Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HGH0

Protein Details
Accession A0A1X2HGH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-401VYDESKKMRSKQLREARTRKAHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-400RSKQLREARTRKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, cyto 4.5, mito 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MPARRNTRKAREEDPEDLGGPAWINSLNRAIDDLTVNRTSVREEALSVLNTELTRHYAADILESRSEELLTLLRRSVSKGGKEAHLAAQAIALHFVNQGDLSLGDQEDLFQQVLPLLRKTVKNTDDTTLQSICLRTLALITLIAASDIDAQLARDFVYDVLEEIDDYQVQCAALHAYGLLCVSSFSQPAMDPDIIHEEIEKVMPVHEILLESTDMAVRVAAGENTALLFELLRTHTGHPEDEEDQDEEVQDVPEEYDNMDGLIHTLKELSVDSNRRRNKADRAEQKSVFRDIVRSVEERDPPVQELKIGGRVIQFRGWAKILTLNAFRQSIGQGLQYHLRANELMHQIFNYKSGYAAADSDDDSDGWNAGELSKADKRYVYDESKKMRSKQLREARTRKAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.6
3 0.51
4 0.45
5 0.37
6 0.28
7 0.21
8 0.16
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.12
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.21
26 0.21
27 0.19
28 0.2
29 0.15
30 0.15
31 0.18
32 0.21
33 0.21
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.16
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.15
46 0.2
47 0.22
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.23
52 0.21
53 0.21
54 0.15
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.17
62 0.2
63 0.27
64 0.29
65 0.31
66 0.35
67 0.38
68 0.38
69 0.41
70 0.4
71 0.36
72 0.33
73 0.3
74 0.24
75 0.22
76 0.2
77 0.17
78 0.16
79 0.12
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.15
104 0.19
105 0.22
106 0.26
107 0.34
108 0.33
109 0.36
110 0.38
111 0.38
112 0.38
113 0.37
114 0.36
115 0.28
116 0.25
117 0.22
118 0.2
119 0.17
120 0.14
121 0.11
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.1
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.17
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.13
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.14
258 0.21
259 0.27
260 0.37
261 0.42
262 0.44
263 0.49
264 0.53
265 0.56
266 0.6
267 0.64
268 0.65
269 0.69
270 0.74
271 0.73
272 0.73
273 0.66
274 0.58
275 0.5
276 0.4
277 0.34
278 0.27
279 0.28
280 0.25
281 0.23
282 0.25
283 0.28
284 0.3
285 0.31
286 0.31
287 0.29
288 0.28
289 0.3
290 0.25
291 0.2
292 0.2
293 0.19
294 0.23
295 0.21
296 0.2
297 0.21
298 0.24
299 0.25
300 0.25
301 0.27
302 0.22
303 0.26
304 0.26
305 0.22
306 0.21
307 0.23
308 0.23
309 0.24
310 0.26
311 0.25
312 0.27
313 0.27
314 0.26
315 0.23
316 0.21
317 0.19
318 0.17
319 0.18
320 0.16
321 0.18
322 0.23
323 0.23
324 0.24
325 0.22
326 0.22
327 0.19
328 0.18
329 0.24
330 0.25
331 0.25
332 0.24
333 0.24
334 0.25
335 0.24
336 0.26
337 0.19
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.13
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.09
354 0.1
355 0.08
356 0.07
357 0.1
358 0.1
359 0.15
360 0.21
361 0.23
362 0.24
363 0.27
364 0.29
365 0.32
366 0.39
367 0.43
368 0.46
369 0.53
370 0.59
371 0.66
372 0.71
373 0.72
374 0.75
375 0.75
376 0.74
377 0.77
378 0.79
379 0.8
380 0.83
381 0.86