQGEEPVAPRMVPTAQLDLEPMEDLPEARSTGTVGVKFLQEQLDSLRDFDKVQKSDPYELQRELEQQGYDVALQRLLHMKESSAERGDKLAAMNLSPLRQIMWDWHQQTVPLIREEVERVKNLSIKEAERQPHTALLQVLPPEKLAMITMLELLRLHNSSGIADGMKTARAVIDVGKAVEMEYNAVQMKRSGKSVARNNQELHSLFSSGKLFNMAVRKVYEKQAASQASLSPMVESAEGDTGMHGDGLNWVPVWPSATRAKVGGILTSIFIESAKIPQRSWDPETGEKIMEAIPAFFHTYQYVKGKRVGVIKFSEPLTNLLSREPVRETLHPRLLPMIVHPQPWIRHDSGGYLSAKSSCMRIKDSPEQLLYLDKACKEGKLTTVLAGLDVLGSTKWRVNKKVFKTILEVWNEGEALASIPRAIEHKAELPEKPPNFDTDPKAKFRWVTEVKAIQTKEKNEHSIRCDVNYKVETARRFLNLPMYFPHNMDFRGRAYPIPSTLNHLGSDLCRGLLHFDVAKPLGAKGWEWLQIHLANLYGYDKFSFTERREFTVKNMDNILDSVDNPLGGKRWWLEAENPWQCLAACHEVAEAWRSGKPEEFMSRIPVHQDGTCNGLQHYAALGGDLAGAQAVNLAPGDRPADVYTGVADLVNKIVEKEAAEGEEIAQLLKGKISRKVVKQTVMTNVYGVTFIGARAQIENRLRERGDIPQDKVYICAGYLAKKVFASLGEMFNGARKIQDWLTDSARRIARSVPVEALEEAGILPSEDGSLAKKEKVRTKARGKKRTHAFSARNPSSNQQTSVIWTTPLGLPIVQPYRRSGKKQVATLLQTVFIEDPAAARPVNAIKQSTAFPPNFIHSLDASHMLMTALACQKEGLTFASVHDSYWTHACDVDEMNKVIRDQFIELHKQPIMENLMQEFKVRYRDFKVPVMKDMKGGESKPVGVDEEEALTPKLGFNKNEAAHAGANTLEEKTGDERDAMDVLFGLGPNAAAVDAEDDVHDEVEDQAETMDEEEKSKKKTPSRRYVHTWDDLDFLPLPEKGEFDINQVKESNYFFH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.59
3	0.66
4	0.71
5	0.75
6	0.78
7	0.81
8	0.82
9	0.82
10	0.84
11	0.79
12	0.71
13	0.67
14	0.66
15	0.59
16	0.55
17	0.54
18	0.46
19	0.41
20	0.4
21	0.37
22	0.36
23	0.35
24	0.34
25	0.33
26	0.32
27	0.33
28	0.31
29	0.31
30	0.26
31	0.27
32	0.23
33	0.19
34	0.2
35	0.2
36	0.2
37	0.2
38	0.2
39	0.21
40	0.23
41	0.25
42	0.23
43	0.22
44	0.23
45	0.22
46	0.2
47	0.18
48	0.16
49	0.15
50	0.2
51	0.2
52	0.19
53	0.21
54	0.26
55	0.3
56	0.29
57	0.29
58	0.29
59	0.35
60	0.44
61	0.48
62	0.45
63	0.43
64	0.46
65	0.45
66	0.41
67	0.34
68	0.3
69	0.25
70	0.23
71	0.23
72	0.2
73	0.23
74	0.27
75	0.33
76	0.29
77	0.29
78	0.29
79	0.32
80	0.32
81	0.3
82	0.25
83	0.18
84	0.17
85	0.17
86	0.15
87	0.09
88	0.11
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.08
93	0.08
94	0.1
95	0.13
96	0.12
97	0.13
98	0.13
99	0.16
100	0.17
101	0.16
102	0.16
103	0.18
104	0.17
105	0.22
106	0.28
107	0.3
108	0.35
109	0.39
110	0.4
111	0.41
112	0.45
113	0.43
114	0.42
115	0.4
116	0.37
117	0.34
118	0.31
119	0.32
120	0.28
121	0.26
122	0.22
123	0.2
124	0.17
125	0.17
126	0.17
127	0.11
128	0.1
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.1
133	0.11
134	0.13
135	0.15
136	0.19
137	0.21
138	0.25
139	0.25
140	0.23
141	0.23
142	0.26
143	0.27
144	0.28
145	0.3
146	0.35
147	0.38
148	0.39
149	0.37
150	0.33
151	0.31
152	0.32
153	0.31
154	0.26
155	0.24
156	0.25
157	0.26
158	0.26
159	0.24
160	0.19
161	0.17
162	0.13
163	0.11
164	0.09
165	0.09
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.13
170	0.13
171	0.2
172	0.29
173	0.32
174	0.32
175	0.32
176	0.36
177	0.33
178	0.35
179	0.34
180	0.29
181	0.32
182	0.37
183	0.37
184	0.36
185	0.37
186	0.38
187	0.35
188	0.32
189	0.29
190	0.21
191	0.22
192	0.19
193	0.18
194	0.16
195	0.14
196	0.1
197	0.08
198	0.09
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.12
203	0.14
204	0.17
205	0.18
206	0.21
207	0.23
208	0.2
209	0.23
210	0.23
211	0.27
212	0.28
213	0.27
214	0.27
215	0.28
216	0.29
217	0.25
218	0.25
219	0.24
220	0.22
221	0.22
222	0.19
223	0.17
224	0.17
225	0.2
226	0.19
227	0.14
228	0.15
229	0.13
230	0.13
231	0.13
232	0.12
233	0.09
234	0.11
235	0.11
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.13
240	0.15
241	0.16
242	0.18
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.17
247	0.15
248	0.16
249	0.17
250	0.16
251	0.16
252	0.16
253	0.17
254	0.15
255	0.15
256	0.13
257	0.1
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.09
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.12
268	0.16
269	0.15
270	0.14
271	0.15
272	0.16
273	0.16
274	0.18
275	0.16
276	0.13
277	0.13
278	0.15
279	0.18
280	0.17
281	0.18
282	0.17
283	0.15
284	0.16
285	0.23
286	0.28
287	0.26
288	0.29
289	0.34
290	0.37
291	0.41
292	0.46
293	0.46
294	0.42
295	0.42
296	0.41
297	0.37
298	0.36
299	0.32
300	0.29
301	0.22
302	0.18
303	0.17
304	0.16
305	0.14
306	0.14
307	0.13
308	0.12
309	0.12
310	0.13
311	0.18
312	0.18
313	0.21
314	0.18
315	0.18
316	0.2
317	0.24
318	0.26
319	0.23
320	0.24
321	0.21
322	0.23
323	0.23
324	0.2
325	0.17
326	0.17
327	0.13
328	0.12
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.13
338	0.17
339	0.24
340	0.25
341	0.27
342	0.27
343	0.27
344	0.29
345	0.3
346	0.27
347	0.2
348	0.19
349	0.18
350	0.19
351	0.22
352	0.26
353	0.23
354	0.22
355	0.23
356	0.25
357	0.27
358	0.26
359	0.28
360	0.26
361	0.24
362	0.29
363	0.34
364	0.35
365	0.35
366	0.38
367	0.34
368	0.34
369	0.32
370	0.29
371	0.24
372	0.21
373	0.2
374	0.2
375	0.2
376	0.16
377	0.16
378	0.13
379	0.12
380	0.11
381	0.09
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.08
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.08
399	0.07
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.09
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.09
415	0.1
416	0.09
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.12
424	0.16
425	0.16
426	0.18
427	0.2
428	0.22
429	0.31
430	0.4
431	0.46
432	0.48
433	0.51
434	0.51
435	0.49
436	0.5
437	0.42
438	0.36
439	0.28
440	0.24
441	0.19
442	0.2
443	0.2
444	0.16
445	0.15
446	0.13
447	0.12
448	0.13
449	0.19
450	0.17
451	0.17
452	0.18
453	0.22
454	0.23
455	0.27
456	0.3
457	0.25
458	0.26
459	0.32
460	0.31
461	0.29
462	0.27
463	0.24
464	0.2
465	0.2
466	0.18
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.09
490	0.07
491	0.1
492	0.14
493	0.15
494	0.16
495	0.16
496	0.16
497	0.18
498	0.18
499	0.15
500	0.12
501	0.11
502	0.11
503	0.11
504	0.1
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.1
510	0.16
511	0.16
512	0.16
513	0.2
514	0.24
515	0.29
516	0.32
517	0.32
518	0.3
519	0.33
520	0.36
521	0.35
522	0.31
523	0.25
524	0.22
525	0.18
526	0.15
527	0.11
528	0.08
529	0.06
530	0.07
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.13
537	0.2
538	0.22
539	0.22
540	0.26
541	0.28
542	0.3
543	0.36
544	0.34
545	0.31
546	0.31
547	0.3
548	0.28
549	0.27
550	0.25
551	0.19
552	0.19
553	0.18
554	0.16
555	0.15
556	0.13
557	0.16
558	0.15
559	0.16
560	0.16
561	0.17
562	0.18
563	0.22
564	0.28
565	0.31
566	0.37
567	0.35
568	0.34
569	0.32
570	0.29
571	0.25
572	0.21
573	0.23
574	0.18
575	0.19
576	0.19
577	0.21
578	0.22
579	0.24
580	0.26
581	0.19
582	0.18
583	0.18
584	0.19
585	0.17
586	0.2
587	0.19
588	0.15
589	0.14
590	0.13
591	0.14
592	0.13
593	0.14
594	0.12
595	0.13
596	0.17
597	0.19
598	0.25
599	0.32
600	0.35
601	0.35
602	0.33
603	0.32
604	0.28
605	0.27
606	0.21
607	0.16
608	0.14
609	0.11
610	0.14
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.14
615	0.14
616	0.17
617	0.17
618	0.14
619	0.15
620	0.15
621	0.13
622	0.12
623	0.09
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.03
628	0.03
629	0.04
630	0.06
631	0.11
632	0.15
633	0.2
634	0.28
635	0.37
636	0.42
637	0.52
638	0.52
639	0.49
640	0.5
641	0.51
642	0.49
643	0.42
644	0.37
645	0.27
646	0.26
647	0.24
648	0.19
649	0.13
650	0.07
651	0.05
652	0.04
653	0.04
654	0.03
655	0.03
656	0.04
657	0.05
658	0.06
659	0.06
660	0.07
661	0.11
662	0.15
663	0.16
664	0.17
665	0.19
666	0.25
667	0.25
668	0.26
669	0.23
670	0.23
671	0.25
672	0.28
673	0.29
674	0.31
675	0.34
676	0.36
677	0.36
678	0.34
679	0.33
680	0.3
681	0.36
682	0.31
683	0.3
684	0.32
685	0.34
686	0.34
687	0.38
688	0.37
689	0.32
690	0.32
691	0.32
692	0.33
693	0.32
694	0.37
695	0.35
696	0.4
697	0.38
698	0.41
699	0.39
700	0.36
701	0.36
702	0.3
703	0.32
704	0.28
705	0.26
706	0.22
707	0.25
708	0.24
709	0.22
710	0.24
711	0.2
712	0.2
713	0.2
714	0.25
715	0.22
716	0.22
717	0.21
718	0.24
719	0.23
720	0.23
721	0.24
722	0.17
723	0.17
724	0.17
725	0.18
726	0.15
727	0.16
728	0.17
729	0.16
730	0.16
731	0.16
732	0.17
733	0.18
734	0.17
735	0.2
736	0.22
737	0.23
738	0.21
739	0.2
740	0.18
741	0.16
742	0.18
743	0.12
744	0.09
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.1
750	0.08
751	0.08
752	0.1
753	0.1
754	0.11
755	0.1
756	0.09
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.08
761	0.11
762	0.16
763	0.16
764	0.16
765	0.18
766	0.18
767	0.18
768	0.17
769	0.15
770	0.09
771	0.08
772	0.09
773	0.07
774	0.07
775	0.07
776	0.07
777	0.07
778	0.1
779	0.14
780	0.16
781	0.24
782	0.25
783	0.29
784	0.32
785	0.32
786	0.33
787	0.39
788	0.38
789	0.31
790	0.31
791	0.27
792	0.24
793	0.23
794	0.22
795	0.11
796	0.1
797	0.1
798	0.09
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.07
804	0.09
805	0.08
806	0.1
807	0.12
808	0.13
809	0.16
810	0.2
811	0.3
812	0.32
813	0.32
814	0.29
815	0.28
816	0.27
817	0.25
818	0.23
819	0.17
820	0.14
821	0.13
822	0.13
823	0.13
824	0.13
825	0.14
826	0.11
827	0.09
828	0.1
829	0.11
830	0.12
831	0.13
832	0.14
833	0.16
834	0.19
835	0.21
836	0.2
837	0.24
838	0.25
839	0.24
840	0.25
841	0.22
842	0.21
843	0.19
844	0.2
845	0.15
846	0.19
847	0.19
848	0.18
849	0.16
850	0.16
851	0.14
852	0.12
853	0.12
854	0.08
855	0.07
856	0.06
857	0.06
858	0.04
859	0.04
860	0.04
861	0.03
862	0.03
863	0.03
864	0.02
865	0.03
866	0.03
867	0.03
868	0.03
869	0.04
870	0.04
871	0.05
872	0.07
873	0.06
874	0.08
875	0.08
876	0.1
877	0.09
878	0.1
879	0.09
880	0.08
881	0.08
882	0.07
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.06
890	0.07
891	0.07
892	0.09
893	0.09
894	0.09
895	0.09
896	0.09
897	0.09
898	0.1
899	0.09
900	0.07
901	0.07
902	0.07
903	0.07
904	0.09
905	0.11
906	0.12
907	0.18
908	0.26
909	0.33
910	0.39
911	0.48
912	0.52
913	0.54
914	0.56
915	0.54
916	0.54
917	0.51
918	0.44
919	0.35
920	0.3
921	0.24
922	0.21
923	0.17
924	0.09
925	0.06
926	0.05
927	0.07
928	0.07
929	0.07
930	0.09
931	0.1
932	0.16
933	0.2
934	0.26
935	0.27
936	0.31
937	0.31
938	0.32
939	0.32
940	0.33
941	0.39
942	0.4
943	0.41
944	0.41
945	0.43
946	0.4
947	0.4
948	0.33
949	0.23
950	0.17
951	0.18
952	0.14
953	0.15
954	0.18
955	0.18
956	0.18
957	0.18
958	0.18
959	0.14
960	0.14
961	0.16
962	0.15
963	0.15
964	0.15
965	0.15
966	0.15
967	0.17
968	0.18
969	0.13
970	0.11
971	0.1
972	0.13
973	0.14
974	0.19
975	0.19
976	0.22
977	0.28
978	0.32
979	0.33
980	0.36
981	0.38
982	0.34
983	0.32
984	0.3
985	0.31
986	0.3
987	0.31
988	0.26
989	0.24
990	0.25
991	0.24
992	0.22
993	0.16
994	0.12
995	0.1
996	0.08
997	0.07
998	0.05
999	0.05
1000	0.04
1001	0.04
1002	0.04
1003	0.04
1004	0.06
1005	0.1
1006	0.12
1007	0.16
1008	0.2
1009	0.27
1010	0.35
1011	0.44
1012	0.51
1013	0.58
1014	0.67
1015	0.74
1016	0.81
1017	0.85
1018	0.84
1019	0.84
1020	0.85
1021	0.84
1022	0.82
1023	0.81
1024	0.77
1025	0.77
1026	0.81
1027	0.76
1028	0.7
1029	0.63
1030	0.58
1031	0.57
1032	0.53
1033	0.46
1034	0.37
1035	0.32
1036	0.33
1037	0.35
1038	0.32
1039	0.23
1040	0.19
1041	0.19
1042	0.18
1043	0.19
1044	0.15
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.17
1048	0.24
1049	0.24
1050	0.25
1051	0.28
1052	0.37
1053	0.42
1054	0.48
1055	0.5
1056	0.53
1057	0.57
1058	0.61
1059	0.64
1060	0.62
1061	0.6
1062	0.58
1063	0.5
1064	0.41
1065	0.35
1066	0.31
1067	0.24
1068	0.16
1069	0.13
1070	0.09
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.1
1074	0.09
1075	0.08
1076	0.11
1077	0.14
1078	0.19
1079	0.21
1080	0.21
1081	0.21
1082	0.23
1083	0.25
1084	0.28
1085	0.32
1086	0.27
1087	0.27
1088	0.27
1089	0.3
1090	0.29
1091	0.28
1092	0.25
1093	0.18
1094	0.2
1095	0.2
1096	0.2
1097	0.17
1098	0.15
1099	0.14
1100	0.12
1101	0.12
1102	0.1
1103	0.13
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.15
1107	0.15
1108	0.15
1109	0.15
1110	0.16
1111	0.13
1112	0.11
1113	0.11
1114	0.12
1115	0.19
1116	0.19
1117	0.18
1118	0.19
1119	0.18
1120	0.18
1121	0.22
1122	0.22
1123	0.15
1124	0.17
1125	0.18
1126	0.18
1127	0.2
1128	0.23
1129	0.23
1130	0.23
1131	0.24
1132	0.24
1133	0.25
1134	0.24
1135	0.23
1136	0.2
1137	0.18
1138	0.22
1139	0.26
1140	0.32
1141	0.33
1142	0.36
1143	0.35
1144	0.34
1145	0.32
1146	0.33
1147	0.33
1148	0.26
1149	0.27
1150	0.25
1151	0.28
1152	0.28
1153	0.29
1154	0.25
1155	0.23
1156	0.31
1157	0.3
1158	0.32
1159	0.34
1160	0.42
1161	0.46
1162	0.52
1163	0.59
1164	0.52
1165	0.59
1166	0.6
1167	0.55
1168	0.5
1169	0.48
1170	0.45
1171	0.41
1172	0.38
1173	0.35
1174	0.32
1175	0.33
1176	0.3
1177	0.29
1178	0.25
1179	0.2
1180	0.21
1181	0.16
1182	0.17
1183	0.16
1184	0.16
1185	0.15
1186	0.14
1187	0.13
1188	0.14
1189	0.2
1190	0.23
1191	0.24
1192	0.27
1193	0.36
1194	0.36
1195	0.39
1196	0.38
1197	0.34
1198	0.31
1199	0.3
1200	0.26
1201	0.17
1202	0.17
1203	0.15
1204	0.14
1205	0.11
1206	0.1
1207	0.12
1208	0.14
1209	0.16
1210	0.16
1211	0.16
1212	0.16
1213	0.18
1214	0.19
1215	0.17
1216	0.13
1217	0.11
1218	0.11
1219	0.11
1220	0.1
1221	0.08
1222	0.07
1223	0.07
1224	0.06
1225	0.06
1226	0.05
1227	0.04
1228	0.04
1229	0.06
1230	0.06
1231	0.07
1232	0.07
1233	0.08
1234	0.09
1235	0.09
1236	0.09
1237	0.08
1238	0.08
1239	0.09
1240	0.09
1241	0.08
1242	0.07
1243	0.07
1244	0.08
1245	0.08
1246	0.11
1247	0.1
1248	0.13
1249	0.19
1250	0.24
1251	0.3
1252	0.38
1253	0.45
1254	0.51
1255	0.62
1256	0.7
1257	0.74
1258	0.79
1259	0.82
1260	0.84
1261	0.85
1262	0.83
1263	0.81
1264	0.73
1265	0.63
1266	0.57
1267	0.49
1268	0.43
1269	0.35
1270	0.28
1271	0.22
1272	0.2
1273	0.21
1274	0.18
1275	0.18
1276	0.17
1277	0.21
1278	0.21
1279	0.25
1280	0.33
1281	0.31
1282	0.34
1283	0.34
1284	0.33
1285	0.31

A0A1X2HJK8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer