Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HJB0

Protein Details
Accession A0A1X2HJB0    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-331DREAEHYSRKTRRHDDYPRRSRSRSPRRRYYDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-246GR
248-248R
251-258RRHSDRER
317-327PRRSRSRSPRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MEFQKAMLEELMSQYVDVDNKDFWDDSVCKHYLVAFCPSQLFTNTKSDLGPCDKIHNDRLKEKYMNAPDKHKYHFEADFYDYLNRLVQELQSRIQKCKSRLNIQEDDKLAEQRKEEREERMVLIDVKIKEMLQRAEEAGEEGRVQEAANLTEEVEKLQTELSQLKENLDANDKSEKRMEVCQVCGAFLVTNDSSDRLEAHYQGKQHQGYLKIRDTLEEMKQARPQGRDRDYTRARFDYRDRRGGGRDRDYRRHSDRERGGYRERNDYGRRSSRDRRSGSAGGSISASNGGGGGGNDDDWDREAEHYSRKTRRHDDYPRRSRSRSPRRRYYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.2
12 0.2
13 0.21
14 0.28
15 0.28
16 0.25
17 0.25
18 0.29
19 0.26
20 0.27
21 0.3
22 0.24
23 0.24
24 0.26
25 0.27
26 0.25
27 0.25
28 0.24
29 0.21
30 0.28
31 0.28
32 0.27
33 0.27
34 0.27
35 0.3
36 0.33
37 0.34
38 0.28
39 0.34
40 0.37
41 0.4
42 0.48
43 0.51
44 0.5
45 0.53
46 0.57
47 0.58
48 0.56
49 0.55
50 0.55
51 0.56
52 0.6
53 0.56
54 0.59
55 0.59
56 0.61
57 0.62
58 0.57
59 0.5
60 0.46
61 0.46
62 0.4
63 0.37
64 0.36
65 0.33
66 0.3
67 0.28
68 0.24
69 0.21
70 0.2
71 0.16
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.17
76 0.19
77 0.22
78 0.28
79 0.3
80 0.33
81 0.39
82 0.43
83 0.43
84 0.5
85 0.54
86 0.56
87 0.62
88 0.67
89 0.68
90 0.66
91 0.67
92 0.59
93 0.53
94 0.45
95 0.41
96 0.36
97 0.29
98 0.27
99 0.28
100 0.32
101 0.36
102 0.36
103 0.36
104 0.38
105 0.38
106 0.37
107 0.32
108 0.28
109 0.22
110 0.21
111 0.22
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.15
117 0.18
118 0.18
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.09
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.16
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.24
159 0.23
160 0.23
161 0.24
162 0.23
163 0.21
164 0.24
165 0.28
166 0.21
167 0.23
168 0.24
169 0.22
170 0.22
171 0.2
172 0.17
173 0.11
174 0.09
175 0.11
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.21
190 0.27
191 0.25
192 0.26
193 0.27
194 0.31
195 0.34
196 0.39
197 0.39
198 0.36
199 0.36
200 0.35
201 0.35
202 0.32
203 0.29
204 0.3
205 0.29
206 0.28
207 0.31
208 0.34
209 0.35
210 0.35
211 0.39
212 0.41
213 0.45
214 0.5
215 0.5
216 0.56
217 0.59
218 0.6
219 0.6
220 0.56
221 0.53
222 0.5
223 0.55
224 0.56
225 0.56
226 0.58
227 0.55
228 0.52
229 0.57
230 0.61
231 0.61
232 0.6
233 0.62
234 0.62
235 0.68
236 0.7
237 0.72
238 0.7
239 0.72
240 0.66
241 0.67
242 0.68
243 0.69
244 0.68
245 0.66
246 0.68
247 0.66
248 0.65
249 0.63
250 0.58
251 0.56
252 0.56
253 0.55
254 0.56
255 0.57
256 0.59
257 0.59
258 0.66
259 0.69
260 0.73
261 0.72
262 0.68
263 0.66
264 0.65
265 0.58
266 0.55
267 0.45
268 0.36
269 0.32
270 0.27
271 0.2
272 0.16
273 0.14
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.15
290 0.18
291 0.25
292 0.32
293 0.4
294 0.47
295 0.53
296 0.62
297 0.67
298 0.73
299 0.76
300 0.8
301 0.82
302 0.86
303 0.89
304 0.9
305 0.89
306 0.84
307 0.83
308 0.84
309 0.84
310 0.83
311 0.83