Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HVD5

Protein Details
Accession A0A1X2HVD5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-253ALASKSKKSSKKSSKKSSSKRKKLQSKAAFTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-245KSKKSSKKSSKKSSSKRKKL
Subcellular Location(s) extr 19, cyto 3.5, cyto_nucl 2.5, mito 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001387  Cro/C1-type_HTH  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50943  HTH_CROC1  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MLLQQAVSLVAIGLLALTSSRVHAEPLSIVHGLEGEKIAVSANYLAAFDADDAPEAPFELVEGDNVSSKLISLKKRGTSCSEYHTATSSDTCIKIAKKYDISLSDFYDMNSQVNSKCGNLHNGKKYCVKEGSSSSSGSSSSSSGSCAKKHTVTSSDTCVGLAKKYGISLDEFYELNPKVHKGSCDNLDDGKKYCVKGGSSSSNDNDDDDDDVSASVSGKVTALASKSKKSSKKSSKKSSSKRKKLQSKAAFTYYWIAQQNDYKGGSKVAIKTCGGKTIAKVSEKYADALVMEGTGVVNDKIVNLGGCSCSNYKCFEEISRKEEPYGITAYGSALRPYITLAANDFDKGTKLYVPALVGWKIPNSNKKHNGCLLVDDQSWSFSSHHIDFYVYAESNYEKLDKAHRVNKVDIYEGGDCKLLNYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.03
3 0.03
4 0.04
5 0.05
6 0.06
7 0.09
8 0.09
9 0.11
10 0.12
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.19
15 0.17
16 0.16
17 0.15
18 0.16
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.07
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.1
43 0.08
44 0.06
45 0.06
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.14
57 0.19
58 0.23
59 0.29
60 0.36
61 0.43
62 0.47
63 0.51
64 0.53
65 0.54
66 0.51
67 0.51
68 0.49
69 0.44
70 0.41
71 0.39
72 0.32
73 0.27
74 0.25
75 0.21
76 0.2
77 0.18
78 0.18
79 0.2
80 0.2
81 0.24
82 0.28
83 0.32
84 0.32
85 0.33
86 0.38
87 0.38
88 0.42
89 0.39
90 0.36
91 0.31
92 0.28
93 0.27
94 0.25
95 0.21
96 0.17
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.15
101 0.16
102 0.12
103 0.16
104 0.18
105 0.25
106 0.31
107 0.39
108 0.46
109 0.49
110 0.52
111 0.55
112 0.55
113 0.53
114 0.5
115 0.44
116 0.39
117 0.4
118 0.43
119 0.38
120 0.37
121 0.31
122 0.28
123 0.26
124 0.21
125 0.18
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.24
135 0.26
136 0.28
137 0.3
138 0.28
139 0.3
140 0.32
141 0.33
142 0.32
143 0.28
144 0.27
145 0.25
146 0.21
147 0.17
148 0.15
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.19
168 0.17
169 0.21
170 0.24
171 0.26
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.25
178 0.23
179 0.21
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.2
184 0.23
185 0.26
186 0.26
187 0.29
188 0.28
189 0.28
190 0.27
191 0.25
192 0.2
193 0.14
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.12
211 0.14
212 0.17
213 0.21
214 0.28
215 0.34
216 0.39
217 0.49
218 0.55
219 0.64
220 0.71
221 0.79
222 0.82
223 0.87
224 0.91
225 0.92
226 0.92
227 0.92
228 0.91
229 0.9
230 0.9
231 0.88
232 0.89
233 0.87
234 0.83
235 0.77
236 0.72
237 0.62
238 0.52
239 0.46
240 0.36
241 0.31
242 0.26
243 0.21
244 0.19
245 0.22
246 0.23
247 0.23
248 0.24
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.22
255 0.22
256 0.24
257 0.23
258 0.28
259 0.27
260 0.31
261 0.29
262 0.25
263 0.23
264 0.28
265 0.32
266 0.3
267 0.3
268 0.28
269 0.31
270 0.31
271 0.31
272 0.22
273 0.18
274 0.15
275 0.15
276 0.12
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.16
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.22
302 0.26
303 0.34
304 0.37
305 0.4
306 0.43
307 0.42
308 0.41
309 0.42
310 0.36
311 0.3
312 0.28
313 0.23
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.14
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.16
340 0.16
341 0.18
342 0.21
343 0.21
344 0.2
345 0.2
346 0.21
347 0.25
348 0.3
349 0.36
350 0.4
351 0.49
352 0.58
353 0.61
354 0.66
355 0.67
356 0.67
357 0.59
358 0.57
359 0.5
360 0.45
361 0.41
362 0.35
363 0.29
364 0.24
365 0.24
366 0.21
367 0.18
368 0.15
369 0.2
370 0.2
371 0.22
372 0.21
373 0.21
374 0.2
375 0.21
376 0.25
377 0.19
378 0.17
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.19
383 0.18
384 0.14
385 0.16
386 0.24
387 0.31
388 0.39
389 0.45
390 0.52
391 0.56
392 0.6
393 0.64
394 0.59
395 0.53
396 0.46
397 0.45
398 0.41
399 0.37
400 0.33
401 0.28
402 0.24