Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HCY6

Protein Details
Accession A0A1X2HCY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-320QRHYHRRKLLHEYKNESRRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-167RKRKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 15, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSNNKTEVGLSGVPVTTTEDDITDEFPHIHADQYVLIQLPSGNIKLINIKPNTQVNLGKFGTFQTDNLIGKPFGLSYEIYDQKGNIRPCRNLALFAVEDTGANNQMIKDDTAVQKMSYEEVEKLKQEGLKGNIPHEEIIQKIVASHTEFDKKTEFSKAKYIERKRKKFMKVFTPVRPTLYSIANHFFVRNPDKIKFLRMDTLSQLLSLANAHANSKFLVVDDTQGLIVSALAERMGGHGRILAITENETHNYDVLRYLNLSKDVLNVVRTVPMSKVDEDVPFDKWVDKPEEEVAAMDEYGQRHYHRRKLLHEYKNESRRLLYEGGYDGYEWKDDLLCVTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.14
4 0.15
5 0.15
6 0.13
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.16
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.19
33 0.23
34 0.3
35 0.3
36 0.32
37 0.37
38 0.43
39 0.45
40 0.42
41 0.43
42 0.37
43 0.42
44 0.4
45 0.35
46 0.29
47 0.27
48 0.28
49 0.24
50 0.22
51 0.18
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.26
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.15
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.19
65 0.21
66 0.22
67 0.23
68 0.22
69 0.26
70 0.33
71 0.35
72 0.35
73 0.38
74 0.39
75 0.42
76 0.5
77 0.45
78 0.4
79 0.35
80 0.32
81 0.27
82 0.25
83 0.22
84 0.15
85 0.14
86 0.12
87 0.12
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.12
97 0.14
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.15
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.21
115 0.22
116 0.25
117 0.26
118 0.26
119 0.27
120 0.26
121 0.25
122 0.21
123 0.18
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.16
135 0.17
136 0.18
137 0.2
138 0.19
139 0.2
140 0.27
141 0.26
142 0.22
143 0.3
144 0.33
145 0.38
146 0.47
147 0.55
148 0.58
149 0.67
150 0.73
151 0.73
152 0.78
153 0.79
154 0.76
155 0.73
156 0.73
157 0.72
158 0.71
159 0.7
160 0.68
161 0.6
162 0.55
163 0.49
164 0.41
165 0.33
166 0.29
167 0.23
168 0.19
169 0.21
170 0.2
171 0.19
172 0.18
173 0.16
174 0.18
175 0.22
176 0.22
177 0.24
178 0.23
179 0.28
180 0.29
181 0.31
182 0.29
183 0.26
184 0.29
185 0.27
186 0.28
187 0.24
188 0.26
189 0.22
190 0.19
191 0.18
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.16
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.14
259 0.17
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.2
264 0.21
265 0.24
266 0.25
267 0.23
268 0.21
269 0.21
270 0.21
271 0.21
272 0.24
273 0.26
274 0.25
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.26
279 0.25
280 0.21
281 0.16
282 0.16
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.14
287 0.16
288 0.17
289 0.25
290 0.34
291 0.41
292 0.48
293 0.54
294 0.59
295 0.68
296 0.77
297 0.76
298 0.78
299 0.78
300 0.8
301 0.82
302 0.77
303 0.68
304 0.6
305 0.53
306 0.49
307 0.43
308 0.34
309 0.29
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.23
314 0.2
315 0.18
316 0.17
317 0.14
318 0.12
319 0.12
320 0.11